281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3350 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3350  acylphosphatase  100 
 
 		 99 aa  200  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.200593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4900  putative acylphosphatase  63.16 
 
 		 100 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.164236 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2164  acylphosphatase  58.59 
 
 		 99 aa  127  6e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1735  acylphosphatase  59.6 
 
 		 99 aa  125  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.100754 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3583  acylphosphatase  60.2 
 
 		 99 aa  122  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3091  acylphosphatase  61.62 
 
 		 99 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.937205  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2369  acylphosphatase  60.61 
 
 		 99 aa  114  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631036  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4771  acylphosphatase  56.25 
 
 		 99 aa  88.6  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000297446  normal  0.0367606 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3245  acylphosphatase  52 
 
 		 95 aa  85.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3186  acylphosphatase  55.41 
 
 		 93 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.341128  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3370  hypothetical protein  52.17 
 
 		 95 aa  80.1  0.000000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3279  acylphosphatase  53.16 
 
 		 92 aa  79.3  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000800863 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4329  acylphosphatase  52.63 
 
 		 92 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.41249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4711  acylphosphatase  55.41 
 
 		 97 aa  79.7  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0085  acylphosphatase  52.44 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.49451 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3795  acylphosphatase  50.54 
 
 		 96 aa  78.2  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.524231 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3223  acylphosphatase  53.62 
 
 		 94 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.237355  normal  0.7882 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1216  acylphosphatase  50.65 
 
 		 93 aa  77  0.00000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2998  acylphosphatase  52.17 
 
 		 94 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.593748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2654  acylphosphatase  49.49 
 
 		 91 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.156555  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0372  acylphosphatase  54.41 
 
 		 94 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.404855 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3568  acylphosphatase  50 
 
 		 95 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2680  acylphosphatase  52.05 
 
 		 91 aa  76.3  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.174548  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08420  cylphosphatase  44.59 
 
 		 95 aa  75.1  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1322  acylphosphatase  44.57 
 
 		 101 aa  75.1  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0315179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1185  acylphosphatase  51.22 
 
 		 92 aa  74.3  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2746  acylphosphatase  54.79 
 
 		 94 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.352229  normal  0.313982 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3149  acylphosphatase  44.3 
 
 		 96 aa  73.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000748736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1891  acylphosphatase  56.06 
 
 		 92 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1316  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3607  acylphosphatase  46.48 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0899906 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2947  acylphosphatase  43.04 
 
 		 96 aa  72  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0713  acylphosphatase  56.52 
 
 		 92 aa  71.6  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.527846  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1419  acylphosphatase  46.43 
 
 		 92 aa  71.2  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2011  acylphosphatase  48.1 
 
 		 94 aa  70.5  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3384  acylphosphatase  50 
 
 		 94 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4069  acylphosphatase  37.78 
 
 		 92 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1584  acylphosphatase  48.57 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2214  putative acylphosphatase  46.75 
 
 		 92 aa  70.5  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000119886  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1169  acylphosphatase  45 
 
 		 91 aa  70.1  0.000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0920  acylphosphatase  42.86 
 
 		 91 aa  69.7  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0770  acylphosphatase  43.21 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2406  acylphosphatase  41.18 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.31927  normal  0.925907 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1245  acylphosphatase  51.35 
 
 		 95 aa  68.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2230  acylphosphatase  42.11 
 
 		 98 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.595414 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1304  acylphosphatase  44.44 
 
 		 91 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000789837  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0405  acylphosphatase  46.48 
 
 		 90 aa  68.2  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0599  acylphosphatase  43.9 
 
 		 101 aa  67.4  0.00000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2679  acylphosphatase  43.59 
 
 		 92 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1812  acylphosphatase  43.9 
 
 		 97 aa  67  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1427  acylphosphatase  44.93 
 
 		 97 aa  66.6  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223488  normal  0.163349 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0009  acylphosphatase  44.59 
 
 		 97 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0859  putative acylphosphatase  45.33 
 
 		 89 aa  66.2  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000124258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4152  acylphosphatase  44.59 
 
 		 97 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0889  acylphosphatase  40.48 
 
 		 91 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0745  acylphosphatase  49.23 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.492264  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3184  acylphosphatase  41.24 
 
 		 95 aa  65.5  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.678514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0311  acylphosphatase  45.33 
 
 		 93 aa  65.5  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.422172  normal  0.0299279 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1716  acylphosphatase  46.48 
 
 		 93 aa  65.9  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000101765  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6189  acylphosphatase  47.14 
 
 		 102 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3029  acylphosphatase  40.96 
 
 		 90 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.14564  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1453  acylphosphatase  43.9 
 
 		 92 aa  65.5  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0787  acylphosphatase  41.94 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0824  acylphosphatase  40.22 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1796  acylphosphatase  44 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.333863  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6574  acylphosphatase  46.38 
 
 		 97 aa  64.7  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0042  acylphosphatase  42.47 
 
 		 90 aa  64.3  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0520  acylphosphatase  42.86 
 
 		 95 aa  63.9  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.230918  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1869  acylphosphatase  43.94 
 
 		 90 aa  63.9  0.0000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0240  acylphosphatase  44 
 
 		 93 aa  63.5  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1158  acylphosphatase  42.67 
 
 		 94 aa  63.5  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0933267  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22230  acylphosphatase  50 
 
 		 99 aa  63.2  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1977  acylphosphatase  45.21 
 
 		 95 aa  62.8  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.560432  normal  0.812753 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4125  acylphosphatase  44 
 
 		 98 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4198  acylphosphatase  45.45 
 
 		 94 aa  63.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0019532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0888  acylphosphatase  46.75 
 
 		 89 aa  62.8  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000010114  n/a   
 
 
 
NC_013411  GYMC61_1288  acylphosphatase  40 
 
 		 94 aa  62  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1865  acylphosphatase  44.93 
 
 		 100 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0703  acylphosphatase  45.07 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4481  acylphosphatase  40.66 
 
 		 101 aa  62  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0023  acylphosphatase  47.76 
 
 		 97 aa  62  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7041  acylphosphatase  47.76 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.925608  hitchhiker  0.000175796 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4339  acylphosphatase  42.31 
 
 		 99 aa  62  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0201054  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0862  acylphosphatase  47.22 
 
 		 93 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1158  acylphosphatase  41.98 
 
 		 93 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.216126  normal  0.513068 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1192  acylphosphatase  41.98 
 
 		 93 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1124  acylphosphatase  41.98 
 
 		 93 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.8259399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1146  acylphosphatase  41.98 
 
 		 93 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137289  normal  0.225824 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3443  acylphosphatase  42.67 
 
 		 92 aa  60.5  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1480  acylphosphatase  38.95 
 
 		 94 aa  60.5  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0319671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0086  acylphosphatase  42.03 
 
 		 91 aa  60.8  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.186616  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3085  acylphosphatase  44.87 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.842982 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1041  acylphosphatase  41.98 
 
 		 93 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.860635  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2539  acylphosphatase  44.3 
 
 		 92 aa  60.5  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0210008  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0729  acylphosphatase  40 
 
 		 93 aa  60.1  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1921  acylphosphatase  46.15 
 
 		 83 aa  59.7  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0099  acylphosphatase  43.24 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.643538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0794  acylphosphatase  50 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.364443  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2447  acylphosphatase  39.29 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0151  acylphosphatase  42.03 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2848  acylphosphatase  45.24 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0241308  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>