246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2369 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_2369  acylphosphatase  100 
 
 
99 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631036  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3091  acylphosphatase  69.7 
 
 
99 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.937205  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3583  acylphosphatase  67.35 
 
 
99 aa  134  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3350  acylphosphatase  60.61 
 
 
99 aa  114  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.200593  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4900  putative acylphosphatase  56.25 
 
 
100 aa  103  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.164236 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1735  acylphosphatase  53.54 
 
 
99 aa  102  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.100754 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2164  acylphosphatase  52.53 
 
 
99 aa  101  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3795  acylphosphatase  50.54 
 
 
96 aa  89.4  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.524231 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0085  acylphosphatase  52.69 
 
 
107 aa  85.5  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.49451 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2998  acylphosphatase  46.74 
 
 
94 aa  79.3  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.593748  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3149  acylphosphatase  45.57 
 
 
96 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000748736  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3186  acylphosphatase  51.19 
 
 
93 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.341128  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4771  acylphosphatase  51.95 
 
 
99 aa  77.8  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000297446  normal  0.0367606 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3223  acylphosphatase  46.15 
 
 
94 aa  77.4  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.237355  normal  0.7882 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2947  acylphosphatase  44.3 
 
 
96 aa  77.4  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2746  acylphosphatase  55.41 
 
 
94 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.352229  normal  0.313982 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2654  acylphosphatase  52.86 
 
 
91 aa  72.8  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.156555  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2680  acylphosphatase  46.15 
 
 
91 aa  72.4  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.174548  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4711  acylphosphatase  51.28 
 
 
97 aa  72  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1419  acylphosphatase  50.63 
 
 
92 aa  70.5  0.000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1891  acylphosphatase  56.92 
 
 
92 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1316  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3370  hypothetical protein  54.17 
 
 
95 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3607  acylphosphatase  44.44 
 
 
110 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0899906 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3245  acylphosphatase  46.74 
 
 
95 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0824  acylphosphatase  44.19 
 
 
108 aa  67.8  0.00000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4069  acylphosphatase  40 
 
 
92 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3279  acylphosphatase  47.3 
 
 
92 aa  66.6  0.00000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000800863 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0372  acylphosphatase  53.33 
 
 
94 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.404855 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1322  acylphosphatase  52.46 
 
 
101 aa  66.6  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0315179  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08420  cylphosphatase  41.1 
 
 
95 aa  65.1  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0240  acylphosphatase  47.3 
 
 
93 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3568  acylphosphatase  53.12 
 
 
95 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1796  acylphosphatase  45.95 
 
 
92 aa  64.7  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.333863  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4481  acylphosphatase  46.15 
 
 
101 aa  64.3  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0311  acylphosphatase  45.95 
 
 
93 aa  63.9  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.422172  normal  0.0299279 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2406  acylphosphatase  42.86 
 
 
92 aa  64.3  0.0000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.31927  normal  0.925907 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1216  acylphosphatase  43.21 
 
 
93 aa  63.5  0.0000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0770  acylphosphatase  45.59 
 
 
92 aa  63.5  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0920  acylphosphatase  38.2 
 
 
91 aa  63.2  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1185  acylphosphatase  50.72 
 
 
92 aa  63.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0520  acylphosphatase  47.37 
 
 
95 aa  63.5  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.230918  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0023  acylphosphatase  45 
 
 
97 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4198  acylphosphatase  41.77 
 
 
94 aa  62.4  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0019532  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7041  acylphosphatase  45 
 
 
97 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.925608  hitchhiker  0.000175796 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0694  acylphosphatase  45.33 
 
 
93 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.509759  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4125  acylphosphatase  43.75 
 
 
98 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2011  acylphosphatase  48.53 
 
 
94 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4329  acylphosphatase  43.53 
 
 
92 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.41249  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0042  acylphosphatase  47.3 
 
 
90 aa  61.6  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2679  acylphosphatase  39.53 
 
 
92 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0729  acylphosphatase  46.67 
 
 
93 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36780  acylphosphatase  41.86 
 
 
91 aa  61.6  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4152  acylphosphatase  44.19 
 
 
97 aa  61.6  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0009  acylphosphatase  46.38 
 
 
97 aa  60.8  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1977  acylphosphatase  48.1 
 
 
95 aa  60.8  0.000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.560432  normal  0.812753 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1158  acylphosphatase  44.59 
 
 
94 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0933267  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0787  acylphosphatase  41.94 
 
 
110 aa  60.5  0.000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2243  acylphosphatase  49.32 
 
 
95 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1245  acylphosphatase  47.14 
 
 
95 aa  59.7  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2230  acylphosphatase  44.87 
 
 
98 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.595414 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3085  acylphosphatase  44.74 
 
 
112 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.842982 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0889  acylphosphatase  42.86 
 
 
91 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0219  putative acylphosphatase protein  47.83 
 
 
119 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3184  acylphosphatase  42.39 
 
 
95 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.678514  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0713  acylphosphatase  48.53 
 
 
92 aa  58.5  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.527846  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2214  putative acylphosphatase  47.06 
 
 
92 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000119886  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0730  acylphosphatase  45.33 
 
 
93 aa  58.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1716  acylphosphatase  40.4 
 
 
93 aa  58.2  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000101765  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0745  acylphosphatase  46.97 
 
 
117 aa  57.8  0.00000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.492264  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3443  acylphosphatase  47.06 
 
 
92 aa  58.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1169  acylphosphatase  37.8 
 
 
91 aa  57.8  0.00000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1453  acylphosphatase  43.24 
 
 
92 aa  57.8  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1812  acylphosphatase  47.69 
 
 
97 aa  57  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1449  acylphosphatase  39.71 
 
 
89 aa  56.6  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000172052  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1584  acylphosphatase  46.38 
 
 
108 aa  56.6  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1865  acylphosphatase  38.64 
 
 
100 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0086  acylphosphatase  36.14 
 
 
91 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.186616  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0599  acylphosphatase  46.97 
 
 
101 aa  55.8  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0300  acylphosphatase  45.33 
 
 
95 aa  55.5  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6189  acylphosphatase  40.79 
 
 
102 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2447  acylphosphatase  39.33 
 
 
92 aa  55.1  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1052  acylphosphatase  45.07 
 
 
90 aa  55.5  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.424464  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2729  acylphosphatase  35.9 
 
 
93 aa  54.7  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0335058  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0151  acylphosphatase  41.1 
 
 
97 aa  54.7  0.0000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3384  acylphosphatase  44.62 
 
 
94 aa  54.7  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1283  acylphosphatase  34.83 
 
 
91 aa  54.3  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.380051  normal  0.379678 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1480  acylphosphatase  40.96 
 
 
94 aa  54.7  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0319671  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1304  acylphosphatase  41.43 
 
 
91 aa  54.3  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000789837  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0736  acylphosphatase  41.98 
 
 
93 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1505  acylphosphatase  43.42 
 
 
90 aa  54.3  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1839  acylphosphatase  45.71 
 
 
90 aa  53.9  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.831487  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22230  acylphosphatase  45.83 
 
 
99 aa  53.9  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0797  acylphosphatase  38.89 
 
 
94 aa  53.9  0.0000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.159731  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0794  acylphosphatase  43.75 
 
 
110 aa  53.9  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.364443  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0859  putative acylphosphatase  43.08 
 
 
89 aa  53.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000124258  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3123  acylphosphatase-like protein  46.38 
 
 
89 aa  53.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.555032  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1183  acylphosphatase  41.67 
 
 
92 aa  53.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.858645  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0255  acylphosphatase  44.93 
 
 
95 aa  52.8  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.714232 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1041  acylphosphatase  42.47 
 
 
93 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.860635  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1146  acylphosphatase  42.47 
 
 
93 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137289  normal  0.225824 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>