More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1730 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1730  acylphosphatase  100 
 
 
90 aa  185  2e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00133501  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1227  acylphosphatase  41.49 
 
 
90 aa  72.4  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.130113  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0140  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.32 
 
 
920 aa  72.4  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1228  acylphosphatase  41.49 
 
 
90 aa  72.4  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00087614  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01180  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.33 
 
 
848 aa  68.2  0.00000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1219  acylphosphatase  41.46 
 
 
92 aa  67.8  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1865  acylphosphatase  41.46 
 
 
100 aa  67  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3607  acylphosphatase  44.05 
 
 
110 aa  64.7  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0899906 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1395  acylphosphatase  46.58 
 
 
91 aa  63.9  0.0000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928622  hitchhiker  5.83181e-24 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1288  acylphosphatase  46.97 
 
 
94 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2688  acylphosphatase  37.8 
 
 
92 aa  62  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0080  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.5 
 
 
741 aa  62  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.442925  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3210  acylphosphatase  37.8 
 
 
92 aa  61.6  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00151409  hitchhiker  0.00225794 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2530  acylphosphatase  37.8 
 
 
92 aa  61.6  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.306115  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2619  acylphosphatase  37.8 
 
 
92 aa  61.6  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0920  acylphosphatase  44.44 
 
 
91 aa  61.2  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0681  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.67 
 
 
766 aa  60.8  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2182  acylphosphatase  38.55 
 
 
90 aa  60.1  0.000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.404717  normal  0.46336 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1494  acylphosphatase  47.14 
 
 
89 aa  59.7  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00408889  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0496  acylphosphatase  43.21 
 
 
104 aa  59.7  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00540  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.96 
 
 
785 aa  60.1  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.48639  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1465  acylphosphatase  47.14 
 
 
89 aa  59.7  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.846334  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1396  acylphosphatase  44.44 
 
 
90 aa  59.7  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3123  acylphosphatase-like protein  39.77 
 
 
89 aa  58.9  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.555032  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3638  DNA ligase D, 3'-phosphoesterase domain protein  38.64 
 
 
252 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0783731  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2679  acylphosphatase  38.2 
 
 
92 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0405  acylphosphatase  36.25 
 
 
90 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2848  acylphosphatase  37.93 
 
 
92 aa  58.9  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0241308  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1950  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.47 
 
 
756 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2409  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  34.57 
 
 
840 aa  58.2  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0878931  hitchhiker  0.000263976 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1952  acylphosphatase  47.14 
 
 
94 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247986  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1760  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.78 
 
 
781 aa  58.5  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1998  acylphosphatase  47.14 
 
 
94 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.635569  normal  0.522288 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1853  acylphosphatase  38.96 
 
 
91 aa  58.2  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1917  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.8 
 
 
840 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.998639  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2028  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.26 
 
 
800 aa  57.4  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1910  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  34.57 
 
 
838 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.402426  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1884  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.8 
 
 
837 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2257  acylphosphatase  44.44 
 
 
88 aa  57.4  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.265908 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1932  acylphosphatase  45.71 
 
 
94 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0487108  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1848  acylphosphatase  38.96 
 
 
91 aa  57  0.00000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1146  acylphosphatase  37.35 
 
 
93 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137289  normal  0.225824 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1041  acylphosphatase  37.35 
 
 
93 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.860635  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0712  acylphosphatase  37.5 
 
 
97 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0537883 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2214  putative acylphosphatase  44.26 
 
 
92 aa  56.2  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000119886  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2093  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.08 
 
 
801 aa  56.6  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1192  acylphosphatase  37.35 
 
 
93 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1124  acylphosphatase  37.35 
 
 
93 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  1.8259399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1812  acylphosphatase  40.23 
 
 
97 aa  56.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1158  acylphosphatase  37.35 
 
 
93 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.216126  normal  0.513068 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0151  acylphosphatase  40 
 
 
97 aa  56.2  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7993  Acylphosphatase-like protein  41.03 
 
 
91 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888786  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1480  acylphosphatase  39.76 
 
 
94 aa  55.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0319671  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0099  acylphosphatase  42.86 
 
 
124 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.643538  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2342  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.43 
 
 
766 aa  55.5  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4339  acylphosphatase  39.68 
 
 
99 aa  56.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0201054  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3186  acylphosphatase  32.95 
 
 
93 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.341128  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00972  predicted acylphosphatase  36.14 
 
 
92 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0682612  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2675  acylphosphatase  36.14 
 
 
92 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000389922  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1134  acylphosphatase  36.14 
 
 
92 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.35715 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2628  acylphosphatase  36.14 
 
 
92 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0934833  hitchhiker  0.0000175619 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00979  hypothetical protein  36.14 
 
 
92 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.114044  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0974  acylphosphatase  39.76 
 
 
89 aa  54.7  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3446  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.74 
 
 
764 aa  54.7  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.629954 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1869  acylphosphatase  42.19 
 
 
90 aa  54.3  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4846  acylphosphatase  40 
 
 
101 aa  54.3  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0745  acylphosphatase  37.5 
 
 
117 aa  53.9  0.0000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.492264  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0119  hydrogenase maturation protein HypF  38.1 
 
 
760 aa  54.3  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0111799  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2346  acylphosphatase  34.94 
 
 
92 aa  53.9  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.204273  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0172  carbamoyltransferase hypF  37.65 
 
 
755 aa  53.9  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1385  hydrogenase maturation protein HypF  45.45 
 
 
753 aa  53.5  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1216  acylphosphatase  36.59 
 
 
93 aa  53.5  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1222  acylphosphatase  39.73 
 
 
91 aa  53.5  0.0000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0186184  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3085  acylphosphatase  41.1 
 
 
112 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.842982 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03890  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  29.55 
 
 
751 aa  53.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4097  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.85 
 
 
789 aa  53.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2149  acylphosphatase  35.37 
 
 
92 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.054782  normal  0.385833 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3431  acylphosphatase  41.79 
 
 
94 aa  52.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.708113  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1449  acylphosphatase  41.82 
 
 
89 aa  52.8  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000172052  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2011  acylphosphatase  38.64 
 
 
94 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1304  acylphosphatase  41.67 
 
 
91 aa  52.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000789837  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6574  acylphosphatase  32.1 
 
 
97 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2164  acylphosphatase  40.91 
 
 
99 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2017  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.97 
 
 
773 aa  52.4  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4013  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  45.31 
 
 
770 aa  52.4  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.31364 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2174  acylphosphatase  42.86 
 
 
93 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0915  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.84 
 
 
743 aa  52  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.326313  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4711  acylphosphatase  35.71 
 
 
97 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1735  acylphosphatase  39.13 
 
 
99 aa  51.6  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.100754 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2556  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.11 
 
 
776 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.34978  normal  0.63544 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1809  acylphosphatase  42.47 
 
 
95 aa  52  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000689172  normal  0.0364693 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1323  acylphosphatase  42.19 
 
 
96 aa  52  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4125  acylphosphatase  47.06 
 
 
98 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1765  acylphosphatase  34.48 
 
 
92 aa  52  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00140715  hitchhiker  0.00160768 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0086  acylphosphatase  38.1 
 
 
91 aa  51.2  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.186616  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00352  Hydrogenase maturation protein HypF  38.27 
 
 
768 aa  51.2  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0163  acylphosphatase  39.24 
 
 
93 aa  51.2  0.000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2539  acylphosphatase  36.59 
 
 
92 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0210008  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6177  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.85 
 
 
784 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal  0.0868727 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3588  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.78 
 
 
776 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>