More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1395 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1395  acylphosphatase  100 
 
 
91 aa  187  5e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928622  hitchhiker  5.83181e-24 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1146  acylphosphatase  46.43 
 
 
93 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137289  normal  0.225824 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1124  acylphosphatase  46.43 
 
 
93 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  1.8259399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1192  acylphosphatase  46.43 
 
 
93 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1158  acylphosphatase  46.43 
 
 
93 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.216126  normal  0.513068 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1869  acylphosphatase  43.18 
 
 
90 aa  68.6  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1041  acylphosphatase  45.24 
 
 
93 aa  67.8  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.860635  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2688  acylphosphatase  41.94 
 
 
92 aa  67.4  0.00000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1812  acylphosphatase  38.64 
 
 
97 aa  65.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1228  acylphosphatase  44.78 
 
 
90 aa  65.9  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00087614  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1227  acylphosphatase  44.78 
 
 
90 aa  65.9  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.130113  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1730  acylphosphatase  46.58 
 
 
90 aa  63.9  0.0000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00133501  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0712  acylphosphatase  39.78 
 
 
97 aa  63.9  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0537883 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2346  acylphosphatase  42.68 
 
 
92 aa  63.2  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.204273  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2530  acylphosphatase  39.77 
 
 
92 aa  63.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.306115  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2174  acylphosphatase  43.75 
 
 
93 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3210  acylphosphatase  39.77 
 
 
92 aa  63.5  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00151409  hitchhiker  0.00225794 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2619  acylphosphatase  39.77 
 
 
92 aa  63.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1396  acylphosphatase  46.03 
 
 
90 aa  62.4  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0918  acylphosphatase  38.82 
 
 
109 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1607  acylphosphatase  40.66 
 
 
92 aa  62  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00147413  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1480  acylphosphatase  40.48 
 
 
94 aa  61.6  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0319671  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3843  acylphosphatase  46.88 
 
 
92 aa  62  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0859  putative acylphosphatase  42.11 
 
 
89 aa  62  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000124258  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1211  acylphosphatase  50 
 
 
86 aa  62  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0664194  normal  0.0125945 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0293  acylphosphatase  37.36 
 
 
92 aa  62  0.000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000000572453  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1977  acylphosphatase  46.07 
 
 
95 aa  62  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.560432  normal  0.812753 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00972  predicted acylphosphatase  48.48 
 
 
92 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0682612  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2675  acylphosphatase  48.48 
 
 
92 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000389922  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0681  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  51.52 
 
 
766 aa  61.2  0.000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00979  hypothetical protein  48.48 
 
 
92 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.114044  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2628  acylphosphatase  48.48 
 
 
92 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0934833  hitchhiker  0.0000175619 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6207  acylphosphatase  44.58 
 
 
91 aa  61.2  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1219  acylphosphatase  40 
 
 
92 aa  61.2  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1134  acylphosphatase  48.48 
 
 
92 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.35715 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2149  acylphosphatase  48.48 
 
 
92 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.054782  normal  0.385833 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1932  acylphosphatase  40.48 
 
 
94 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0487108  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0974  acylphosphatase  37.78 
 
 
89 aa  60.1  0.000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2253  acylphosphatase  40.66 
 
 
90 aa  60.1  0.000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1494  acylphosphatase  37.78 
 
 
89 aa  60.5  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00408889  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1465  acylphosphatase  37.78 
 
 
89 aa  60.5  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.846334  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1952  acylphosphatase  40.48 
 
 
94 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247986  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0752  acylphosphatase  45.45 
 
 
95 aa  60.5  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.238121  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1998  acylphosphatase  40.48 
 
 
94 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.635569  normal  0.522288 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1809  acylphosphatase  41.76 
 
 
95 aa  59.7  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000689172  normal  0.0364693 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1283  acylphosphatase  41.46 
 
 
91 aa  60.1  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.380051  normal  0.379678 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1183  acylphosphatase  40.48 
 
 
92 aa  60.1  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.858645  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0713  acylphosphatase  35.56 
 
 
92 aa  59.3  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.527846  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4189  acylphosphatase  38.82 
 
 
94 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.702907  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2848  acylphosphatase  42.67 
 
 
92 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0241308  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09560  acylphosphatase  44.29 
 
 
98 aa  59.3  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2108  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.67 
 
 
803 aa  59.3  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0681  acylphosphatase  37.36 
 
 
91 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.790146 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2539  acylphosphatase  42.5 
 
 
92 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0210008  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1052  acylphosphatase  39.29 
 
 
90 aa  59.3  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.424464  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0653  acylphosphatase  38.82 
 
 
91 aa  58.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1765  acylphosphatase  37.08 
 
 
92 aa  58.5  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00140715  hitchhiker  0.00160768 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10920  acylphosphatase  42.86 
 
 
393 aa  58.5  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.551581  normal  0.319268 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12937  acylphosphatase  37.65 
 
 
93 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00163956  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2093  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.67 
 
 
801 aa  57.8  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1288  acylphosphatase  40.22 
 
 
94 aa  57.8  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3607  acylphosphatase  36.59 
 
 
110 aa  57.4  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0899906 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0509  acylphosphatase  42.19 
 
 
87 aa  57.4  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0999  acylphosphatase  42.86 
 
 
104 aa  57.4  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00530798 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0986  acylphosphatase  35.16 
 
 
89 aa  57  0.00000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000580623  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7993  Acylphosphatase-like protein  40 
 
 
91 aa  57  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888786  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1222  acylphosphatase  40 
 
 
91 aa  56.2  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0186184  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1727  acylphosphatase  36.78 
 
 
158 aa  56.6  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2028  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  34.88 
 
 
800 aa  56.2  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0214  acylphosphatase  39.29 
 
 
95 aa  55.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0163  acylphosphatase  39.53 
 
 
93 aa  56.2  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2342  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.51 
 
 
766 aa  55.8  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1628  acylphosphatase  40 
 
 
89 aa  55.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000020913  normal  0.189828 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1143  acylphosphatase  37.84 
 
 
103 aa  55.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.563511  decreased coverage  0.00936648 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0622  acylphosphatase  38.78 
 
 
97 aa  56.2  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1686  acylphosphatase  41.79 
 
 
88 aa  55.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.333589  normal  0.382627 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1692  acylphosphatase  45 
 
 
91 aa  55.1  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.205499 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0099  acylphosphatase  42.42 
 
 
124 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.643538  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1125  acylphosphatase  50 
 
 
578 aa  55.1  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.000234918  normal  0.35011 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0405  acylphosphatase  37.36 
 
 
90 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4339  acylphosphatase  37.18 
 
 
99 aa  55.5  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0201054  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1328  acylphosphatase  40 
 
 
91 aa  55.1  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161573  normal  0.572666 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1449  acylphosphatase  33.73 
 
 
89 aa  55.1  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000172052  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1796  acylphosphatase  39.02 
 
 
92 aa  54.7  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.333863  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4481  acylphosphatase  46.67 
 
 
101 aa  54.3  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4711  acylphosphatase  37.04 
 
 
97 aa  54.3  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2094  hydrogenase maturation protein HypF  36.47 
 
 
808 aa  53.9  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2257  acylphosphatase  34.83 
 
 
88 aa  53.5  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.265908 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3091  acylphosphatase  36.26 
 
 
99 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.937205  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2075  acylphosphatase  41.82 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.172008  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2513  acylphosphatase  47.37 
 
 
91 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000309341  normal  0.999326 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1950  acylphosphatase  47.37 
 
 
97 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000103444  normal  0.209392 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2160  acylphosphatase  47.37 
 
 
91 aa  53.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290914  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1857  acylphosphatase  28.92 
 
 
94 aa  53.1  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.140554 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1323  acylphosphatase  34.15 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2397  acylphosphatase  47.37 
 
 
91 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221356  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1728  acylphosphatase  38.46 
 
 
90 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.352005  normal  0.358001 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2408  acylphosphatase  47.37 
 
 
91 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000467903  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1875  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  32.94 
 
 
835 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.386195  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2291  acylphosphatase  38.46 
 
 
90 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0355652  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>