237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2228 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2228  acylphosphatase  100 
 
 
89 aa  179  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1940  acylphosphatase  100 
 
 
89 aa  179  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0405  acylphosphatase  43.02 
 
 
90 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1206  acylphosphatase  44.3 
 
 
89 aa  73.9  0.0000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1288  acylphosphatase  43.68 
 
 
94 aa  72.8  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3085  acylphosphatase  38.46 
 
 
112 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.842982 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1283  acylphosphatase  41.56 
 
 
91 aa  62.8  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1706  acylphosphatase  47.14 
 
 
90 aa  62.4  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.531567  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1228  acylphosphatase  38.16 
 
 
90 aa  62.4  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00087614  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1227  acylphosphatase  38.16 
 
 
90 aa  62.4  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.130113  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1465  acylphosphatase  46.27 
 
 
567 aa  62.4  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6207  acylphosphatase  43.66 
 
 
91 aa  61.6  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1125  acylphosphatase  46.88 
 
 
578 aa  60.8  0.000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.000234918  normal  0.35011 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2679  acylphosphatase  40.24 
 
 
92 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0713  acylphosphatase  37.97 
 
 
92 aa  59.7  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.527846  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2346  acylphosphatase  46.38 
 
 
92 aa  59.7  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.204273  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00972  predicted acylphosphatase  46.38 
 
 
92 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0682612  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2675  acylphosphatase  46.38 
 
 
92 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000389922  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2149  acylphosphatase  46.38 
 
 
92 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.054782  normal  0.385833 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3607  acylphosphatase  34.94 
 
 
110 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0899906 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1134  acylphosphatase  46.38 
 
 
92 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.35715 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1686  acylphosphatase  41.1 
 
 
88 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.333589  normal  0.382627 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00979  hypothetical protein  46.38 
 
 
92 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.114044  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2628  acylphosphatase  46.38 
 
 
92 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0934833  hitchhiker  0.0000175619 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1571  acylphosphatase  44.78 
 
 
95 aa  58.9  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00643387  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0920  acylphosphatase  37.65 
 
 
91 aa  58.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0151  acylphosphatase  34.18 
 
 
97 aa  58.5  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1216  acylphosphatase  36.36 
 
 
93 aa  58.2  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1692  acylphosphatase  35.96 
 
 
91 aa  57.8  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.205499 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2778  acylphosphatase  37.33 
 
 
89 aa  57.8  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  0.15284 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08420  cylphosphatase  36 
 
 
95 aa  57.4  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0653  acylphosphatase  39.19 
 
 
91 aa  57.4  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4125  acylphosphatase  34.15 
 
 
98 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3350  acylphosphatase  35.87 
 
 
99 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.200593  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0122  acylphosphatase  41.18 
 
 
91 aa  57.4  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1124  acylphosphatase  50 
 
 
93 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  1.8259399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2257  acylphosphatase  41.1 
 
 
88 aa  56.2  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.265908 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1146  acylphosphatase  50 
 
 
93 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137289  normal  0.225824 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1192  acylphosphatase  50 
 
 
93 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1041  acylphosphatase  50 
 
 
93 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.860635  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1158  acylphosphatase  50 
 
 
93 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.216126  normal  0.513068 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1396  acylphosphatase  46.43 
 
 
90 aa  55.8  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3282  acylphosphatase  38.89 
 
 
92 aa  55.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.297011 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02367  acylphosphatase  37.33 
 
 
90 aa  55.1  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36780  acylphosphatase  40.3 
 
 
91 aa  55.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0023  acylphosphatase  32.93 
 
 
97 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0311  acylphosphatase  32.18 
 
 
93 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.422172  normal  0.0299279 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12937  acylphosphatase  42.86 
 
 
93 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00163956  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1839  acylphosphatase  40.3 
 
 
90 aa  54.7  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.831487  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2174  acylphosphatase  41.27 
 
 
93 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7041  acylphosphatase  32.93 
 
 
97 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.925608  hitchhiker  0.000175796 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0560  acylphosphatase  37.5 
 
 
96 aa  54.7  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.373142  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1865  acylphosphatase  36.84 
 
 
100 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10920  acylphosphatase  43.64 
 
 
393 aa  53.9  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.551581  normal  0.319268 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1765  acylphosphatase  46.43 
 
 
92 aa  53.9  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00140715  hitchhiker  0.00160768 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1812  acylphosphatase  40.3 
 
 
97 aa  53.9  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1628  acylphosphatase  38.2 
 
 
89 aa  53.9  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000020913  normal  0.189828 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2075  acylphosphatase  38.24 
 
 
107 aa  53.9  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.172008  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1283  acylphosphatase  38.81 
 
 
91 aa  53.9  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.380051  normal  0.379678 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1323  acylphosphatase  44.93 
 
 
96 aa  53.9  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4339  acylphosphatase  33.78 
 
 
99 aa  53.9  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0201054  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2248  acylphosphatase  40.51 
 
 
89 aa  53.5  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.946619  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5955  acylphosphatase  36.49 
 
 
95 aa  53.5  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.924836  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0086  acylphosphatase  36.47 
 
 
91 aa  53.5  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.186616  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2355  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.08 
 
 
852 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.218654 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1505  acylphosphatase  44.12 
 
 
90 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0310  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.21 
 
 
792 aa  52.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6574  acylphosphatase  32.89 
 
 
97 aa  53.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2443  acylphosphatase-like protein  46 
 
 
68 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0509  acylphosphatase  36.62 
 
 
87 aa  52.8  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0240  acylphosphatase  29.89 
 
 
93 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1449  acylphosphatase  39.39 
 
 
89 aa  52.8  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000172052  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1219  acylphosphatase  34.15 
 
 
92 aa  51.6  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2164  acylphosphatase  28.21 
 
 
99 aa  52  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09560  acylphosphatase  35.14 
 
 
98 aa  51.6  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3245  acylphosphatase  36.36 
 
 
95 aa  51.2  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0729  acylphosphatase  36.11 
 
 
93 aa  51.2  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0752  acylphosphatase  48.48 
 
 
95 aa  51.6  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.238121  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02098  conserved hypothetical protein  38.36 
 
 
112 aa  51.2  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.121229  normal  0.762264 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1869  acylphosphatase  40.91 
 
 
90 aa  51.2  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1303  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  50 
 
 
781 aa  51.2  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.083014  normal  0.0845078 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2680  acylphosphatase  36.49 
 
 
91 aa  51.2  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.174548  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0918  acylphosphatase  36.49 
 
 
109 aa  51.2  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4554  acylphosphatase  34.72 
 
 
86 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.640639  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0099  acylphosphatase  36.71 
 
 
124 aa  51.2  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.643538  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0397  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.04 
 
 
748 aa  50.8  0.000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0559685  normal  0.676947 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0555  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.63 
 
 
777 aa  50.8  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2214  putative acylphosphatase  38.03 
 
 
92 aa  50.4  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000119886  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1921  acylphosphatase  30.14 
 
 
83 aa  50.4  0.000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1945  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.1 
 
 
816 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368168  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1245  acylphosphatase  36.05 
 
 
95 aa  50.4  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1932  acylphosphatase  38.24 
 
 
94 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0487108  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0888  acylphosphatase  34.33 
 
 
89 aa  50.1  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000010114  n/a   
 
 
 
NC_007796  Mhun_1727  acylphosphatase  48.15 
 
 
158 aa  50.1  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1952  acylphosphatase  38.24 
 
 
94 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247986  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1998  acylphosphatase  38.24 
 
 
94 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.635569  normal  0.522288 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2230  acylphosphatase  45.65 
 
 
98 aa  50.1  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.595414 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2530  acylphosphatase  42.11 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.306115  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2619  acylphosphatase  42.11 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0207  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  48.21 
 
 
748 aa  49.7  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000537624  normal  0.132965 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>