293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2164 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_2164  acylphosphatase  100 
 
 
99 aa  196  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1735  acylphosphatase  81.82 
 
 
99 aa  168  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.100754 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3350  acylphosphatase  58.59 
 
 
99 aa  127  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.200593  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4900  putative acylphosphatase  58.16 
 
 
100 aa  113  8.999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.164236 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3583  acylphosphatase  52.04 
 
 
99 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3091  acylphosphatase  52.53 
 
 
99 aa  104  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.937205  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2369  acylphosphatase  52.53 
 
 
99 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631036  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4771  acylphosphatase  53.47 
 
 
99 aa  93.6  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000297446  normal  0.0367606 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3186  acylphosphatase  61.33 
 
 
93 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.341128  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2998  acylphosphatase  61.33 
 
 
94 aa  92  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.593748  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3223  acylphosphatase  62.67 
 
 
94 aa  92  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.237355  normal  0.7882 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2654  acylphosphatase  54.44 
 
 
91 aa  86.7  9e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.156555  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4711  acylphosphatase  59.26 
 
 
97 aa  86.3  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0372  acylphosphatase  58.24 
 
 
94 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.404855 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2230  acylphosphatase  56.58 
 
 
98 aa  84.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.595414 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1322  acylphosphatase  46.15 
 
 
101 aa  81.6  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0315179  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1891  acylphosphatase  59.72 
 
 
92 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1316  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3384  acylphosphatase  56.34 
 
 
94 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3149  acylphosphatase  50 
 
 
96 aa  78.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000748736  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3279  acylphosphatase  56 
 
 
92 aa  79  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000800863 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3607  acylphosphatase  48.68 
 
 
110 aa  77.4  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0899906 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2947  acylphosphatase  48.53 
 
 
96 aa  77  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2011  acylphosphatase  56.06 
 
 
94 aa  77  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2746  acylphosphatase  58.46 
 
 
94 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.352229  normal  0.313982 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3795  acylphosphatase  46.32 
 
 
96 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.524231 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2680  acylphosphatase  47.13 
 
 
91 aa  75.5  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.174548  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08420  cylphosphatase  49.35 
 
 
95 aa  74.7  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0085  acylphosphatase  50.54 
 
 
107 aa  74.7  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.49451 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1216  acylphosphatase  43.18 
 
 
93 aa  74.3  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4329  acylphosphatase  51.32 
 
 
92 aa  73.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.41249  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1169  acylphosphatase  48 
 
 
91 aa  73.6  0.0000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4125  acylphosphatase  46.51 
 
 
98 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0151  acylphosphatase  52.63 
 
 
97 aa  72.8  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4069  acylphosphatase  44.59 
 
 
92 aa  72  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0862  acylphosphatase  51.95 
 
 
93 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4481  acylphosphatase  54.41 
 
 
101 aa  71.2  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7041  acylphosphatase  47.67 
 
 
97 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.925608  hitchhiker  0.000175796 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0023  acylphosphatase  48.84 
 
 
97 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1427  acylphosphatase  52 
 
 
97 aa  70.9  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223488  normal  0.163349 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1796  acylphosphatase  48 
 
 
92 aa  70.5  0.000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.333863  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0889  acylphosphatase  50.75 
 
 
91 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1706  acylphosphatase  41.1 
 
 
90 aa  69.7  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.531567  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1304  acylphosphatase  47.06 
 
 
91 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000789837  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22230  acylphosphatase  56.94 
 
 
99 aa  69.3  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0240  acylphosphatase  52.63 
 
 
93 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4339  acylphosphatase  53.62 
 
 
99 aa  68.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0201054  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0311  acylphosphatase  50.67 
 
 
93 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.422172  normal  0.0299279 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0703  acylphosphatase  50.7 
 
 
92 aa  68.9  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1245  acylphosphatase  44 
 
 
95 aa  68.2  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0859  putative acylphosphatase  56.52 
 
 
89 aa  68.2  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000124258  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0599  acylphosphatase  43.9 
 
 
101 aa  68.2  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0770  acylphosphatase  49.33 
 
 
92 aa  68.6  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1584  acylphosphatase  47.87 
 
 
108 aa  68.2  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0729  acylphosphatase  59.21 
 
 
93 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0255  acylphosphatase  55.84 
 
 
95 aa  67.8  0.00000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.714232 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1480  acylphosphatase  45.57 
 
 
94 aa  67.8  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0319671  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2214  putative acylphosphatase  42.86 
 
 
92 aa  67.8  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000119886  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4152  acylphosphatase  50.68 
 
 
97 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0009  acylphosphatase  50.68 
 
 
97 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0730  acylphosphatase  59.21 
 
 
93 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1977  acylphosphatase  46.58 
 
 
95 aa  67.4  0.00000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.560432  normal  0.812753 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2406  acylphosphatase  50 
 
 
92 aa  67.4  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.31927  normal  0.925907 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6189  acylphosphatase  40 
 
 
102 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4198  acylphosphatase  52 
 
 
94 aa  67.4  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0019532  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0219  putative acylphosphatase protein  43.75 
 
 
119 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0405  acylphosphatase  39.76 
 
 
90 aa  66.2  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0787  acylphosphatase  45.16 
 
 
110 aa  66.2  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1185  acylphosphatase  48.65 
 
 
92 aa  65.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0824  acylphosphatase  51.32 
 
 
108 aa  65.5  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0694  acylphosphatase  56.58 
 
 
93 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.509759  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1419  acylphosphatase  52.17 
 
 
92 aa  65.5  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1865  acylphosphatase  48 
 
 
100 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3638  DNA ligase D, 3'-phosphoesterase domain protein  49.37 
 
 
252 aa  64.7  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0783731  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1158  acylphosphatase  46.67 
 
 
94 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0933267  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0042  acylphosphatase  40 
 
 
90 aa  64.3  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1812  acylphosphatase  46.67 
 
 
97 aa  64.3  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2243  acylphosphatase  43.18 
 
 
95 aa  63.9  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1146  acylphosphatase  44.3 
 
 
93 aa  63.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137289  normal  0.225824 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0745  acylphosphatase  49.25 
 
 
117 aa  63.5  0.0000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.492264  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1192  acylphosphatase  44.3 
 
 
93 aa  63.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1124  acylphosphatase  44.3 
 
 
93 aa  63.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  1.8259399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1158  acylphosphatase  44.3 
 
 
93 aa  63.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.216126  normal  0.513068 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1716  acylphosphatase  50 
 
 
93 aa  63.5  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000101765  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1294  acylphosphatase  44 
 
 
95 aa  63.5  0.0000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1041  acylphosphatase  44.3 
 
 
93 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.860635  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0300  acylphosphatase  52.86 
 
 
95 aa  63.2  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3245  acylphosphatase  44 
 
 
95 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0794  acylphosphatase  54.69 
 
 
110 aa  63.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.364443  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3085  acylphosphatase  48.05 
 
 
112 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.842982 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1869  acylphosphatase  43.94 
 
 
90 aa  62  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3370  hypothetical protein  48.1 
 
 
95 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02367  acylphosphatase  37.33 
 
 
90 aa  62.4  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0713  acylphosphatase  42.31 
 
 
92 aa  62  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.527846  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0214  acylphosphatase  47.69 
 
 
95 aa  61.6  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3568  acylphosphatase  48.53 
 
 
95 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0920  acylphosphatase  41.79 
 
 
91 aa  62  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3184  acylphosphatase  43.48 
 
 
95 aa  62  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.678514  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2539  acylphosphatase  48.57 
 
 
92 aa  62  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0210008  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7993  Acylphosphatase-like protein  50 
 
 
91 aa  61.6  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888786  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4846  acylphosphatase  40.91 
 
 
101 aa  62  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>