More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2539 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2539  acylphosphatase  100 
 
 		 92 aa  190  5e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0210008  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2848  acylphosphatase  82.61 
 
 		 92 aa  159  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0241308  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2619  acylphosphatase  68.48 
 
 		 92 aa  140  6e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2530  acylphosphatase  68.48 
 
 		 92 aa  140  6e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.306115  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3210  acylphosphatase  68.48 
 
 		 92 aa  140  6e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00151409  hitchhiker  0.00225794 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1219  acylphosphatase  72.83 
 
 		 92 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1765  acylphosphatase  67.39 
 
 		 92 aa  137  4.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00140715  hitchhiker  0.00160768 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1041  acylphosphatase  69.89 
 
 		 93 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.860635  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1158  acylphosphatase  68.82 
 
 		 93 aa  134  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.216126  normal  0.513068 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1124  acylphosphatase  68.82 
 
 		 93 aa  134  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.8259399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1192  acylphosphatase  68.82 
 
 		 93 aa  134  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1146  acylphosphatase  68.82 
 
 		 93 aa  134  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137289  normal  0.225824 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2688  acylphosphatase  68.48 
 
 		 92 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1480  acylphosphatase  66.67 
 
 		 94 aa  129  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0319671  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00972  predicted acylphosphatase  63.04 
 
 		 92 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0682612  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2675  acylphosphatase  63.04 
 
 		 92 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000389922  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2628  acylphosphatase  63.04 
 
 		 92 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0934833  hitchhiker  0.0000175619 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1134  acylphosphatase  63.04 
 
 		 92 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.35715 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00979  hypothetical protein  63.04 
 
 		 92 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.114044  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2149  acylphosphatase  67.5 
 
 		 92 aa  117  7e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.054782  normal  0.385833 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2346  acylphosphatase  67.5 
 
 		 92 aa  116  9e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.204273  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4069  acylphosphatase  46.74 
 
 		 92 aa  80.5  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0372  acylphosphatase  48.81 
 
 		 94 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.404855 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4554  acylphosphatase  51.19 
 
 		 86 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.640639  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02367  acylphosphatase  48.15 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1869  acylphosphatase  60.29 
 
 		 90 aa  77.8  0.00000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0703  acylphosphatase  49.41 
 
 		 92 aa  78.2  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0969  acylphosphatase  47.25 
 
 		 94 aa  76.6  0.00000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000144451  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51920  acylphosphatase  47.25 
 
 		 91 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243945 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1706  acylphosphatase  48.1 
 
 		 90 aa  76.6  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.531567  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0889  acylphosphatase  42.86 
 
 		 91 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1977  acylphosphatase  49.41 
 
 		 95 aa  73.2  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.560432  normal  0.812753 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0009  acylphosphatase  44.44 
 
 		 97 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4152  acylphosphatase  44.44 
 
 		 97 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0653  acylphosphatase  52.63 
 
 		 91 aa  72.8  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2406  acylphosphatase  45.78 
 
 		 92 aa  72.4  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.31927  normal  0.925907 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0151  acylphosphatase  57.35 
 
 		 97 aa  71.2  0.000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2243  acylphosphatase  51.9 
 
 		 95 aa  70.9  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2248  acylphosphatase  40.91 
 
 		 89 aa  70.1  0.000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.946619  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0999  acylphosphatase  50 
 
 		 104 aa  70.1  0.000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00530798 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36780  acylphosphatase  45.05 
 
 		 91 aa  69.7  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3029  acylphosphatase  45.68 
 
 		 90 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.14564  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4711  acylphosphatase  54.55 
 
 		 97 aa  69.3  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3123  acylphosphatase-like protein  48.19 
 
 		 89 aa  70.1  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.555032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2729  acylphosphatase  40.66 
 
 		 93 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0335058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1839  acylphosphatase  50.7 
 
 		 90 aa  68.9  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.831487  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3607  acylphosphatase  48.78 
 
 		 110 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0899906 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0496  acylphosphatase  46.25 
 
 		 104 aa  69.3  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0522  acylphosphatase  46.91 
 
 		 89 aa  69.3  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606766 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1052  acylphosphatase  47.06 
 
 		 90 aa  69.3  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.424464  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0560  acylphosphatase  56.92 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.373142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1228  acylphosphatase  45.78 
 
 		 90 aa  68.2  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00087614  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1227  acylphosphatase  45.78 
 
 		 90 aa  68.2  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.130113  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7993  Acylphosphatase-like protein  47.37 
 
 		 91 aa  68.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888786  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1812  acylphosphatase  45.35 
 
 		 97 aa  67.8  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0729  acylphosphatase  47.67 
 
 		 93 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1686  acylphosphatase  45.45 
 
 		 88 aa  67.8  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.333589  normal  0.382627 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08420  cylphosphatase  42.35 
 
 		 95 aa  67.8  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4771  acylphosphatase  45.98 
 
 		 99 aa  67.4  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000297446  normal  0.0367606 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3384  acylphosphatase  42.86 
 
 		 94 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0730  acylphosphatase  47.67 
 
 		 93 aa  67  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6574  acylphosphatase  46.75 
 
 		 97 aa  66.2  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2174  acylphosphatase  45.05 
 
 		 93 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0520  acylphosphatase  44.83 
 
 		 95 aa  66.2  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.230918  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7041  acylphosphatase  46.25 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.925608  hitchhiker  0.000175796 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0859  putative acylphosphatase  48.19 
 
 		 89 aa  65.5  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000124258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0023  acylphosphatase  46.25 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1952  acylphosphatase  46.05 
 
 		 94 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247986  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1808  acylphosphatase  43.04 
 
 		 90 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1932  acylphosphatase  46.05 
 
 		 94 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0487108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1998  acylphosphatase  46.05 
 
 		 94 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.635569  normal  0.522288 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2257  acylphosphatase  42.35 
 
 		 88 aa  65.5  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.265908 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4481  acylphosphatase  43.37 
 
 		 101 aa  65.1  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4125  acylphosphatase  45 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1288  acylphosphatase  38.71 
 
 		 94 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4329  acylphosphatase  38.89 
 
 		 92 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.41249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0888  acylphosphatase  42.86 
 
 		 89 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000010114  n/a   
 
 
 
NC_013525  Tter_1245  acylphosphatase  39.78 
 
 		 95 aa  65.1  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2075  acylphosphatase  50.79 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.172008  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1427  acylphosphatase  39.13 
 
 		 97 aa  64.7  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223488  normal  0.163349 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0713  acylphosphatase  51.72 
 
 		 92 aa  64.3  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.527846  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09560  acylphosphatase  46.15 
 
 		 98 aa  64.3  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1304  acylphosphatase  41.76 
 
 		 91 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000789837  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1453  acylphosphatase  42.86 
 
 		 92 aa  63.9  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0794  acylphosphatase  52.54 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.364443  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1728  acylphosphatase  41.98 
 
 		 90 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.352005  normal  0.358001 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1692  acylphosphatase  48.75 
 
 		 91 aa  64.3  0.0000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.205499 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2291  acylphosphatase  41.98 
 
 		 90 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0355652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6207  acylphosphatase  38.89 
 
 		 91 aa  63.9  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1571  acylphosphatase  55.71 
 
 		 95 aa  63.5  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00643387  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1396  acylphosphatase  44.71 
 
 		 90 aa  63.5  0.0000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3279  acylphosphatase  45.21 
 
 		 92 aa  62.8  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000800863 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0694  acylphosphatase  45.35 
 
 		 93 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.509759  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0862  acylphosphatase  41.76 
 
 		 93 aa  62.8  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0509  acylphosphatase  51.47 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0824  acylphosphatase  43.02 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4189  acylphosphatase  43.96 
 
 		 94 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.702907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12937  acylphosphatase  45.88 
 
 		 93 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00163956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1716  acylphosphatase  38.89 
 
 		 93 aa  62.4  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000101765  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1735  acylphosphatase  41.77 
 
 		 99 aa  62.8  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.100754 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>