205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1143 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1143  acylphosphatase  100 
 
 
103 aa  203  6e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.563511  decreased coverage  0.00936648 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3598  acylphosphatase  70.79 
 
 
89 aa  124  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2174  acylphosphatase  56.82 
 
 
93 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09560  acylphosphatase  56.67 
 
 
98 aa  99.4  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0653  acylphosphatase  55.56 
 
 
91 aa  93.2  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3431  acylphosphatase  58.62 
 
 
94 aa  92  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.708113  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4189  acylphosphatase  52.17 
 
 
94 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.702907  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5955  acylphosphatase  56.82 
 
 
95 aa  89  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.924836  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7993  Acylphosphatase-like protein  54.55 
 
 
91 aa  89  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888786  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2778  acylphosphatase  52.33 
 
 
89 aa  84.3  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  0.15284 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1952  acylphosphatase  51.14 
 
 
94 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247986  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1998  acylphosphatase  51.14 
 
 
94 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.635569  normal  0.522288 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1932  acylphosphatase  51.14 
 
 
94 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0487108  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0214  acylphosphatase  53.33 
 
 
95 aa  82  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1571  acylphosphatase  50.57 
 
 
95 aa  81.6  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00643387  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1869  acylphosphatase  47.62 
 
 
90 aa  79.7  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1572  acylphosphatase  50.49 
 
 
105 aa  80.1  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.100357 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1888  acylphosphatase  52.94 
 
 
88 aa  79  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000874264  normal  0.143874 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12937  acylphosphatase  47.73 
 
 
93 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00163956  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2075  acylphosphatase  46.67 
 
 
107 aa  77.4  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.172008  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0999  acylphosphatase  45.36 
 
 
104 aa  77  0.00000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00530798 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1812  acylphosphatase  46.43 
 
 
97 aa  69.3  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1692  acylphosphatase  44.19 
 
 
91 aa  66.6  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.205499 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0509  acylphosphatase  54.17 
 
 
87 aa  64.3  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1686  acylphosphatase  45.35 
 
 
88 aa  64.7  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.333589  normal  0.382627 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0770  acylphosphatase  37.93 
 
 
92 aa  63.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2257  acylphosphatase  44.19 
 
 
88 aa  63.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.265908 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0730  acylphosphatase  44.83 
 
 
93 aa  62  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1027  acylphosphatase  42.53 
 
 
91 aa  61.2  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0204097  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2848  acylphosphatase  45.12 
 
 
92 aa  61.6  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0241308  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2346  acylphosphatase  47.44 
 
 
92 aa  61.2  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.204273  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0729  acylphosphatase  42.05 
 
 
93 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0311  acylphosphatase  37.93 
 
 
93 aa  61.2  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.422172  normal  0.0299279 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00972  predicted acylphosphatase  46.15 
 
 
92 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0682612  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2675  acylphosphatase  46.15 
 
 
92 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000389922  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2539  acylphosphatase  50 
 
 
92 aa  59.7  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0210008  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00979  hypothetical protein  46.15 
 
 
92 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.114044  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2628  acylphosphatase  46.15 
 
 
92 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0934833  hitchhiker  0.0000175619 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1134  acylphosphatase  46.15 
 
 
92 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.35715 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0910  acylphosphatase  42.53 
 
 
91 aa  60.1  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000647443  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0694  acylphosphatase  42.53 
 
 
93 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.509759  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0918  acylphosphatase  44.44 
 
 
109 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1052  acylphosphatase  43.75 
 
 
90 aa  58.9  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.424464  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1396  acylphosphatase  38.55 
 
 
90 aa  59.3  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2149  acylphosphatase  44.87 
 
 
92 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.054782  normal  0.385833 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0099  acylphosphatase  38.1 
 
 
124 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.643538  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1765  acylphosphatase  45.68 
 
 
92 aa  57.8  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00140715  hitchhiker  0.00160768 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0859  putative acylphosphatase  39.33 
 
 
89 aa  57.4  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000124258  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10920  acylphosphatase  42.86 
 
 
393 aa  57  0.00000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.551581  normal  0.319268 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3282  acylphosphatase  37.93 
 
 
92 aa  56.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.297011 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1146  acylphosphatase  42.05 
 
 
93 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137289  normal  0.225824 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1041  acylphosphatase  42.05 
 
 
93 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.860635  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1158  acylphosphatase  42.05 
 
 
93 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.216126  normal  0.513068 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1395  acylphosphatase  37.84 
 
 
91 aa  55.5  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928622  hitchhiker  5.83181e-24 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1124  acylphosphatase  42.05 
 
 
93 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  1.8259399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1192  acylphosphatase  42.05 
 
 
93 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1125  acylphosphatase  48.33 
 
 
578 aa  55.8  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.000234918  normal  0.35011 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1465  acylphosphatase  54.9 
 
 
567 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0151  acylphosphatase  44.3 
 
 
97 aa  55.5  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_899  acylphosphatase-like protein  39.08 
 
 
91 aa  55.5  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000672405  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1219  acylphosphatase  43.59 
 
 
92 aa  54.7  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0240  acylphosphatase  36.59 
 
 
93 aa  55.1  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1323  acylphosphatase  36.78 
 
 
96 aa  54.3  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2619  acylphosphatase  41.03 
 
 
92 aa  53.9  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3210  acylphosphatase  41.03 
 
 
92 aa  53.9  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00151409  hitchhiker  0.00225794 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2530  acylphosphatase  41.03 
 
 
92 aa  53.9  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.306115  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4027  acylphosphatase  50 
 
 
95 aa  53.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0824  acylphosphatase  38.04 
 
 
108 aa  53.5  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0681  acylphosphatase  39.08 
 
 
91 aa  53.5  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.790146 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3162  hypothetical protein  30.23 
 
 
121 aa  52  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.618579  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0794  acylphosphatase  40.96 
 
 
110 aa  51.6  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.364443  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2688  acylphosphatase  44.59 
 
 
92 aa  52  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1227  acylphosphatase  42.86 
 
 
90 aa  51.6  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.130113  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51920  acylphosphatase  44.44 
 
 
91 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00243945 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1228  acylphosphatase  42.86 
 
 
90 aa  51.6  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00087614  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0397  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.96 
 
 
748 aa  51.2  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0559685  normal  0.676947 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1977  acylphosphatase  39.33 
 
 
95 aa  51.2  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.560432  normal  0.812753 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1169  acylphosphatase  37.5 
 
 
91 aa  51.2  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1480  acylphosphatase  44.59 
 
 
94 aa  51.2  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0319671  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1245  acylphosphatase  35.14 
 
 
95 aa  51.2  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2835  acylphosphatase  34.72 
 
 
91 aa  50.8  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000760642  hitchhiker  0.000425949 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4339  acylphosphatase  43.94 
 
 
99 aa  50.4  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0201054  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1328  acylphosphatase  35.62 
 
 
91 aa  50.4  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161573  normal  0.572666 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6574  acylphosphatase  45.59 
 
 
97 aa  49.7  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1449  acylphosphatase  33.77 
 
 
89 aa  50.1  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000172052  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1206  acylphosphatase  42.19 
 
 
89 aa  49.7  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08420  cylphosphatase  36.49 
 
 
95 aa  49.7  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4554  acylphosphatase  43.02 
 
 
86 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.640639  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3443  acylphosphatase  34.72 
 
 
92 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3085  acylphosphatase  47.62 
 
 
112 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.842982 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0948  acylphosphatase  32.56 
 
 
201 aa  49.3  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0949  acylphosphatases-like  31.4 
 
 
229 aa  48.9  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0122  acylphosphatase  48.21 
 
 
91 aa  48.5  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1796  acylphosphatase  34.83 
 
 
92 aa  48.5  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.333863  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0042  acylphosphatase  47.37 
 
 
90 aa  48.5  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1809  acylphosphatase  31.94 
 
 
95 aa  48.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000689172  normal  0.0364693 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1208  acylphosphatase  61.54 
 
 
566 aa  48.1  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4555  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.03 
 
 
785 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1730  acylphosphatase  37.33 
 
 
90 aa  48.1  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00133501  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1183  acylphosphatase  48.21 
 
 
92 aa  48.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.858645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>