252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1728 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1728  acylphosphatase  100 
 
 
90 aa  183  9e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.352005  normal  0.358001 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2291  acylphosphatase  100 
 
 
90 aa  183  9e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0355652  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1808  acylphosphatase  97.78 
 
 
90 aa  179  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2160  acylphosphatase  86.67 
 
 
91 aa  160  4.0000000000000004e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290914  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1950  acylphosphatase  85.56 
 
 
97 aa  159  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000103444  normal  0.209392 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2397  acylphosphatase  85.56 
 
 
91 aa  159  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221356  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2513  acylphosphatase  85.56 
 
 
91 aa  159  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000309341  normal  0.999326 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2408  acylphosphatase  85.56 
 
 
91 aa  159  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000467903  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2253  acylphosphatase  82.22 
 
 
90 aa  149  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2835  acylphosphatase  62.22 
 
 
91 aa  115  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000760642  hitchhiker  0.000425949 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1328  acylphosphatase  61.11 
 
 
91 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161573  normal  0.572666 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1541  acylphosphatase  60 
 
 
91 aa  102  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000112131  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1809  acylphosphatase  57.3 
 
 
95 aa  102  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000689172  normal  0.0364693 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1628  acylphosphatase  53.41 
 
 
89 aa  90.1  9e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000020913  normal  0.189828 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1796  acylphosphatase  44.32 
 
 
92 aa  77  0.00000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.333863  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0859  putative acylphosphatase  43.75 
 
 
89 aa  72.8  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000124258  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0713  acylphosphatase  40 
 
 
92 aa  71.6  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.527846  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2848  acylphosphatase  44.44 
 
 
92 aa  69.7  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0241308  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0023  acylphosphatase  40.24 
 
 
97 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6574  acylphosphatase  44.62 
 
 
97 aa  68.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4125  acylphosphatase  40.24 
 
 
98 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7041  acylphosphatase  40.24 
 
 
97 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.925608  hitchhiker  0.000175796 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1219  acylphosphatase  53.23 
 
 
92 aa  67.4  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4069  acylphosphatase  50 
 
 
92 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2619  acylphosphatase  40 
 
 
92 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2530  acylphosphatase  40 
 
 
92 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.306115  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3210  acylphosphatase  40 
 
 
92 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00151409  hitchhiker  0.00225794 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0151  acylphosphatase  47.3 
 
 
97 aa  64.7  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0730  acylphosphatase  45.21 
 
 
93 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0240  acylphosphatase  36.96 
 
 
93 aa  64.3  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0794  acylphosphatase  46.88 
 
 
110 aa  63.9  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.364443  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2539  acylphosphatase  41.98 
 
 
92 aa  63.9  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0210008  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0889  acylphosphatase  37.21 
 
 
91 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0770  acylphosphatase  39.08 
 
 
92 aa  63.5  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4481  acylphosphatase  43.75 
 
 
101 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0736  acylphosphatase  44.78 
 
 
93 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2654  acylphosphatase  45.33 
 
 
91 aa  62.4  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.156555  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1765  acylphosphatase  41.98 
 
 
92 aa  62.4  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00140715  hitchhiker  0.00160768 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1158  acylphosphatase  40.7 
 
 
94 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0933267  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1957  acylphosphatase  39.44 
 
 
98 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.66161  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4152  acylphosphatase  46.48 
 
 
97 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1921  acylphosphatase  42.31 
 
 
83 aa  61.6  0.000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1480  acylphosphatase  43.75 
 
 
94 aa  61.2  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0319671  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0824  acylphosphatase  39.76 
 
 
108 aa  61.6  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0729  acylphosphatase  42.47 
 
 
93 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1185  acylphosphatase  45.12 
 
 
92 aa  61.2  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0694  acylphosphatase  40 
 
 
93 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.509759  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4711  acylphosphatase  52.31 
 
 
97 aa  61.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2680  acylphosphatase  47.54 
 
 
91 aa  60.8  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.174548  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2346  acylphosphatase  37.21 
 
 
92 aa  60.5  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.204273  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1419  acylphosphatase  38.55 
 
 
92 aa  60.5  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0219  putative acylphosphatase protein  41.43 
 
 
119 aa  60.1  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0009  acylphosphatase  45.07 
 
 
97 aa  60.1  0.000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00972  predicted acylphosphatase  37.21 
 
 
92 aa  59.3  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0682612  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2675  acylphosphatase  37.21 
 
 
92 aa  59.3  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000389922  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2628  acylphosphatase  37.21 
 
 
92 aa  59.3  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0934833  hitchhiker  0.0000175619 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2688  acylphosphatase  53.45 
 
 
92 aa  60.1  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1279  acylphosphatase  40.58 
 
 
149 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2149  acylphosphatase  37.21 
 
 
92 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.054782  normal  0.385833 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1716  acylphosphatase  41.33 
 
 
93 aa  59.7  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000101765  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2447  acylphosphatase  39.51 
 
 
92 aa  60.1  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2235  acylphosphatase  40.58 
 
 
155 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0974  acylphosphatase  40.58 
 
 
149 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00979  hypothetical protein  37.21 
 
 
92 aa  59.3  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.114044  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1261  acylphosphatase  40.58 
 
 
155 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1134  acylphosphatase  37.21 
 
 
92 aa  59.3  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.35715 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3047  acylphosphatase  40 
 
 
152 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.813124  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2922  acylphosphatase  40.58 
 
 
155 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.282914  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1228  acylphosphatase  40.91 
 
 
90 aa  58.9  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00087614  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1227  acylphosphatase  40.91 
 
 
90 aa  58.9  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.130113  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1052  acylphosphatase  38.37 
 
 
90 aa  59.3  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.424464  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1183  acylphosphatase  46.03 
 
 
92 aa  59.3  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.858645  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3258  acylphosphatase  38.03 
 
 
98 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.064553 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1041  acylphosphatase  45.16 
 
 
93 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.860635  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2214  putative acylphosphatase  33.72 
 
 
92 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000119886  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1839  acylphosphatase  48 
 
 
90 aa  58.2  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.831487  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2406  acylphosphatase  40.51 
 
 
92 aa  58.5  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.31927  normal  0.925907 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3029  acylphosphatase  40.51 
 
 
90 aa  57.8  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.14564  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1869  acylphosphatase  33.33 
 
 
90 aa  57.8  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1686  acylphosphatase  42.86 
 
 
88 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.333589  normal  0.382627 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0110  acylphosphatase  36.62 
 
 
105 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1192  acylphosphatase  45.16 
 
 
93 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1158  acylphosphatase  45.16 
 
 
93 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.216126  normal  0.513068 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1124  acylphosphatase  45.16 
 
 
93 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  1.8259399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1146  acylphosphatase  45.16 
 
 
93 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137289  normal  0.225824 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2257  acylphosphatase  37.04 
 
 
88 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.265908 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0311  acylphosphatase  39.68 
 
 
93 aa  57.8  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.422172  normal  0.0299279 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1427  acylphosphatase  32.18 
 
 
97 aa  57.4  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223488  normal  0.163349 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0520  acylphosphatase  42.19 
 
 
95 aa  57  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.230918  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0086  acylphosphatase  34.09 
 
 
91 aa  57  0.00000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.186616  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4329  acylphosphatase  41.54 
 
 
92 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.41249  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6207  acylphosphatase  39.56 
 
 
91 aa  56.6  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0986  acylphosphatase  35.37 
 
 
89 aa  56.6  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000580623  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3370  hypothetical protein  45.9 
 
 
95 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2243  acylphosphatase  40.51 
 
 
95 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0522  acylphosphatase  43.75 
 
 
89 aa  55.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.606766 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1449  acylphosphatase  38.16 
 
 
89 aa  56.2  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000172052  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1396  acylphosphatase  35.63 
 
 
90 aa  56.2  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4846  acylphosphatase  37.5 
 
 
101 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4554  acylphosphatase  46.3 
 
 
86 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.640639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>