More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1328 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1328  acylphosphatase  100 
 
 		 91 aa  187  4e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161573  normal  0.572666 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2835  acylphosphatase  72.53 
 
 		 91 aa  137  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000760642  hitchhiker  0.000425949 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1809  acylphosphatase  68.18 
 
 		 95 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000689172  normal  0.0364693 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1728  acylphosphatase  61.11 
 
 		 90 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.352005  normal  0.358001 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2291  acylphosphatase  61.11 
 
 		 90 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0355652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2513  acylphosphatase  61.54 
 
 		 91 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000309341  normal  0.999326 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1950  acylphosphatase  61.54 
 
 		 97 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000103444  normal  0.209392 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2408  acylphosphatase  61.54 
 
 		 91 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000467903  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2397  acylphosphatase  61.54 
 
 		 91 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221356  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1628  acylphosphatase  56.82 
 
 		 89 aa  107  5e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000020913  normal  0.189828 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2160  acylphosphatase  60.44 
 
 		 91 aa  106  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290914  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1808  acylphosphatase  60 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1541  acylphosphatase  65.56 
 
 		 91 aa  105  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000112131  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2253  acylphosphatase  57.78 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4152  acylphosphatase  54.05 
 
 		 97 aa  80.1  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1796  acylphosphatase  46.51 
 
 		 92 aa  79  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.333863  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0009  acylphosphatase  52.7 
 
 		 97 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0770  acylphosphatase  43.02 
 
 		 92 aa  75.5  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0713  acylphosphatase  40 
 
 		 92 aa  74.7  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.527846  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1227  acylphosphatase  47.73 
 
 		 90 aa  74.7  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.130113  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0023  acylphosphatase  43.21 
 
 		 97 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1228  acylphosphatase  47.73 
 
 		 90 aa  74.7  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00087614  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0240  acylphosphatase  39.77 
 
 		 93 aa  74.7  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7041  acylphosphatase  43.21 
 
 		 97 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.925608  hitchhiker  0.000175796 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1427  acylphosphatase  38.64 
 
 		 97 aa  73.6  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223488  normal  0.163349 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0122  acylphosphatase  44.32 
 
 		 91 aa  72.4  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2406  acylphosphatase  47.37 
 
 		 92 aa  72.4  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.31927  normal  0.925907 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1158  acylphosphatase  41.57 
 
 		 94 aa  72.8  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0933267  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1183  acylphosphatase  41.11 
 
 		 92 aa  72  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.858645  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4125  acylphosphatase  40.74 
 
 		 98 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1192  acylphosphatase  47.56 
 
 		 93 aa  71.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1158  acylphosphatase  47.56 
 
 		 93 aa  71.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.216126  normal  0.513068 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1124  acylphosphatase  47.56 
 
 		 93 aa  71.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.8259399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1146  acylphosphatase  47.56 
 
 		 93 aa  71.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137289  normal  0.225824 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1041  acylphosphatase  47.56 
 
 		 93 aa  70.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.860635  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0703  acylphosphatase  45.68 
 
 		 92 aa  70.9  0.000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0824  acylphosphatase  44.74 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4771  acylphosphatase  50.7 
 
 		 99 aa  70.5  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000297446  normal  0.0367606 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1812  acylphosphatase  49.32 
 
 		 97 aa  70.5  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0099  acylphosphatase  42.7 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.643538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2447  acylphosphatase  46.05 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0311  acylphosphatase  39.77 
 
 		 93 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.422172  normal  0.0299279 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1977  acylphosphatase  47.13 
 
 		 95 aa  68.9  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.560432  normal  0.812753 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6574  acylphosphatase  43.24 
 
 		 97 aa  68.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4481  acylphosphatase  42.31 
 
 		 101 aa  68.2  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1869  acylphosphatase  39.53 
 
 		 90 aa  67.8  0.00000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1304  acylphosphatase  41.86 
 
 		 91 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000789837  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0736  acylphosphatase  48 
 
 		 93 aa  67  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0086  acylphosphatase  39.08 
 
 		 91 aa  67  0.00000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.186616  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0730  acylphosphatase  47.95 
 
 		 93 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2011  acylphosphatase  44.05 
 
 		 94 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4198  acylphosphatase  39.33 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0019532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0520  acylphosphatase  45.07 
 
 		 95 aa  66.6  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.230918  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0219  putative acylphosphatase protein  44.44 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0694  acylphosphatase  46.58 
 
 		 93 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.509759  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0509  acylphosphatase  37.21 
 
 		 87 aa  65.5  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0794  acylphosphatase  48.48 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.364443  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1480  acylphosphatase  45.12 
 
 		 94 aa  65.1  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0319671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4069  acylphosphatase  41.43 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2257  acylphosphatase  37.5 
 
 		 88 aa  64.7  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.265908 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0522  acylphosphatase  45.95 
 
 		 89 aa  64.3  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606766 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1396  acylphosphatase  41.98 
 
 		 90 aa  63.9  0.0000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6207  acylphosphatase  49.23 
 
 		 91 aa  63.9  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2619  acylphosphatase  38.82 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0888  acylphosphatase  45.45 
 
 		 89 aa  63.2  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000010114  n/a   
 
 
 
NC_011901  Tgr7_2243  acylphosphatase  41.18 
 
 		 95 aa  62.8  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2530  acylphosphatase  38.82 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.306115  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1449  acylphosphatase  37.97 
 
 		 89 aa  63.5  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000172052  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1839  acylphosphatase  42.25 
 
 		 90 aa  63.5  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.831487  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3210  acylphosphatase  38.82 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00151409  hitchhiker  0.00225794 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0729  acylphosphatase  45.21 
 
 		 93 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2346  acylphosphatase  43.9 
 
 		 92 aa  62.8  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.204273  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1692  acylphosphatase  37.5 
 
 		 91 aa  62.4  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.205499 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1765  acylphosphatase  45.12 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00140715  hitchhiker  0.00160768 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0999  acylphosphatase  53.45 
 
 		 104 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00530798 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1052  acylphosphatase  42.53 
 
 		 90 aa  62.4  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.424464  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1706  acylphosphatase  48.48 
 
 		 90 aa  61.6  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.531567  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2654  acylphosphatase  38.27 
 
 		 91 aa  61.6  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.156555  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2095  acylphosphatase  41.98 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.451224  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0091  acylphosphatase  41.98 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.104703  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0889  acylphosphatase  34.88 
 
 		 91 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3443  acylphosphatase  38.37 
 
 		 92 aa  60.8  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2149  acylphosphatase  42.68 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.054782  normal  0.385833 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1169  acylphosphatase  43.04 
 
 		 91 aa  61.2  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0859  putative acylphosphatase  38.75 
 
 		 89 aa  60.8  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000124258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1686  acylphosphatase  39.24 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.333589  normal  0.382627 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3638  DNA ligase D, 3'-phosphoesterase domain protein  47.37 
 
 		 252 aa  60.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0783731  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00972  predicted acylphosphatase  42.68 
 
 		 92 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0682612  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2675  acylphosphatase  42.68 
 
 		 92 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000389922  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00979  hypothetical protein  42.68 
 
 		 92 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.114044  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2628  acylphosphatase  42.68 
 
 		 92 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0934833  hitchhiker  0.0000175619 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1134  acylphosphatase  42.68 
 
 		 92 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.35715 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1957  acylphosphatase  38.57 
 
 		 98 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.66161  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2174  acylphosphatase  40 
 
 		 93 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2539  acylphosphatase  43.9 
 
 		 92 aa  60.1  0.000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0210008  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1323  acylphosphatase  37.35 
 
 		 96 aa  60.1  0.000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1219  acylphosphatase  44.83 
 
 		 92 aa  60.5  0.000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3047  acylphosphatase  38.57 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.813124  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6189  acylphosphatase  43.24 
 
 		 102 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1279  acylphosphatase  38.57 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>