273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4711 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_4711  acylphosphatase  100 
 
 
97 aa  187  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4152  acylphosphatase  60 
 
 
97 aa  108  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0009  acylphosphatase  58.95 
 
 
97 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3279  acylphosphatase  70 
 
 
92 aa  99  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000800863 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2164  acylphosphatase  59.26 
 
 
99 aa  86.3  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3568  acylphosphatase  55.7 
 
 
95 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1185  acylphosphatase  52.81 
 
 
92 aa  80.9  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1453  acylphosphatase  54.02 
 
 
92 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3350  acylphosphatase  55.41 
 
 
99 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.200593  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1584  acylphosphatase  51.69 
 
 
108 aa  79.7  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0787  acylphosphatase  56.34 
 
 
110 aa  79.7  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1735  acylphosphatase  54.17 
 
 
99 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.100754 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3223  acylphosphatase  55.81 
 
 
94 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.237355  normal  0.7882 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0219  putative acylphosphatase protein  47.25 
 
 
119 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3245  acylphosphatase  53.49 
 
 
95 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0151  acylphosphatase  48.86 
 
 
97 aa  77  0.00000000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0859  putative acylphosphatase  57.33 
 
 
89 aa  76.6  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000124258  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2680  acylphosphatase  49.45 
 
 
91 aa  76.3  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.174548  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0300  acylphosphatase  57.14 
 
 
95 aa  76.3  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2998  acylphosphatase  53.49 
 
 
94 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.593748  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3607  acylphosphatase  46.15 
 
 
110 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0899906 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3186  acylphosphatase  54.76 
 
 
93 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.341128  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1322  acylphosphatase  53.57 
 
 
101 aa  75.1  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0315179  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4069  acylphosphatase  45.59 
 
 
92 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4125  acylphosphatase  50 
 
 
98 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1183  acylphosphatase  50.6 
 
 
92 aa  73.9  0.0000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.858645  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0255  acylphosphatase  55.71 
 
 
95 aa  73.9  0.0000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.714232 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2654  acylphosphatase  52.44 
 
 
91 aa  73.2  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.156555  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6574  acylphosphatase  48.19 
 
 
97 aa  72.4  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0713  acylphosphatase  48.86 
 
 
92 aa  72.4  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.527846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4771  acylphosphatase  47.5 
 
 
99 aa  72.4  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000297446  normal  0.0367606 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0889  acylphosphatase  53.85 
 
 
91 aa  72  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3370  hypothetical protein  50 
 
 
95 aa  72  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3029  acylphosphatase  53.52 
 
 
90 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.14564  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2369  acylphosphatase  51.28 
 
 
99 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631036  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4329  acylphosphatase  45.57 
 
 
92 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.41249  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1294  acylphosphatase  56.92 
 
 
95 aa  72  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3091  acylphosphatase  47.56 
 
 
99 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.937205  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1052  acylphosphatase  55.07 
 
 
90 aa  71.2  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.424464  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3210  acylphosphatase  49.38 
 
 
92 aa  70.9  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00151409  hitchhiker  0.00225794 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0023  acylphosphatase  48.65 
 
 
97 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2619  acylphosphatase  49.38 
 
 
92 aa  70.9  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2530  acylphosphatase  49.38 
 
 
92 aa  70.9  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.306115  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7041  acylphosphatase  52.24 
 
 
97 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.925608  hitchhiker  0.000175796 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2848  acylphosphatase  54.55 
 
 
92 aa  70.1  0.000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0241308  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3583  acylphosphatase  46.67 
 
 
99 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2539  acylphosphatase  54.55 
 
 
92 aa  69.3  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0210008  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1219  acylphosphatase  48.81 
 
 
92 aa  69.3  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0311  acylphosphatase  50.72 
 
 
93 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.422172  normal  0.0299279 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0240  acylphosphatase  46.99 
 
 
93 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3384  acylphosphatase  46.75 
 
 
94 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2406  acylphosphatase  48.05 
 
 
92 aa  68.9  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.31927  normal  0.925907 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0736  acylphosphatase  60 
 
 
93 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0730  acylphosphatase  55.84 
 
 
93 aa  68.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1041  acylphosphatase  45.24 
 
 
93 aa  68.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.860635  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3795  acylphosphatase  51.47 
 
 
96 aa  68.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.524231 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0729  acylphosphatase  56.52 
 
 
93 aa  68.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0372  acylphosphatase  55.42 
 
 
94 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.404855 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3638  DNA ligase D, 3'-phosphoesterase domain protein  58.21 
 
 
252 aa  67.8  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0783731  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0694  acylphosphatase  54.17 
 
 
93 aa  67.8  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.509759  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1192  acylphosphatase  44.05 
 
 
93 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1158  acylphosphatase  44.05 
 
 
93 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.216126  normal  0.513068 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3184  acylphosphatase  45.68 
 
 
95 aa  67.8  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.678514  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1146  acylphosphatase  44.05 
 
 
93 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137289  normal  0.225824 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1124  acylphosphatase  44.05 
 
 
93 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  1.8259399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1222  acylphosphatase  39.47 
 
 
91 aa  67.4  0.00000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0186184  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1158  acylphosphatase  40.86 
 
 
94 aa  67.4  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0933267  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0560  acylphosphatase  47.5 
 
 
96 aa  67  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.373142  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1796  acylphosphatase  46.38 
 
 
92 aa  66.2  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.333863  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4900  putative acylphosphatase  51.28 
 
 
100 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.164236 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1245  acylphosphatase  40.74 
 
 
95 aa  65.9  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6189  acylphosphatase  44.87 
 
 
102 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22230  acylphosphatase  54.17 
 
 
99 aa  65.5  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0745  acylphosphatase  45.83 
 
 
117 aa  65.9  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.492264  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1706  acylphosphatase  38.75 
 
 
90 aa  66.2  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.531567  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2243  acylphosphatase  50.67 
 
 
95 aa  65.5  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0703  acylphosphatase  43.18 
 
 
92 aa  65.5  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4481  acylphosphatase  47.37 
 
 
101 aa  65.5  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1891  acylphosphatase  49.43 
 
 
92 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1316  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1216  acylphosphatase  43.24 
 
 
93 aa  64.7  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3443  acylphosphatase  39.29 
 
 
92 aa  64.7  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2688  acylphosphatase  51.32 
 
 
92 aa  64.3  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0496  acylphosphatase  52.11 
 
 
104 aa  64.3  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08420  cylphosphatase  39.76 
 
 
95 aa  64.3  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0085  acylphosphatase  55.84 
 
 
107 aa  63.9  0.0000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.49451 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0042  acylphosphatase  41.25 
 
 
90 aa  63.9  0.0000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2230  acylphosphatase  42.5 
 
 
98 aa  63.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.595414 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1419  acylphosphatase  49.3 
 
 
92 aa  63.5  0.0000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0522  acylphosphatase  44.57 
 
 
89 aa  63.5  0.0000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.606766 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0520  acylphosphatase  42.86 
 
 
95 aa  63.2  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.230918  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0099  acylphosphatase  44.44 
 
 
124 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.643538  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0920  acylphosphatase  44.44 
 
 
91 aa  62.8  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3149  acylphosphatase  36.17 
 
 
96 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000748736  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1765  acylphosphatase  51.56 
 
 
92 aa  62.4  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00140715  hitchhiker  0.00160768 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2947  acylphosphatase  36.17 
 
 
96 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2346  acylphosphatase  41.98 
 
 
92 aa  62  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.204273  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1480  acylphosphatase  40.74 
 
 
94 aa  62.8  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0319671  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0794  acylphosphatase  52.7 
 
 
110 aa  62.8  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.364443  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2011  acylphosphatase  45 
 
 
94 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0770  acylphosphatase  42.17 
 
 
92 aa  62.8  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>