276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1865 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1865  acylphosphatase  100 
 
 
100 aa  204  4e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3085  acylphosphatase  63.89 
 
 
112 aa  88.2  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.842982 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1812  acylphosphatase  54.12 
 
 
97 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0372  acylphosphatase  47.06 
 
 
94 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.404855 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7993  Acylphosphatase-like protein  54.05 
 
 
91 aa  72.4  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888786  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1735  acylphosphatase  46.91 
 
 
99 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.100754 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2011  acylphosphatase  45.78 
 
 
94 aa  71.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0405  acylphosphatase  44.3 
 
 
90 aa  70.9  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3607  acylphosphatase  44.68 
 
 
110 aa  70.1  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0899906 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3186  acylphosphatase  46.34 
 
 
93 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.341128  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08420  cylphosphatase  36.67 
 
 
95 aa  68.9  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0151  acylphosphatase  47.44 
 
 
97 aa  68.9  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3123  acylphosphatase-like protein  44.57 
 
 
89 aa  67.4  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.555032  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2230  acylphosphatase  50.77 
 
 
98 aa  67.4  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.595414 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0560  acylphosphatase  48.24 
 
 
96 aa  67.4  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.373142  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1869  acylphosphatase  42.47 
 
 
90 aa  67  0.00000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1730  acylphosphatase  41.46 
 
 
90 aa  67  0.00000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00133501  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1206  acylphosphatase  42.31 
 
 
89 aa  66.6  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2164  acylphosphatase  48 
 
 
99 aa  65.5  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2214  putative acylphosphatase  42.22 
 
 
92 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000119886  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1706  acylphosphatase  43.42 
 
 
90 aa  63.9  0.0000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.531567  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1891  acylphosphatase  50.7 
 
 
92 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1316  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0859  putative acylphosphatase  47.22 
 
 
89 aa  63.9  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000124258  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1322  acylphosphatase  52.31 
 
 
101 aa  63.2  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0315179  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1505  acylphosphatase  47.3 
 
 
90 aa  62.4  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1692  acylphosphatase  38.2 
 
 
91 aa  62  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.205499 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0745  acylphosphatase  40 
 
 
117 aa  62.4  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.492264  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1304  acylphosphatase  42.86 
 
 
91 aa  62  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000789837  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2443  acylphosphatase-like protein  64.58 
 
 
68 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3350  acylphosphatase  44.93 
 
 
99 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.200593  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3223  acylphosphatase  47.22 
 
 
94 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.237355  normal  0.7882 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3583  acylphosphatase  36.36 
 
 
99 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3029  acylphosphatase  42.68 
 
 
90 aa  62  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.14564  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1288  acylphosphatase  43.48 
 
 
94 aa  62  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0163  acylphosphatase  37.21 
 
 
93 aa  62  0.000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6574  acylphosphatase  43.37 
 
 
97 aa  61.6  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0888  acylphosphatase  40.48 
 
 
89 aa  61.2  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000010114  n/a   
 
 
 
NC_010730  SYO3AOP1_1449  acylphosphatase  42.86 
 
 
89 aa  61.6  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000172052  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2998  acylphosphatase  42.17 
 
 
94 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.593748  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10920  acylphosphatase  46.43 
 
 
393 aa  60.8  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.551581  normal  0.319268 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4900  putative acylphosphatase  39.78 
 
 
100 aa  60.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.164236 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1571  acylphosphatase  46.25 
 
 
95 aa  60.1  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00643387  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3795  acylphosphatase  46.27 
 
 
96 aa  60.1  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.524231 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4198  acylphosphatase  42.11 
 
 
94 aa  59.7  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0019532  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2075  acylphosphatase  48.57 
 
 
107 aa  59.3  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.172008  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3149  acylphosphatase  37.21 
 
 
96 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000748736  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2947  acylphosphatase  37.21 
 
 
96 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1283  acylphosphatase  43.84 
 
 
91 aa  59.3  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.380051  normal  0.379678 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1853  acylphosphatase  39.74 
 
 
91 aa  58.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1848  acylphosphatase  37.78 
 
 
91 aa  58.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1932  acylphosphatase  45.57 
 
 
94 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0487108  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0713  acylphosphatase  47.83 
 
 
92 aa  57.8  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.527846  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3091  acylphosphatase  35.96 
 
 
99 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.937205  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1952  acylphosphatase  45.57 
 
 
94 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247986  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1998  acylphosphatase  45.57 
 
 
94 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.635569  normal  0.522288 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4189  acylphosphatase  47.89 
 
 
94 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.702907  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4554  acylphosphatase  50.77 
 
 
86 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.640639  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2654  acylphosphatase  47.62 
 
 
91 aa  57.8  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.156555  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2539  acylphosphatase  42.05 
 
 
92 aa  57.8  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0210008  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2680  acylphosphatase  41.67 
 
 
91 aa  57.8  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.174548  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4771  acylphosphatase  42.67 
 
 
99 aa  57.4  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000297446  normal  0.0367606 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1431  hydrogenase maturation protein HypF  40.26 
 
 
742 aa  57.4  0.00000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4339  acylphosphatase  46.97 
 
 
99 aa  57.4  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0201054  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1169  acylphosphatase  42.86 
 
 
91 aa  57.4  0.00000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3282  acylphosphatase  49.23 
 
 
92 aa  57.4  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.297011 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0889  acylphosphatase  37.78 
 
 
91 aa  57  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2243  acylphosphatase  45.21 
 
 
95 aa  57  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3443  acylphosphatase  36.26 
 
 
92 aa  57  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2746  acylphosphatase  45.33 
 
 
94 aa  57  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.352229  normal  0.313982 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0730  acylphosphatase  46.15 
 
 
93 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0920  acylphosphatase  43.24 
 
 
91 aa  56.6  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3210  acylphosphatase  40.23 
 
 
92 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00151409  hitchhiker  0.00225794 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2257  acylphosphatase  38.46 
 
 
88 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.265908 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09560  acylphosphatase  48.61 
 
 
98 aa  56.2  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1216  acylphosphatase  36.96 
 
 
93 aa  56.6  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02367  acylphosphatase  36.49 
 
 
90 aa  56.2  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2369  acylphosphatase  38.64 
 
 
99 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631036  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1839  acylphosphatase  43.37 
 
 
90 aa  56.2  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.831487  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2619  acylphosphatase  40.23 
 
 
92 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1686  acylphosphatase  46.88 
 
 
88 aa  56.2  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.333589  normal  0.382627 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1183  acylphosphatase  43.06 
 
 
92 aa  56.6  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.858645  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2530  acylphosphatase  40.23 
 
 
92 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.306115  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51920  acylphosphatase  49.23 
 
 
91 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00243945 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5955  acylphosphatase  50 
 
 
95 aa  55.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.924836  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2174  acylphosphatase  45.83 
 
 
93 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0703  acylphosphatase  44 
 
 
92 aa  56.2  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2778  acylphosphatase  43.9 
 
 
89 aa  55.1  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  0.15284 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3384  acylphosphatase  39.47 
 
 
94 aa  55.1  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1323  acylphosphatase  43.08 
 
 
96 aa  55.1  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1283  acylphosphatase  35.9 
 
 
91 aa  54.7  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0824  acylphosphatase  38.89 
 
 
108 aa  54.7  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1219  acylphosphatase  42.47 
 
 
92 aa  54.3  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0694  acylphosphatase  41.76 
 
 
93 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.509759  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2688  acylphosphatase  40.7 
 
 
92 aa  54.3  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2228  acylphosphatase  36.84 
 
 
89 aa  54.3  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1940  acylphosphatase  36.84 
 
 
89 aa  54.3  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4329  acylphosphatase  37.65 
 
 
92 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.41249  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4711  acylphosphatase  42.17 
 
 
97 aa  54.3  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1427  acylphosphatase  42.31 
 
 
97 aa  53.9  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223488  normal  0.163349 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0729  acylphosphatase  43.96 
 
 
93 aa  53.9  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>