250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0974 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0974  acylphosphatase  100 
 
 		 89 aa  181  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1494  acylphosphatase  62.92 
 
 		 89 aa  124  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00408889  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1465  acylphosphatase  62.92 
 
 		 89 aa  124  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.846334  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1228  acylphosphatase  44.16 
 
 		 90 aa  68.6  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00087614  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1227  acylphosphatase  44.16 
 
 		 90 aa  68.6  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.130113  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0812  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.7 
 
 		 769 aa  63.9  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1145  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.21 
 
 		 775 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0080  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.96 
 
 		 741 aa  62.8  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.442925  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1395  acylphosphatase  37.78 
 
 		 91 aa  60.1  0.000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928622  hitchhiker  5.83181e-24 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0797  acylphosphatase  40.54 
 
 		 94 aa  60.1  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.159731  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1449  acylphosphatase  38.1 
 
 		 89 aa  59.3  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000172052  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0099  acylphosphatase  37.35 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.643538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1536  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.64 
 
 		 769 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.18165  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1604  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  43.55 
 
 		 754 aa  58.2  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0086  acylphosphatase  38.2 
 
 		 91 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.186616  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0140  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.16 
 
 		 920 aa  56.2  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1139  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.23 
 
 		 769 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.385051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2409  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  34.83 
 
 		 840 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0878931  hitchhiker  0.000263976 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0417  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.28 
 
 		 735 aa  55.5  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1288  acylphosphatase  34.44 
 
 		 94 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0172  carbamoyltransferase hypF  42.42 
 
 		 755 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0681  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.79 
 
 		 766 aa  54.7  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1730  acylphosphatase  39.76 
 
 		 90 aa  54.7  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00133501  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0023  acylphosphatase  35.71 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2108  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.58 
 
 		 803 aa  53.9  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0713  acylphosphatase  28.89 
 
 		 92 aa  53.5  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.527846  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1884  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  34.83 
 
 		 837 aa  53.5  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1869  acylphosphatase  35.23 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7041  acylphosphatase  35.71 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.925608  hitchhiker  0.000175796 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1328  acylphosphatase  37.93 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161573  normal  0.572666 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3016  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.14 
 
 		 753 aa  53.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0920  acylphosphatase  35.96 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0391  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.06 
 
 		 736 aa  52  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000910038  hitchhiker  0.000000117936 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2214  putative acylphosphatase  36.49 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000119886  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1219  acylphosphatase  40 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1283  acylphosphatase  35.63 
 
 		 91 aa  52.8  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.380051  normal  0.379678 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1427  acylphosphatase  32.18 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223488  normal  0.163349 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1837  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.07 
 
 		 758 aa  52.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03890  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  31.33 
 
 		 751 aa  52.4  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1158  acylphosphatase  33.75 
 
 		 93 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.216126  normal  0.513068 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1211  acylphosphatase  42.47 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0664194  normal  0.0125945 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1146  acylphosphatase  33.75 
 
 		 93 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137289  normal  0.225824 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1041  acylphosphatase  33.75 
 
 		 93 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.860635  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1124  acylphosphatase  33.75 
 
 		 93 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.8259399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0986  acylphosphatase  45.61 
 
 		 89 aa  52  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000580623  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1192  acylphosphatase  33.75 
 
 		 93 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0405  acylphosphatase  33.33 
 
 		 90 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0151  acylphosphatase  34.88 
 
 		 97 aa  51.6  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2835  acylphosphatase  37.78 
 
 		 91 aa  51.6  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000760642  hitchhiker  0.000425949 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0681  acylphosphatase  34.09 
 
 		 91 aa  51.6  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.790146 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0310  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.9 
 
 		 792 aa  51.2  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0476  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.84 
 
 		 773 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1697  acylphosphatase-like protein  43.1 
 
 		 251 aa  51.2  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.294532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0866  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  33.73 
 
 		 1124 aa  50.8  0.000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1910  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.62 
 
 		 838 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.402426  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4125  acylphosphatase  34.52 
 
 		 98 aa  50.8  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1628  acylphosphatase  39.08 
 
 		 89 aa  50.8  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000020913  normal  0.189828 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2593  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.06 
 
 		 773 aa  50.8  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2619  acylphosphatase  38.1 
 
 		 92 aa  50.4  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2530  acylphosphatase  38.1 
 
 		 92 aa  50.4  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.306115  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0509  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.81 
 
 		 773 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3085  acylphosphatase  35.94 
 
 		 112 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.842982 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0950  acylphosphatases-like  43.33 
 
 		 215 aa  50.4  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0722  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  30.67 
 
 		 773 aa  50.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.180457  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3210  acylphosphatase  38.1 
 
 		 92 aa  50.4  0.000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00151409  hitchhiker  0.00225794 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1218  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  33.77 
 
 		 762 aa  50.4  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0610478 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0504  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.5 
 
 		 773 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0119  hydrogenase maturation protein HypF  35.53 
 
 		 760 aa  50.4  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0111799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0926  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  34.38 
 
 		 740 aa  50.4  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154315 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1607  acylphosphatase  38.89 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00147413  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2688  acylphosphatase  36.62 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3682  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.9 
 
 		 780 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0382  hydrogenase maturation protein  34.38 
 
 		 767 aa  50.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1385  hydrogenase maturation protein HypF  35.94 
 
 		 753 aa  50.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2246  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.97 
 
 		 740 aa  49.7  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106897  normal  0.610423 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2848  acylphosphatase  37.68 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0241308  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4097  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  32.88 
 
 		 789 aa  50.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0181  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.26 
 
 		 750 aa  50.1  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.542448  normal  0.19292 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0951  acylphosphatases-like  43.33 
 
 		 208 aa  50.1  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1480  acylphosphatase  36.25 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0319671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0653  acylphosphatase  36.67 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3132  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.5 
 
 		 758 aa  48.9  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1817  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  29.89 
 
 		 836 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4013  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  33.33 
 
 		 770 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.31364 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2780  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  30.38 
 
 		 780 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1130  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.5 
 
 		 758 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1760  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  31.25 
 
 		 781 aa  49.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3636  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.11 
 
 		 758 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0509  acylphosphatase  36.92 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1917  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.21 
 
 		 840 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.998639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0318  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.33 
 
 		 755 aa  48.5  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0792  transcriptional regulatory protein HypF  33.33 
 
 		 732 aa  48.1  0.00004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0531432  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2326  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.64 
 
 		 978 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1432  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  32.05 
 
 		 763 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2094  hydrogenase maturation protein HypF  28.09 
 
 		 808 aa  48.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2679  acylphosphatase  32.93 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1865  acylphosphatase  37.5 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1304  acylphosphatase  34.12 
 
 		 91 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000789837  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2160  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  27.91 
 
 		 840 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.66513 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6574  acylphosphatase  31.03 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>