More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1222 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1222  acylphosphatase  100 
 
 		 91 aa  188  2e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0186184  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4711  acylphosphatase  39.47 
 
 		 97 aa  67.4  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1396  acylphosphatase  38.82 
 
 		 90 aa  65.1  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1812  acylphosphatase  40.24 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0859  putative acylphosphatase  42.86 
 
 		 89 aa  61.2  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000124258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1847  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.06 
 
 		 779 aa  60.8  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.962683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3607  acylphosphatase  37.8 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0899906 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0099  acylphosphatase  34.94 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.643538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0023  acylphosphatase  37.21 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22230  acylphosphatase  31.76 
 
 		 99 aa  58.9  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4125  acylphosphatase  36.05 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3230  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.48 
 
 		 783 aa  58.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3279  acylphosphatase  44.26 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000800863 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7041  acylphosphatase  36.05 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.925608  hitchhiker  0.000175796 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0255  acylphosphatase  37.08 
 
 		 95 aa  57.4  0.00000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.714232 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1875  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.48 
 
 		 835 aa  57  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.386195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0372  acylphosphatase  37.93 
 
 		 94 aa  57  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.404855 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0300  acylphosphatase  38.2 
 
 		 95 aa  57  0.00000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1910  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  46.38 
 
 		 838 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.402426  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3350  acylphosphatase  38.75 
 
 		 99 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.200593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1245  acylphosphatase  34.07 
 
 		 95 aa  56.6  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1817  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.48 
 
 		 836 aa  57  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2160  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.48 
 
 		 840 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.66513 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1395  acylphosphatase  40 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928622  hitchhiker  5.83181e-24 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1917  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  46.38 
 
 		 840 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.998639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4481  acylphosphatase  38.67 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2409  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  46.38 
 
 		 840 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0878931  hitchhiker  0.000263976 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3880  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.47 
 
 		 778 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.956436 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1607  acylphosphatase  34.41 
 
 		 92 aa  55.1  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00147413  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1760  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.37 
 
 		 781 aa  55.5  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1227  acylphosphatase  31.76 
 
 		 90 aa  55.5  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.130113  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1674  hydrogenase maturation protein HypF  40 
 
 		 771 aa  55.5  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1228  acylphosphatase  31.76 
 
 		 90 aa  55.5  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00087614  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1785  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.47 
 
 		 764 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00144703  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1303  acylphosphatase  43.53 
 
 		 90 aa  54.7  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.427342  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0729  acylphosphatase  36.49 
 
 		 93 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4152  acylphosphatase  38.96 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1884  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.93 
 
 		 837 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2094  hydrogenase maturation protein HypF  44.93 
 
 		 808 aa  53.9  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5955  acylphosphatase  40.68 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.924836  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1796  acylphosphatase  32.56 
 
 		 92 aa  54.3  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.333863  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2342  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.36 
 
 		 766 aa  54.3  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0736  acylphosphatase  31.87 
 
 		 93 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0140  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  33.33 
 
 		 920 aa  53.9  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2164  acylphosphatase  37.14 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2028  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.21 
 
 		 800 aa  53.9  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2359  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.94 
 
 		 777 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.658058  normal  0.0687846 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1735  acylphosphatase  37.14 
 
 		 99 aa  53.5  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.100754 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0151  acylphosphatase  39.06 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3091  acylphosphatase  37.18 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.937205  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1730  acylphosphatase  39.73 
 
 		 90 aa  53.5  0.0000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00133501  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1148  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.74 
 
 		 779 aa  53.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0730  acylphosphatase  36.49 
 
 		 93 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6574  acylphosphatase  36.36 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3583  acylphosphatase  40.58 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2108  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.9 
 
 		 803 aa  53.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2556  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.75 
 
 		 776 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.34978  normal  0.63544 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4771  acylphosphatase  36 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000297446  normal  0.0367606 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0405  acylphosphatase  35.16 
 
 		 90 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1219  acylphosphatase  44.12 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3588  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.05 
 
 		 776 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2230  acylphosphatase  32.18 
 
 		 98 aa  52  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.595414 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4900  putative acylphosphatase  40.58 
 
 		 100 aa  52  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.164236 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3795  acylphosphatase  33.33 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.524231 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0293  acylphosphatase  34.44 
 
 		 92 aa  52.8  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000000572453  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0009  acylphosphatase  37.66 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2679  acylphosphatase  33.33 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2326  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.19 
 
 		 978 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2093  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.25 
 
 		 801 aa  52.4  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0214  acylphosphatase  37.88 
 
 		 95 aa  52  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1216  acylphosphatase  34.67 
 
 		 93 aa  52  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1891  acylphosphatase  43.33 
 
 		 92 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1316  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0787  acylphosphatase  32.22 
 
 		 110 aa  51.6  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1328  acylphosphatase  34.07 
 
 		 91 aa  52  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161573  normal  0.572666 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3638  DNA ligase D, 3'-phosphoesterase domain protein  32.95 
 
 		 252 aa  51.6  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0783731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0469  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.13 
 
 		 818 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.77158  normal  0.0779955 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0496  acylphosphatase  38.81 
 
 		 104 aa  51.2  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0122  acylphosphatase  34.94 
 
 		 91 aa  51.2  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4097  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  33.73 
 
 		 789 aa  51.2  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1952  acylphosphatase  42.19 
 
 		 94 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247986  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2746  acylphosphatase  34.15 
 
 		 94 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.352229  normal  0.313982 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1322  acylphosphatase  38.03 
 
 		 101 aa  51.2  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0315179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6207  acylphosphatase  34.09 
 
 		 91 aa  51.2  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1998  acylphosphatase  42.19 
 
 		 94 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.635569  normal  0.522288 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08420  cylphosphatase  34.09 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1932  acylphosphatase  42.19 
 
 		 94 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0487108  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3370  hypothetical protein  29.76 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2848  acylphosphatase  44.12 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0241308  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0520  acylphosphatase  38.57 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.230918  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1903  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.5 
 
 		 783 aa  50.8  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000745392 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0311  acylphosphatase  34.67 
 
 		 93 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.422172  normal  0.0299279 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1294  acylphosphatase  37.08 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2075  acylphosphatase  38.98 
 
 		 107 aa  50.8  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.172008  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2369  acylphosphatase  43.94 
 
 		 99 aa  50.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631036  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0920  acylphosphatase  39.34 
 
 		 91 aa  50.8  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3029  acylphosphatase  35.9 
 
 		 90 aa  50.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.14564  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0240  acylphosphatase  34.67 
 
 		 93 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4854  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.49 
 
 		 795 aa  50.1  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.623858  normal  0.1985 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2688  acylphosphatase  36.36 
 
 		 92 aa  50.4  0.000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2526  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.68 
 
 		 780 aa  50.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.908669  normal  0.241645 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>