276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3583 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3583  acylphosphatase  100 
 
 		 99 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3091  acylphosphatase  72.45 
 
 		 99 aa  142  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.937205  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2369  acylphosphatase  67.35 
 
 		 99 aa  134  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631036  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3350  acylphosphatase  60.2 
 
 		 99 aa  122  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.200593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4900  putative acylphosphatase  57.73 
 
 		 100 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.164236 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1735  acylphosphatase  54.08 
 
 		 99 aa  107  6e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.100754 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2164  acylphosphatase  52.04 
 
 		 99 aa  106  9.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3149  acylphosphatase  50 
 
 		 96 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000748736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0085  acylphosphatase  57.83 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.49451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2947  acylphosphatase  48.72 
 
 		 96 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3795  acylphosphatase  50.54 
 
 		 96 aa  84.7  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.524231 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4771  acylphosphatase  55.41 
 
 		 99 aa  83.2  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000297446  normal  0.0367606 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2680  acylphosphatase  47.44 
 
 		 91 aa  82  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.174548  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2654  acylphosphatase  51.19 
 
 		 91 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.156555  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4069  acylphosphatase  48.24 
 
 		 92 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3370  hypothetical protein  61.11 
 
 		 95 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4481  acylphosphatase  50 
 
 		 101 aa  77.8  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1419  acylphosphatase  51.9 
 
 		 92 aa  76.6  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3186  acylphosphatase  45.83 
 
 		 93 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.341128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2746  acylphosphatase  57.14 
 
 		 94 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.352229  normal  0.313982 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2011  acylphosphatase  51.35 
 
 		 94 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2230  acylphosphatase  52.7 
 
 		 98 aa  75.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.595414 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1322  acylphosphatase  44.57 
 
 		 101 aa  75.5  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0315179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3223  acylphosphatase  45.56 
 
 		 94 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.237355  normal  0.7882 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3245  acylphosphatase  50.51 
 
 		 95 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2998  acylphosphatase  45.56 
 
 		 94 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.593748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0770  acylphosphatase  50 
 
 		 92 aa  73.9  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1216  acylphosphatase  44.44 
 
 		 93 aa  73.6  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1185  acylphosphatase  47.73 
 
 		 92 aa  72.4  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4329  acylphosphatase  46.07 
 
 		 92 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.41249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4198  acylphosphatase  47.95 
 
 		 94 aa  71.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0019532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0824  acylphosphatase  46.51 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0240  acylphosphatase  49.33 
 
 		 93 aa  71.2  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0311  acylphosphatase  50.67 
 
 		 93 aa  71.2  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.422172  normal  0.0299279 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3607  acylphosphatase  42.68 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0899906 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1158  acylphosphatase  41.49 
 
 		 94 aa  70.5  0.000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0933267  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0920  acylphosphatase  40 
 
 		 91 aa  70.5  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08420  cylphosphatase  44.59 
 
 		 95 aa  70.5  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1169  acylphosphatase  43.9 
 
 		 91 aa  70.5  0.000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1891  acylphosphatase  58.46 
 
 		 92 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1316  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0009  acylphosphatase  48.1 
 
 		 97 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0372  acylphosphatase  50.65 
 
 		 94 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.404855 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4152  acylphosphatase  45.45 
 
 		 97 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4711  acylphosphatase  46.67 
 
 		 97 aa  69.7  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6189  acylphosphatase  45.16 
 
 		 102 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1453  acylphosphatase  42.53 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1245  acylphosphatase  49.4 
 
 		 95 aa  68.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3568  acylphosphatase  56.25 
 
 		 95 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0520  acylphosphatase  50.67 
 
 		 95 aa  68.2  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.230918  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1796  acylphosphatase  48.65 
 
 		 92 aa  67.8  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.333863  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0042  acylphosphatase  46.75 
 
 		 90 aa  65.9  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2406  acylphosphatase  45.12 
 
 		 92 aa  65.1  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.31927  normal  0.925907 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2679  acylphosphatase  40.51 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1716  acylphosphatase  50 
 
 		 93 aa  64.7  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000101765  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1052  acylphosphatase  49.3 
 
 		 90 aa  64.3  0.0000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.424464  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0859  putative acylphosphatase  48.53 
 
 		 89 aa  64.3  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000124258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1977  acylphosphatase  48.61 
 
 		 95 aa  64.3  0.0000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.560432  normal  0.812753 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6207  acylphosphatase  39.24 
 
 		 91 aa  63.9  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0713  acylphosphatase  52.31 
 
 		 92 aa  63.5  0.0000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.527846  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2214  putative acylphosphatase  46.48 
 
 		 92 aa  63.5  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000119886  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0086  acylphosphatase  36.84 
 
 		 91 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.186616  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3279  acylphosphatase  44.59 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000800863 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0729  acylphosphatase  42.68 
 
 		 93 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7041  acylphosphatase  48.57 
 
 		 97 aa  62  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.925608  hitchhiker  0.000175796 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0730  acylphosphatase  42.68 
 
 		 93 aa  62  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0694  acylphosphatase  41.46 
 
 		 93 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.509759  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0023  acylphosphatase  48.57 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1865  acylphosphatase  36.36 
 
 		 100 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36780  acylphosphatase  49.35 
 
 		 91 aa  62  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1812  acylphosphatase  42.65 
 
 		 97 aa  61.2  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0889  acylphosphatase  42.86 
 
 		 91 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3184  acylphosphatase  41.3 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.678514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1427  acylphosphatase  41.57 
 
 		 97 aa  60.8  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223488  normal  0.163349 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0745  acylphosphatase  49.23 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.492264  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0787  acylphosphatase  38.38 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3085  acylphosphatase  41.56 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.842982 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2447  acylphosphatase  44 
 
 		 92 aa  60.1  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0219  putative acylphosphatase protein  40.66 
 
 		 119 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1584  acylphosphatase  49.28 
 
 		 108 aa  60.1  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1480  acylphosphatase  39.58 
 
 		 94 aa  60.1  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0319671  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1848  acylphosphatase  40.79 
 
 		 91 aa  60.1  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3029  acylphosphatase  47.3 
 
 		 90 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.14564  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1706  acylphosphatase  35.14 
 
 		 90 aa  60.1  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.531567  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3843  acylphosphatase  35.8 
 
 		 92 aa  60.1  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6574  acylphosphatase  46.15 
 
 		 97 aa  59.3  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1765  acylphosphatase  39.74 
 
 		 92 aa  59.7  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00140715  hitchhiker  0.00160768 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0496  acylphosphatase  47.89 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22230  acylphosphatase  46.38 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1853  acylphosphatase  40.79 
 
 		 91 aa  59.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0794  acylphosphatase  48.44 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.364443  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1449  acylphosphatase  31.65 
 
 		 89 aa  59.3  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000172052  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2149  acylphosphatase  40.24 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.054782  normal  0.385833 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1304  acylphosphatase  41.43 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000789837  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3443  acylphosphatase  41.33 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1869  acylphosphatase  43.08 
 
 		 90 aa  58.2  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1158  acylphosphatase  39.02 
 
 		 93 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.216126  normal  0.513068 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1124  acylphosphatase  39.02 
 
 		 93 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.8259399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1192  acylphosphatase  39.02 
 
 		 93 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1146  acylphosphatase  39.02 
 
 		 93 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137289  normal  0.225824 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1396  acylphosphatase  45.45 
 
 		 90 aa  58.2  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>