248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2075 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2075  acylphosphatase  100 
 
 		 107 aa  213  5.9999999999999996e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.172008  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09560  acylphosphatase  64.58 
 
 		 98 aa  118  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5955  acylphosphatase  68.13 
 
 		 95 aa  117  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.924836  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2778  acylphosphatase  66.29 
 
 		 89 aa  114  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  0.15284 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1932  acylphosphatase  64.84 
 
 		 94 aa  114  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0487108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2174  acylphosphatase  63.74 
 
 		 93 aa  113  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1952  acylphosphatase  63.74 
 
 		 94 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247986  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1998  acylphosphatase  63.74 
 
 		 94 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.635569  normal  0.522288 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0653  acylphosphatase  66.67 
 
 		 91 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12937  acylphosphatase  64.77 
 
 		 93 aa  111  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00163956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3431  acylphosphatase  68.97 
 
 		 94 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.708113  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4189  acylphosphatase  61.36 
 
 		 94 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.702907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7993  Acylphosphatase-like protein  62.5 
 
 		 91 aa  106  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888786  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0214  acylphosphatase  62.37 
 
 		 95 aa  105  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1571  acylphosphatase  60.64 
 
 		 95 aa  103  5e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00643387  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1888  acylphosphatase  57.65 
 
 		 88 aa  92.4  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000874264  normal  0.143874 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1572  acylphosphatase  52.88 
 
 		 105 aa  90.5  7e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.100357 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1143  acylphosphatase  46.67 
 
 		 103 aa  77.4  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.563511  decreased coverage  0.00936648 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10920  acylphosphatase  46.85 
 
 		 393 aa  76.3  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.551581  normal  0.319268 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0999  acylphosphatase  47.52 
 
 		 104 aa  74.3  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00530798 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1812  acylphosphatase  48.31 
 
 		 97 aa  72.8  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3598  acylphosphatase  50 
 
 		 89 aa  72  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2257  acylphosphatase  51.47 
 
 		 88 aa  71.2  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.265908 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1686  acylphosphatase  51.19 
 
 		 88 aa  70.9  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.333589  normal  0.382627 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1692  acylphosphatase  46.43 
 
 		 91 aa  70.9  0.000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.205499 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1146  acylphosphatase  46.67 
 
 		 93 aa  69.3  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137289  normal  0.225824 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2149  acylphosphatase  48.28 
 
 		 92 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.054782  normal  0.385833 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1158  acylphosphatase  46.67 
 
 		 93 aa  69.3  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.216126  normal  0.513068 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1192  acylphosphatase  46.67 
 
 		 93 aa  69.3  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1124  acylphosphatase  46.67 
 
 		 93 aa  69.3  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.8259399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1041  acylphosphatase  46.67 
 
 		 93 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.860635  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2346  acylphosphatase  48.28 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.204273  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00972  predicted acylphosphatase  48.28 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0682612  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2675  acylphosphatase  48.28 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000389922  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2628  acylphosphatase  48.28 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0934833  hitchhiker  0.0000175619 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00979  hypothetical protein  48.28 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.114044  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1134  acylphosphatase  48.28 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.35715 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0918  acylphosphatase  42.71 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0372  acylphosphatase  47.62 
 
 		 94 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.404855 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1869  acylphosphatase  40.48 
 
 		 90 aa  64.7  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2539  acylphosphatase  50.79 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0210008  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3607  acylphosphatase  44.3 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0899906 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1323  acylphosphatase  51.52 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0099  acylphosphatase  39.77 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.643538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1765  acylphosphatase  46.74 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00140715  hitchhiker  0.00160768 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0509  acylphosphatase  53.62 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2230  acylphosphatase  40.51 
 
 		 98 aa  62  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.595414 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1480  acylphosphatase  52.38 
 
 		 94 aa  62.4  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0319671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2530  acylphosphatase  46.03 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.306115  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2619  acylphosphatase  46.03 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3210  acylphosphatase  46.03 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00151409  hitchhiker  0.00225794 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2848  acylphosphatase  45.56 
 
 		 92 aa  60.8  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0241308  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2214  putative acylphosphatase  44 
 
 		 92 aa  60.8  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000119886  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0824  acylphosphatase  43.82 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0311  acylphosphatase  43.21 
 
 		 93 aa  60.5  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.422172  normal  0.0299279 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4771  acylphosphatase  43.01 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000297446  normal  0.0367606 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1304  acylphosphatase  38.82 
 
 		 91 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000789837  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1125  acylphosphatase  49.09 
 
 		 578 aa  59.3  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.000234918  normal  0.35011 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1865  acylphosphatase  48.57 
 
 		 100 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1891  acylphosphatase  47.62 
 
 		 92 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1316  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2443  acylphosphatase-like protein  56.52 
 
 		 68 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0770  acylphosphatase  41.86 
 
 		 92 aa  58.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0405  acylphosphatase  41.27 
 
 		 90 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08420  cylphosphatase  37.5 
 
 		 95 aa  58.5  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2835  acylphosphatase  40.85 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000760642  hitchhiker  0.000425949 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1706  acylphosphatase  41.77 
 
 		 90 aa  57.8  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.531567  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1169  acylphosphatase  50 
 
 		 91 aa  57.4  0.00000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1465  acylphosphatase  48.44 
 
 		 567 aa  57  0.00000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4481  acylphosphatase  42.22 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22230  acylphosphatase  39.56 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1809  acylphosphatase  38.57 
 
 		 95 aa  56.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000689172  normal  0.0364693 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0713  acylphosphatase  46.25 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.527846  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3149  acylphosphatase  36.11 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000748736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2947  acylphosphatase  36.11 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4554  acylphosphatase  47.62 
 
 		 86 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.640639  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0560  acylphosphatase  48.15 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.373142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2688  acylphosphatase  50 
 
 		 92 aa  55.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3085  acylphosphatase  48.53 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.842982 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1216  acylphosphatase  41.56 
 
 		 93 aa  55.1  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6574  acylphosphatase  43.53 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3184  acylphosphatase  46.97 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.678514  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1219  acylphosphatase  48.39 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0042  acylphosphatase  46.03 
 
 		 90 aa  54.7  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1839  acylphosphatase  47.95 
 
 		 90 aa  54.3  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.831487  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0910  acylphosphatase  50.77 
 
 		 91 aa  54.3  0.0000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000647443  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2011  acylphosphatase  39.73 
 
 		 94 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1449  acylphosphatase  42.59 
 
 		 89 aa  54.3  0.0000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000172052  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_899  acylphosphatase-like protein  41.67 
 
 		 91 aa  53.9  0.0000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000672405  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4329  acylphosphatase  40.91 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.41249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2228  acylphosphatase  38.24 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1940  acylphosphatase  38.24 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0240  acylphosphatase  41.25 
 
 		 93 aa  53.5  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2164  acylphosphatase  41.54 
 
 		 99 aa  53.5  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4027  acylphosphatase  50 
 
 		 95 aa  53.5  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1427  acylphosphatase  39.24 
 
 		 97 aa  53.5  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223488  normal  0.163349 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1228  acylphosphatase  39.19 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00087614  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2248  acylphosphatase  42.03 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.946619  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1227  acylphosphatase  39.19 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.130113  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1395  acylphosphatase  41.82 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928622  hitchhiker  5.83181e-24 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1328  acylphosphatase  40 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161573  normal  0.572666 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>