More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0099 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0099  acylphosphatase  100 
 
 
124 aa  255  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.643538  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0122  acylphosphatase  52.81 
 
 
91 aa  89  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0920  acylphosphatase  50 
 
 
91 aa  87.8  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1869  acylphosphatase  50 
 
 
90 aa  81.6  0.000000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0086  acylphosphatase  41.11 
 
 
91 aa  80.9  0.000000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.186616  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1977  acylphosphatase  48.28 
 
 
95 aa  80.1  0.000000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.560432  normal  0.812753 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1812  acylphosphatase  45.45 
 
 
97 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2679  acylphosphatase  42.7 
 
 
92 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3607  acylphosphatase  45.68 
 
 
110 aa  72  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0899906 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1396  acylphosphatase  35.96 
 
 
90 aa  70.9  0.000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1245  acylphosphatase  41.38 
 
 
95 aa  70.5  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0713  acylphosphatase  49.32 
 
 
92 aa  69.7  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.527846  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1328  acylphosphatase  42.7 
 
 
91 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161573  normal  0.572666 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2947  acylphosphatase  39.51 
 
 
96 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3149  acylphosphatase  38.82 
 
 
96 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000748736  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1449  acylphosphatase  41.77 
 
 
89 aa  68.6  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000172052  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22230  acylphosphatase  42.86 
 
 
99 aa  67.4  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1041  acylphosphatase  39.53 
 
 
93 aa  67  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.860635  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1146  acylphosphatase  39.53 
 
 
93 aa  67  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137289  normal  0.225824 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1192  acylphosphatase  39.53 
 
 
93 aa  67  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1124  acylphosphatase  39.53 
 
 
93 aa  67  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  1.8259399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1158  acylphosphatase  39.53 
 
 
93 aa  67  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.216126  normal  0.513068 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1288  acylphosphatase  40.91 
 
 
94 aa  66.2  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0509  acylphosphatase  41.38 
 
 
87 aa  66.2  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2346  acylphosphatase  38.37 
 
 
92 aa  65.5  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.204273  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0151  acylphosphatase  39.39 
 
 
97 aa  65.9  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0372  acylphosphatase  39.77 
 
 
94 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.404855 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2214  putative acylphosphatase  48.61 
 
 
92 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000119886  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1228  acylphosphatase  43.37 
 
 
90 aa  65.5  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00087614  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0522  acylphosphatase  43.53 
 
 
89 aa  65.9  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.606766 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1227  acylphosphatase  43.37 
 
 
90 aa  65.5  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.130113  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2149  acylphosphatase  38.37 
 
 
92 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.054782  normal  0.385833 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00972  predicted acylphosphatase  38.37 
 
 
92 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0682612  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2675  acylphosphatase  38.37 
 
 
92 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000389922  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2628  acylphosphatase  38.37 
 
 
92 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0934833  hitchhiker  0.0000175619 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1216  acylphosphatase  47.22 
 
 
93 aa  64.7  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3230  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.7 
 
 
783 aa  64.7  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00979  hypothetical protein  38.37 
 
 
92 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.114044  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1134  acylphosphatase  38.37 
 
 
92 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.35715 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2257  acylphosphatase  39.77 
 
 
88 aa  64.3  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.265908 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4771  acylphosphatase  45.07 
 
 
99 aa  63.9  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000297446  normal  0.0367606 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3598  acylphosphatase  40 
 
 
89 aa  63.9  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4481  acylphosphatase  41.86 
 
 
101 aa  63.5  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2075  acylphosphatase  39.77 
 
 
107 aa  63.5  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.172008  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2443  acylphosphatase-like protein  46.15 
 
 
68 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1692  acylphosphatase  45.59 
 
 
91 aa  63.5  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.205499 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4711  acylphosphatase  44.44 
 
 
97 aa  63.5  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0794  acylphosphatase  40.23 
 
 
110 aa  62.8  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.364443  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09560  acylphosphatase  38.1 
 
 
98 aa  62.8  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0405  acylphosphatase  38.64 
 
 
90 aa  62  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1785  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.87 
 
 
764 aa  62  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00144703  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2835  acylphosphatase  39.33 
 
 
91 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000760642  hitchhiker  0.000425949 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1480  acylphosphatase  37.65 
 
 
94 aa  61.2  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0319671  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08420  cylphosphatase  37.04 
 
 
95 aa  61.6  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2530  acylphosphatase  41.56 
 
 
92 aa  60.8  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.306115  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3210  acylphosphatase  41.56 
 
 
92 aa  60.8  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00151409  hitchhiker  0.00225794 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2619  acylphosphatase  41.56 
 
 
92 aa  60.8  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0694  acylphosphatase  37.36 
 
 
93 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.509759  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3223  acylphosphatase  36.36 
 
 
94 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.237355  normal  0.7882 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5955  acylphosphatase  38.1 
 
 
95 aa  60.5  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.924836  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1219  acylphosphatase  40.79 
 
 
92 aa  60.5  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1505  acylphosphatase  40.45 
 
 
90 aa  60.5  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2243  acylphosphatase  36.96 
 
 
95 aa  60.5  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2998  acylphosphatase  36.36 
 
 
94 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.593748  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0730  acylphosphatase  38.46 
 
 
93 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3350  acylphosphatase  43.24 
 
 
99 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.200593  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1323  acylphosphatase  35.48 
 
 
96 aa  60.1  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0729  acylphosphatase  36.26 
 
 
93 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1052  acylphosphatase  39.51 
 
 
90 aa  59.7  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.424464  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1304  acylphosphatase  38.67 
 
 
91 aa  58.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000789837  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0974  acylphosphatase  37.35 
 
 
89 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1222  acylphosphatase  34.94 
 
 
91 aa  58.9  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0186184  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3568  acylphosphatase  39.53 
 
 
95 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1686  acylphosphatase  38.37 
 
 
88 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.333589  normal  0.382627 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3843  acylphosphatase  40.54 
 
 
92 aa  58.9  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1809  acylphosphatase  37.5 
 
 
95 aa  58.9  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000689172  normal  0.0364693 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6207  acylphosphatase  37.36 
 
 
91 aa  59.3  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0722  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.47 
 
 
773 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.180457  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3186  acylphosphatase  37.93 
 
 
93 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.341128  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1143  acylphosphatase  38.1 
 
 
103 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.563511  decreased coverage  0.00936648 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0745  acylphosphatase  44.12 
 
 
117 aa  58.5  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.492264  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2654  acylphosphatase  41.98 
 
 
91 aa  58.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.156555  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2246  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  45.33 
 
 
740 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106897  normal  0.610423 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3245  acylphosphatase  40.7 
 
 
95 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2848  acylphosphatase  46.77 
 
 
92 aa  57.8  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0241308  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4097  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  53.03 
 
 
789 aa  58.2  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0023  acylphosphatase  44.62 
 
 
97 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4125  acylphosphatase  41.54 
 
 
98 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4198  acylphosphatase  33.71 
 
 
94 aa  58.2  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0019532  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1572  acylphosphatase  45.31 
 
 
105 aa  58.2  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.100357 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7041  acylphosphatase  46.03 
 
 
97 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.925608  hitchhiker  0.000175796 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1764  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.56 
 
 
767 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0824  acylphosphatase  34.78 
 
 
108 aa  57.4  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1817  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.5 
 
 
836 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1027  acylphosphatase  38.1 
 
 
91 aa  57  0.00000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0204097  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1839  acylphosphatase  37.5 
 
 
90 aa  57.4  0.00000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.831487  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1875  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.5 
 
 
835 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.386195  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4339  acylphosphatase  38.64 
 
 
99 aa  57.4  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0201054  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3583  acylphosphatase  39.19 
 
 
99 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0311  acylphosphatase  33.73 
 
 
93 aa  57  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.422172  normal  0.0299279 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>