266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0889 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0889  acylphosphatase  100 
 
 		 91 aa  186  8e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2729  acylphosphatase  79.12 
 
 		 93 aa  152  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0335058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1304  acylphosphatase  61.54 
 
 		 91 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000789837  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3384  acylphosphatase  50 
 
 		 94 aa  101  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1796  acylphosphatase  50.56 
 
 		 92 aa  95.5  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.333863  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0862  acylphosphatase  48.89 
 
 		 93 aa  94  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1052  acylphosphatase  50.56 
 
 		 90 aa  90.9  6e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.424464  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0729  acylphosphatase  50 
 
 		 93 aa  90.5  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0730  acylphosphatase  50 
 
 		 93 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0694  acylphosphatase  47.78 
 
 		 93 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.509759  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0770  acylphosphatase  45.98 
 
 		 92 aa  82.4  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0824  acylphosphatase  49.44 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4069  acylphosphatase  44.94 
 
 		 92 aa  80.5  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2406  acylphosphatase  47.19 
 
 		 92 aa  79  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.31927  normal  0.925907 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0794  acylphosphatase  54.02 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.364443  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0311  acylphosphatase  48.84 
 
 		 93 aa  79  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.422172  normal  0.0299279 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1427  acylphosphatase  44.44 
 
 		 97 aa  78.2  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223488  normal  0.163349 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0736  acylphosphatase  47.73 
 
 		 93 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0103  acylphosphatase  47.78 
 
 		 92 aa  77.4  0.00000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00111331 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0240  acylphosphatase  47.67 
 
 		 93 aa  77.4  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2447  acylphosphatase  45.56 
 
 		 92 aa  77  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4481  acylphosphatase  47.5 
 
 		 101 aa  76.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1716  acylphosphatase  46.67 
 
 		 93 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000101765  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1245  acylphosphatase  39.33 
 
 		 95 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0520  acylphosphatase  44.44 
 
 		 95 aa  76.3  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.230918  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2947  acylphosphatase  41.18 
 
 		 96 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3149  acylphosphatase  41.18 
 
 		 96 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000748736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2539  acylphosphatase  42.86 
 
 		 92 aa  75.9  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0210008  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0713  acylphosphatase  44.58 
 
 		 92 aa  75.1  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.527846  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0023  acylphosphatase  42.68 
 
 		 97 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7041  acylphosphatase  42.68 
 
 		 97 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.925608  hitchhiker  0.000175796 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08420  cylphosphatase  38.2 
 
 		 95 aa  74.3  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36780  acylphosphatase  48.86 
 
 		 91 aa  74.3  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4125  acylphosphatase  41.46 
 
 		 98 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1158  acylphosphatase  39.33 
 
 		 94 aa  73.9  0.0000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0933267  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2688  acylphosphatase  45.05 
 
 		 92 aa  73.2  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2998  acylphosphatase  44.05 
 
 		 94 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.593748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2530  acylphosphatase  41.76 
 
 		 92 aa  72  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.306115  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0859  putative acylphosphatase  46.43 
 
 		 89 aa  72  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000124258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4329  acylphosphatase  42.35 
 
 		 92 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.41249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3210  acylphosphatase  41.76 
 
 		 92 aa  72  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00151409  hitchhiker  0.00225794 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2619  acylphosphatase  41.76 
 
 		 92 aa  72  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1183  acylphosphatase  45.68 
 
 		 92 aa  72.8  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.858645  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00972  predicted acylphosphatase  44.44 
 
 		 92 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0682612  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2675  acylphosphatase  44.44 
 
 		 92 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000389922  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2628  acylphosphatase  44.44 
 
 		 92 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0934833  hitchhiker  0.0000175619 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00979  hypothetical protein  44.44 
 
 		 92 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.114044  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22230  acylphosphatase  46.34 
 
 		 99 aa  71.6  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4711  acylphosphatase  53.85 
 
 		 97 aa  72  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2835  acylphosphatase  37.21 
 
 		 91 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000760642  hitchhiker  0.000425949 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1134  acylphosphatase  44.44 
 
 		 92 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.35715 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1869  acylphosphatase  41.57 
 
 		 90 aa  71.6  0.000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1419  acylphosphatase  45.56 
 
 		 92 aa  71.2  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2848  acylphosphatase  42.86 
 
 		 92 aa  71.2  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0241308  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1169  acylphosphatase  44.44 
 
 		 91 aa  71.2  0.000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0255  acylphosphatase  44.32 
 
 		 95 aa  70.9  0.000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.714232 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1219  acylphosphatase  42.86 
 
 		 92 aa  70.9  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2346  acylphosphatase  43.33 
 
 		 92 aa  70.5  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.204273  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3223  acylphosphatase  53.85 
 
 		 94 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.237355  normal  0.7882 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2164  acylphosphatase  50.75 
 
 		 99 aa  70.1  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0787  acylphosphatase  39.77 
 
 		 110 aa  70.1  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1765  acylphosphatase  45.24 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00140715  hitchhiker  0.00160768 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1185  acylphosphatase  44.94 
 
 		 92 aa  69.3  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2149  acylphosphatase  42.7 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.054782  normal  0.385833 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0300  acylphosphatase  43.68 
 
 		 95 aa  68.9  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4554  acylphosphatase  52.94 
 
 		 86 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.640639  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4339  acylphosphatase  47.95 
 
 		 99 aa  69.3  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0201054  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2214  putative acylphosphatase  39.33 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000119886  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0042  acylphosphatase  39.56 
 
 		 90 aa  68.6  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3279  acylphosphatase  45 
 
 		 92 aa  67.8  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000800863 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1480  acylphosphatase  38.46 
 
 		 94 aa  67.8  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0319671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0009  acylphosphatase  50.77 
 
 		 97 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4152  acylphosphatase  50.77 
 
 		 97 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02367  acylphosphatase  44.44 
 
 		 90 aa  67.4  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3186  acylphosphatase  43.82 
 
 		 93 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.341128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1735  acylphosphatase  49.23 
 
 		 99 aa  66.6  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.100754 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2654  acylphosphatase  50 
 
 		 91 aa  66.2  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.156555  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1216  acylphosphatase  40.91 
 
 		 93 aa  66.6  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3443  acylphosphatase  37.5 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1041  acylphosphatase  39.08 
 
 		 93 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.860635  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1692  acylphosphatase  40.74 
 
 		 91 aa  66.2  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.205499 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3350  acylphosphatase  40.48 
 
 		 99 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.200593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1192  acylphosphatase  39.08 
 
 		 93 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1294  acylphosphatase  44.32 
 
 		 95 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1124  acylphosphatase  39.08 
 
 		 93 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.8259399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1158  acylphosphatase  39.08 
 
 		 93 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.216126  normal  0.513068 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1146  acylphosphatase  39.08 
 
 		 93 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137289  normal  0.225824 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1809  acylphosphatase  34.88 
 
 		 95 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000689172  normal  0.0364693 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1541  acylphosphatase  41.86 
 
 		 91 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000112131  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0888  acylphosphatase  46.34 
 
 		 89 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000010114  n/a   
 
 
 
NC_009092  Shew_1628  acylphosphatase  38.37 
 
 		 89 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000020913  normal  0.189828 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2248  acylphosphatase  40.26 
 
 		 89 aa  64.3  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.946619  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1921  acylphosphatase  45.78 
 
 		 83 aa  63.9  0.0000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1728  acylphosphatase  37.21 
 
 		 90 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.352005  normal  0.358001 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2291  acylphosphatase  37.21 
 
 		 90 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0355652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1812  acylphosphatase  40.96 
 
 		 97 aa  63.5  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1322  acylphosphatase  46.15 
 
 		 101 aa  63.9  0.0000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0315179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0745  acylphosphatase  44.58 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.492264  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1808  acylphosphatase  37.21 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6207  acylphosphatase  40.54 
 
 		 91 aa  63.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>