222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0219 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0219  putative acylphosphatase protein  100 
 
 		 119 aa  238  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6189  acylphosphatase  75.82 
 
 		 102 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4846  acylphosphatase  61.8 
 
 		 101 aa  118  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7041  acylphosphatase  55.68 
 
 		 97 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.925608  hitchhiker  0.000175796 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0023  acylphosphatase  53.33 
 
 		 97 aa  85.1  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4125  acylphosphatase  51.55 
 
 		 98 aa  84.3  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3184  acylphosphatase  50 
 
 		 95 aa  81.3  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.678514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4152  acylphosphatase  45.92 
 
 		 97 aa  81.3  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0009  acylphosphatase  44.9 
 
 		 97 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4711  acylphosphatase  47.25 
 
 		 97 aa  77.8  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3568  acylphosphatase  47.19 
 
 		 95 aa  77.4  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3029  acylphosphatase  48.24 
 
 		 90 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.14564  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3245  acylphosphatase  46.07 
 
 		 95 aa  73.6  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3279  acylphosphatase  45.74 
 
 		 92 aa  70.9  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000800863 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3370  hypothetical protein  56.92 
 
 		 95 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0859  putative acylphosphatase  41.86 
 
 		 89 aa  70.5  0.000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000124258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1584  acylphosphatase  43.33 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2654  acylphosphatase  44.09 
 
 		 91 aa  68.6  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.156555  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1183  acylphosphatase  47.22 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.858645  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2164  acylphosphatase  43.75 
 
 		 99 aa  66.2  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22230  acylphosphatase  46.91 
 
 		 99 aa  66.6  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0560  acylphosphatase  43.96 
 
 		 96 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.373142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1796  acylphosphatase  47.76 
 
 		 92 aa  65.9  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.333863  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1328  acylphosphatase  44.44 
 
 		 91 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161573  normal  0.572666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4771  acylphosphatase  37 
 
 		 99 aa  65.5  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000297446  normal  0.0367606 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1716  acylphosphatase  43.66 
 
 		 93 aa  64.7  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000101765  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1158  acylphosphatase  38.64 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0933267  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0042  acylphosphatase  45.83 
 
 		 90 aa  64.3  0.0000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4481  acylphosphatase  42.17 
 
 		 101 aa  63.9  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2513  acylphosphatase  44.29 
 
 		 91 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000309341  normal  0.999326 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1453  acylphosphatase  41.86 
 
 		 92 aa  63.9  0.0000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2408  acylphosphatase  44.29 
 
 		 91 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000467903  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2160  acylphosphatase  44.29 
 
 		 91 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290914  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2397  acylphosphatase  44.29 
 
 		 91 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221356  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3638  DNA ligase D, 3'-phosphoesterase domain protein  48.57 
 
 		 252 aa  63.5  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0783731  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1957  acylphosphatase  49.32 
 
 		 98 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.66161  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1185  acylphosphatase  40.23 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4329  acylphosphatase  45 
 
 		 92 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.41249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1950  acylphosphatase  44.29 
 
 		 97 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000103444  normal  0.209392 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6574  acylphosphatase  46.67 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0496  acylphosphatase  47.83 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3258  acylphosphatase  47.95 
 
 		 98 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.064553 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1279  acylphosphatase  49.32 
 
 		 149 aa  62  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0745  acylphosphatase  40.85 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.492264  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5419  acylphosphatase  47.95 
 
 		 98 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2406  acylphosphatase  43.21 
 
 		 92 aa  62  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.31927  normal  0.925907 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0974  acylphosphatase  49.32 
 
 		 149 aa  62  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1261  acylphosphatase  49.32 
 
 		 155 aa  62  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2922  acylphosphatase  49.32 
 
 		 155 aa  62  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.282914  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2235  acylphosphatase  49.32 
 
 		 155 aa  62  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4069  acylphosphatase  36.05 
 
 		 92 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0713  acylphosphatase  44.44 
 
 		 92 aa  62  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.527846  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1735  acylphosphatase  41.67 
 
 		 99 aa  62  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.100754 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1921  acylphosphatase  43.21 
 
 		 83 aa  62  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3047  acylphosphatase  49.32 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.813124  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2214  putative acylphosphatase  42.68 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000119886  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0085  acylphosphatase  51.39 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.49451 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4872  acylphosphatase  49.32 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.450612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0110  acylphosphatase  46.58 
 
 		 105 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5312  acylphosphatase  46.58 
 
 		 105 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148968  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1728  acylphosphatase  41.43 
 
 		 90 aa  60.1  0.000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.352005  normal  0.358001 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5548  acylphosphatase  46.58 
 
 		 105 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.802692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2291  acylphosphatase  41.43 
 
 		 90 aa  60.1  0.000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0355652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4724  acylphosphatase  46.58 
 
 		 98 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2253  acylphosphatase  40.62 
 
 		 90 aa  60.1  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3583  acylphosphatase  40.66 
 
 		 99 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2240  acylphosphatase  47.95 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3123  acylphosphatase-like protein  40.7 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.555032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0520  acylphosphatase  41.98 
 
 		 95 aa  59.7  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.230918  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2998  acylphosphatase  44 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.593748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0694  acylphosphatase  46.27 
 
 		 93 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.509759  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2369  acylphosphatase  47.83 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631036  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1808  acylphosphatase  42.86 
 
 		 90 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0522  acylphosphatase  40 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606766 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3186  acylphosphatase  45.83 
 
 		 93 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.341128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3223  acylphosphatase  44 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.237355  normal  0.7882 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1812  acylphosphatase  43.9 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1245  acylphosphatase  43.42 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4554  acylphosphatase  43.66 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.640639  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1322  acylphosphatase  46.05 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0315179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3091  acylphosphatase  44.68 
 
 		 99 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.937205  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0736  acylphosphatase  44.74 
 
 		 93 aa  57.4  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4900  putative acylphosphatase  41.49 
 
 		 100 aa  57.4  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.164236 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3795  acylphosphatase  46.58 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.524231 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1419  acylphosphatase  40.74 
 
 		 92 aa  57  0.00000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0787  acylphosphatase  38.78 
 
 		 110 aa  57  0.00000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2447  acylphosphatase  44.93 
 
 		 92 aa  56.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2011  acylphosphatase  40.74 
 
 		 94 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2947  acylphosphatase  38.64 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3350  acylphosphatase  38 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.200593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2848  acylphosphatase  44.83 
 
 		 92 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0241308  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3149  acylphosphatase  38.64 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000748736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0730  acylphosphatase  46.27 
 
 		 93 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0824  acylphosphatase  39.51 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0703  acylphosphatase  44 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0311  acylphosphatase  40.58 
 
 		 93 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.422172  normal  0.0299279 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0794  acylphosphatase  43.66 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.364443  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1809  acylphosphatase  36.11 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000689172  normal  0.0364693 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1480  acylphosphatase  39.08 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0319671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0729  acylphosphatase  45.45 
 
 		 93 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>