More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0920 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0920  acylphosphatase  100 
 
 		 91 aa  184  3e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0086  acylphosphatase  56.04 
 
 		 91 aa  104  4e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.186616  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2679  acylphosphatase  51.69 
 
 		 92 aa  94.4  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0099  acylphosphatase  50 
 
 		 124 aa  87.8  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.643538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3607  acylphosphatase  44.58 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0899906 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1216  acylphosphatase  45.45 
 
 		 93 aa  77.8  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1977  acylphosphatase  48.84 
 
 		 95 aa  73.2  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.560432  normal  0.812753 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2214  putative acylphosphatase  43.02 
 
 		 92 aa  71.2  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000119886  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1288  acylphosphatase  42.05 
 
 		 94 aa  71.2  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2947  acylphosphatase  44.71 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3149  acylphosphatase  44.71 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000748736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6574  acylphosphatase  45.45 
 
 		 97 aa  70.9  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1449  acylphosphatase  41.18 
 
 		 89 aa  70.5  0.000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000172052  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3583  acylphosphatase  40 
 
 		 99 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0713  acylphosphatase  40.91 
 
 		 92 aa  69.7  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.527846  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0405  acylphosphatase  48 
 
 		 90 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2680  acylphosphatase  48.05 
 
 		 91 aa  69.7  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.174548  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3350  acylphosphatase  42.86 
 
 		 99 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.200593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4125  acylphosphatase  44.3 
 
 		 98 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4069  acylphosphatase  39.29 
 
 		 92 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1245  acylphosphatase  40.23 
 
 		 95 aa  67.8  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0151  acylphosphatase  47.14 
 
 		 97 aa  67  0.00000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1812  acylphosphatase  40.91 
 
 		 97 aa  67  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1228  acylphosphatase  42.53 
 
 		 90 aa  66.2  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00087614  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0122  acylphosphatase  44.94 
 
 		 91 aa  66.6  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1227  acylphosphatase  42.53 
 
 		 90 aa  66.2  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.130113  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3085  acylphosphatase  45.21 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.842982 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1185  acylphosphatase  50.75 
 
 		 92 aa  65.1  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1453  acylphosphatase  42.67 
 
 		 92 aa  65.5  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3682  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  47.37 
 
 		 780 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2835  acylphosphatase  42.05 
 
 		 91 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000760642  hitchhiker  0.000425949 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2526  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  50 
 
 		 780 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.908669  normal  0.241645 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3588  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  50 
 
 		 776 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0023  acylphosphatase  41.77 
 
 		 97 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0745  acylphosphatase  43.06 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.492264  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7041  acylphosphatase  41.77 
 
 		 97 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.925608  hitchhiker  0.000175796 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4771  acylphosphatase  46.48 
 
 		 99 aa  63.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000297446  normal  0.0367606 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4481  acylphosphatase  42.31 
 
 		 101 aa  63.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2369  acylphosphatase  38.2 
 
 		 99 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631036  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4711  acylphosphatase  44.44 
 
 		 97 aa  62.8  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1396  acylphosphatase  41.43 
 
 		 90 aa  63.2  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0509  acylphosphatase  36.78 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1628  acylphosphatase  39.08 
 
 		 89 aa  62.4  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000020913  normal  0.189828 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1809  acylphosphatase  38.64 
 
 		 95 aa  62.4  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000689172  normal  0.0364693 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4339  acylphosphatase  35.96 
 
 		 99 aa  62.4  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0201054  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1692  acylphosphatase  36.47 
 
 		 91 aa  61.6  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.205499 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4097  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  50 
 
 		 789 aa  62  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2164  acylphosphatase  41.79 
 
 		 99 aa  62  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1183  acylphosphatase  43.24 
 
 		 92 aa  61.6  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.858645  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22230  acylphosphatase  43.06 
 
 		 99 aa  61.2  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0770  acylphosphatase  34.09 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1730  acylphosphatase  44.44 
 
 		 90 aa  61.2  0.000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00133501  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1480  acylphosphatase  40.22 
 
 		 94 aa  60.8  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0319671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3091  acylphosphatase  38.2 
 
 		 99 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.937205  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3184  acylphosphatase  37.65 
 
 		 95 aa  60.1  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.678514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0522  acylphosphatase  41.1 
 
 		 89 aa  60.5  0.000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606766 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3186  acylphosphatase  38.46 
 
 		 93 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.341128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3279  acylphosphatase  39.13 
 
 		 92 aa  59.7  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000800863 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2778  acylphosphatase  36.05 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  0.15284 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2654  acylphosphatase  45.45 
 
 		 91 aa  59.7  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.156555  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1211  acylphosphatase  48.08 
 
 		 86 aa  60.1  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0664194  normal  0.0125945 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3230  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.45 
 
 		 783 aa  59.7  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1283  acylphosphatase  34.83 
 
 		 91 aa  59.7  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.380051  normal  0.379678 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4329  acylphosphatase  37.21 
 
 		 92 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.41249  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02098  conserved hypothetical protein  37.35 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.121229  normal  0.762264 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1158  acylphosphatase  36.36 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0933267  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0730  acylphosphatase  39.53 
 
 		 93 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4900  putative acylphosphatase  37.66 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.164236 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09560  acylphosphatase  40.48 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2011  acylphosphatase  39.44 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2230  acylphosphatase  36.36 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.595414 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4189  acylphosphatase  38.82 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.702907  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2257  acylphosphatase  37.93 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.265908 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1869  acylphosphatase  37.93 
 
 		 90 aa  58.5  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2253  acylphosphatase  37.5 
 
 		 90 aa  58.5  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2228  acylphosphatase  37.65 
 
 		 89 aa  58.5  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1940  acylphosphatase  37.65 
 
 		 89 aa  58.5  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3223  acylphosphatase  35.23 
 
 		 94 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.237355  normal  0.7882 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1328  acylphosphatase  39.08 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161573  normal  0.572666 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0214  acylphosphatase  40 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1686  acylphosphatase  41.79 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.333589  normal  0.382627 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2998  acylphosphatase  34.09 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.593748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1706  acylphosphatase  41.89 
 
 		 90 aa  57.8  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.531567  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0729  acylphosphatase  38.37 
 
 		 93 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2406  acylphosphatase  35.23 
 
 		 92 aa  57.4  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.31927  normal  0.925907 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0311  acylphosphatase  34.09 
 
 		 93 aa  57.4  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.422172  normal  0.0299279 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0859  putative acylphosphatase  39.51 
 
 		 89 aa  57.4  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000124258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2240  acylphosphatase  45.95 
 
 		 155 aa  57  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1604  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  53.45 
 
 		 754 aa  56.2  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0240  acylphosphatase  32.95 
 
 		 93 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1865  acylphosphatase  43.24 
 
 		 100 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0163  acylphosphatase  43.94 
 
 		 93 aa  55.8  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1891  acylphosphatase  41.43 
 
 		 92 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1316  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1796  acylphosphatase  43.48 
 
 		 92 aa  55.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.333863  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1921  acylphosphatase  42.42 
 
 		 83 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2729  acylphosphatase  32.58 
 
 		 93 aa  55.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0335058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3132  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.67 
 
 		 758 aa  56.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1888  acylphosphatase  37.21 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000874264  normal  0.143874 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3443  acylphosphatase  33.72 
 
 		 92 aa  56.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0103  acylphosphatase  32.58 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00111331 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>