260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3091 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3091  acylphosphatase  100 
 
 		 99 aa  197  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.937205  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3583  acylphosphatase  72.45 
 
 		 99 aa  142  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2369  acylphosphatase  69.7 
 
 		 99 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631036  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3350  acylphosphatase  61.62 
 
 		 99 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.200593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1735  acylphosphatase  55.56 
 
 		 99 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.100754 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2164  acylphosphatase  52.53 
 
 		 99 aa  104  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3795  acylphosphatase  56.84 
 
 		 96 aa  102  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.524231 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4900  putative acylphosphatase  54.74 
 
 		 100 aa  100  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.164236 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3149  acylphosphatase  50 
 
 		 96 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000748736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2947  acylphosphatase  48.72 
 
 		 96 aa  82.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3186  acylphosphatase  50 
 
 		 93 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.341128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4771  acylphosphatase  54.79 
 
 		 99 aa  80.5  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000297446  normal  0.0367606 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2746  acylphosphatase  53.33 
 
 		 94 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.352229  normal  0.313982 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2654  acylphosphatase  53.62 
 
 		 91 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.156555  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3223  acylphosphatase  46.67 
 
 		 94 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.237355  normal  0.7882 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2998  acylphosphatase  46.81 
 
 		 94 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.593748  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3245  acylphosphatase  48.91 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0085  acylphosphatase  47.73 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.49451 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1216  acylphosphatase  44.44 
 
 		 93 aa  72.4  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0824  acylphosphatase  46.15 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3370  hypothetical protein  56 
 
 		 95 aa  72  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2680  acylphosphatase  45.71 
 
 		 91 aa  71.6  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.174548  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4711  acylphosphatase  47.56 
 
 		 97 aa  71.2  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0372  acylphosphatase  52.7 
 
 		 94 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.404855 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1419  acylphosphatase  48.24 
 
 		 92 aa  70.1  0.000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4069  acylphosphatase  42.35 
 
 		 92 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4481  acylphosphatase  48.72 
 
 		 101 aa  69.3  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1891  acylphosphatase  52.11 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1316  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2447  acylphosphatase  45.88 
 
 		 92 aa  68.2  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0520  acylphosphatase  44.71 
 
 		 95 aa  67.8  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.230918  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2011  acylphosphatase  52.94 
 
 		 94 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1158  acylphosphatase  40.4 
 
 		 94 aa  67  0.00000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0933267  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08420  cylphosphatase  42.5 
 
 		 95 aa  67  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1322  acylphosphatase  51.47 
 
 		 101 aa  66.6  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0315179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1185  acylphosphatase  50 
 
 		 92 aa  66.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3568  acylphosphatase  50 
 
 		 95 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7041  acylphosphatase  51.16 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.925608  hitchhiker  0.000175796 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3607  acylphosphatase  41.86 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0899906 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4198  acylphosphatase  45.68 
 
 		 94 aa  65.5  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0019532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0042  acylphosphatase  40.66 
 
 		 90 aa  65.9  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0787  acylphosphatase  42.11 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0859  putative acylphosphatase  44.44 
 
 		 89 aa  65.1  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000124258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1796  acylphosphatase  48.57 
 
 		 92 aa  65.1  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.333863  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0023  acylphosphatase  53.52 
 
 		 97 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4846  acylphosphatase  44.32 
 
 		 101 aa  65.5  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2230  acylphosphatase  46.58 
 
 		 98 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.595414 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4125  acylphosphatase  48.84 
 
 		 98 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0770  acylphosphatase  43.75 
 
 		 92 aa  64.3  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1977  acylphosphatase  44.68 
 
 		 95 aa  63.9  0.0000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.560432  normal  0.812753 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2679  acylphosphatase  39.76 
 
 		 92 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6189  acylphosphatase  44.68 
 
 		 102 aa  62.8  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0311  acylphosphatase  47.14 
 
 		 93 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.422172  normal  0.0299279 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3279  acylphosphatase  47.89 
 
 		 92 aa  62.8  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000800863 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1716  acylphosphatase  39 
 
 		 93 aa  62.4  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000101765  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0730  acylphosphatase  43.01 
 
 		 93 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4329  acylphosphatase  44.71 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.41249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0240  acylphosphatase  46.48 
 
 		 93 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1169  acylphosphatase  38.46 
 
 		 91 aa  61.6  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3029  acylphosphatase  43.01 
 
 		 90 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.14564  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1453  acylphosphatase  41.38 
 
 		 92 aa  61.6  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4152  acylphosphatase  43.59 
 
 		 97 aa  62  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3184  acylphosphatase  42 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.678514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3384  acylphosphatase  44.05 
 
 		 94 aa  60.8  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0009  acylphosphatase  42.31 
 
 		 97 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2406  acylphosphatase  42.86 
 
 		 92 aa  60.5  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.31927  normal  0.925907 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0920  acylphosphatase  38.2 
 
 		 91 aa  60.5  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0729  acylphosphatase  43.01 
 
 		 93 aa  60.5  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1449  acylphosphatase  33.72 
 
 		 89 aa  60.1  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000172052  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3443  acylphosphatase  46.05 
 
 		 92 aa  59.7  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2729  acylphosphatase  36.56 
 
 		 93 aa  59.7  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0335058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1245  acylphosphatase  44.87 
 
 		 95 aa  60.1  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4339  acylphosphatase  41.03 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0201054  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1505  acylphosphatase  47.83 
 
 		 90 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0745  acylphosphatase  40.96 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.492264  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1812  acylphosphatase  45.59 
 
 		 97 aa  59.3  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6207  acylphosphatase  38.16 
 
 		 91 aa  58.9  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0694  acylphosphatase  43.59 
 
 		 93 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.509759  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0300  acylphosphatase  40.82 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1052  acylphosphatase  46.48 
 
 		 90 aa  58.2  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.424464  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0496  acylphosphatase  41.77 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0889  acylphosphatase  36.47 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0103  acylphosphatase  35.71 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00111331 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1427  acylphosphatase  44.44 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223488  normal  0.163349 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1865  acylphosphatase  35.96 
 
 		 100 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1869  acylphosphatase  40 
 
 		 90 aa  57.8  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0219  putative acylphosphatase protein  44.68 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36780  acylphosphatase  45.45 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1304  acylphosphatase  44.29 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000789837  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2243  acylphosphatase  47.95 
 
 		 95 aa  57.4  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3282  acylphosphatase  44.59 
 
 		 92 aa  57.4  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.297011 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0862  acylphosphatase  44.05 
 
 		 93 aa  57  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0713  acylphosphatase  47.22 
 
 		 92 aa  57  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.527846  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0255  acylphosphatase  43.66 
 
 		 95 aa  57  0.00000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.714232 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1183  acylphosphatase  39.33 
 
 		 92 aa  57  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.858645  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2214  putative acylphosphatase  46.15 
 
 		 92 aa  56.2  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000119886  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0599  acylphosphatase  40.26 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1584  acylphosphatase  48.68 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2835  acylphosphatase  37.8 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000760642  hitchhiker  0.000425949 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0086  acylphosphatase  36.36 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.186616  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0405  acylphosphatase  40.28 
 
 		 90 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>