More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1228 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1228  acylphosphatase  100 
 
 
90 aa  184  4e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00087614  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1227  acylphosphatase  100 
 
 
90 aa  184  4e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.130113  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0023  acylphosphatase  53.09 
 
 
97 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0140  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  47.19 
 
 
920 aa  80.1  0.000000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7041  acylphosphatase  51.85 
 
 
97 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.925608  hitchhiker  0.000175796 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1812  acylphosphatase  46.59 
 
 
97 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4125  acylphosphatase  49.38 
 
 
98 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1396  acylphosphatase  53.73 
 
 
90 aa  77  0.00000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0797  acylphosphatase  47.73 
 
 
94 aa  76.6  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.159731  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4069  acylphosphatase  42.53 
 
 
92 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3843  acylphosphatase  46.43 
 
 
92 aa  75.1  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1328  acylphosphatase  47.73 
 
 
91 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161573  normal  0.572666 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1869  acylphosphatase  47.67 
 
 
90 aa  73.9  0.0000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1977  acylphosphatase  51.19 
 
 
95 aa  73.9  0.0000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.560432  normal  0.812753 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0306  hydrogenase maturation protein HypF  48.24 
 
 
763 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2619  acylphosphatase  45.78 
 
 
92 aa  72.8  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0119  hydrogenase maturation protein HypF  44.19 
 
 
760 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0111799  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0080  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  45.45 
 
 
741 aa  73.2  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.442925  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3210  acylphosphatase  45.78 
 
 
92 aa  72.8  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00151409  hitchhiker  0.00225794 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0042  acylphosphatase  39.08 
 
 
90 aa  72.8  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2530  acylphosphatase  45.78 
 
 
92 aa  72.8  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.306115  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1449  acylphosphatase  43.68 
 
 
89 aa  72.8  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000172052  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1730  acylphosphatase  41.49 
 
 
90 aa  72.4  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00133501  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0318  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  47.73 
 
 
755 aa  72  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2214  putative acylphosphatase  40.23 
 
 
92 aa  72  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000119886  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0910  acylphosphatase  47.25 
 
 
91 aa  72  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000647443  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6574  acylphosphatase  42.53 
 
 
97 aa  71.2  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1027  acylphosphatase  47.25 
 
 
91 aa  70.9  0.000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0204097  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1692  acylphosphatase  49.32 
 
 
91 aa  70.9  0.000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.205499 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1219  acylphosphatase  46.99 
 
 
92 aa  69.7  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2947  acylphosphatase  40.23 
 
 
96 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00540  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40 
 
 
785 aa  69.7  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.48639  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2688  acylphosphatase  46.99 
 
 
92 aa  69.3  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0681  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.33 
 
 
766 aa  68.9  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_899  acylphosphatase-like protein  47.25 
 
 
91 aa  69.3  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000672405  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0974  acylphosphatase  44.16 
 
 
89 aa  68.6  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3149  acylphosphatase  39.08 
 
 
96 aa  68.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000748736  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2539  acylphosphatase  45.78 
 
 
92 aa  68.2  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0210008  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1283  acylphosphatase  36.47 
 
 
91 aa  68.2  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0752  acylphosphatase  39.77 
 
 
95 aa  68.2  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.238121  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4339  acylphosphatase  41.38 
 
 
99 aa  68.6  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0201054  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0151  acylphosphatase  46.48 
 
 
97 aa  68.2  0.00000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4481  acylphosphatase  45.68 
 
 
101 aa  67.8  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3638  DNA ligase D, 3'-phosphoesterase domain protein  43.02 
 
 
252 aa  67.4  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0783731  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2848  acylphosphatase  42.05 
 
 
92 aa  67  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0241308  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0207  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.05 
 
 
748 aa  67  0.00000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000537624  normal  0.132965 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0496  acylphosphatase  45.57 
 
 
104 aa  66.2  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0920  acylphosphatase  42.53 
 
 
91 aa  66.2  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0509  acylphosphatase  40 
 
 
87 aa  66.2  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1052  acylphosphatase  45.56 
 
 
90 aa  66.2  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.424464  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6207  acylphosphatase  40.96 
 
 
91 aa  66.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1169  acylphosphatase  41.76 
 
 
91 aa  65.9  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0099  acylphosphatase  43.37 
 
 
124 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.643538  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1395  acylphosphatase  44.78 
 
 
91 aa  65.9  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928622  hitchhiker  5.83181e-24 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1809  acylphosphatase  43.96 
 
 
95 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000689172  normal  0.0364693 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1686  acylphosphatase  37.65 
 
 
88 aa  65.5  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.333589  normal  0.382627 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0163  acylphosphatase  46.38 
 
 
93 aa  65.1  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1480  acylphosphatase  44.05 
 
 
94 aa  65.5  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0319671  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1211  acylphosphatase  41.46 
 
 
86 aa  65.1  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0664194  normal  0.0125945 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1280  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.32 
 
 
746 aa  65.1  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.565285  normal  0.208692 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1628  acylphosphatase  40.91 
 
 
89 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000020913  normal  0.189828 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3636  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  45.24 
 
 
758 aa  64.7  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0405  acylphosphatase  43.42 
 
 
90 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2835  acylphosphatase  45.45 
 
 
91 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000760642  hitchhiker  0.000425949 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2780  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.64 
 
 
780 aa  64.3  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3607  acylphosphatase  46.58 
 
 
110 aa  63.9  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0899906 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1288  acylphosphatase  44 
 
 
94 aa  63.9  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2593  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.05 
 
 
773 aa  63.9  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0926  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.04 
 
 
740 aa  63.9  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154315 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1494  acylphosphatase  45.45 
 
 
89 aa  63.5  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00408889  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2257  acylphosphatase  38.64 
 
 
88 aa  63.5  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.265908 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1465  acylphosphatase  45.45 
 
 
89 aa  63.5  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.846334  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1216  acylphosphatase  43.21 
 
 
93 aa  63.9  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1839  acylphosphatase  43.9 
 
 
90 aa  63.5  0.0000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.831487  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4198  acylphosphatase  43.24 
 
 
94 aa  63.5  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0019532  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2182  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.18 
 
 
752 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.64195  normal  0.285243 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2230  acylphosphatase  40.51 
 
 
98 aa  62.8  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.595414 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2447  acylphosphatase  42.68 
 
 
92 aa  63.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1765  acylphosphatase  40.96 
 
 
92 aa  63.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00140715  hitchhiker  0.00160768 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3230  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.37 
 
 
783 aa  62.8  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2123  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.18 
 
 
752 aa  62  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0252603 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1399  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.53 
 
 
775 aa  62  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.159442  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1158  acylphosphatase  42.86 
 
 
93 aa  62  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.216126  normal  0.513068 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1124  acylphosphatase  42.86 
 
 
93 aa  62  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  1.8259399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0859  putative acylphosphatase  43.53 
 
 
89 aa  62.4  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000124258  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2011  acylphosphatase  40.23 
 
 
94 aa  62  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1505  acylphosphatase  44.71 
 
 
90 aa  62.8  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1146  acylphosphatase  42.86 
 
 
93 aa  62  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137289  normal  0.225824 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1041  acylphosphatase  42.86 
 
 
93 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.860635  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2228  acylphosphatase  38.16 
 
 
89 aa  62.4  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1940  acylphosphatase  38.16 
 
 
89 aa  62.4  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2550  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.16 
 
 
818 aa  62.4  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.51841  normal  0.259672 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1192  acylphosphatase  42.86 
 
 
93 aa  62  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03890  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.23 
 
 
751 aa  62.4  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0722  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.48 
 
 
773 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.180457  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3282  acylphosphatase  48.57 
 
 
92 aa  61.6  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.297011 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1564  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.19 
 
 
745 aa  61.6  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0122  acylphosphatase  39.08 
 
 
91 aa  62  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2346  acylphosphatase  44.58 
 
 
92 aa  62  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.204273  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2628  acylphosphatase  44.58 
 
 
92 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0934833  hitchhiker  0.0000175619 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>