245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0653 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0653  acylphosphatase  100 
 
 
91 aa  180  6e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0214  acylphosphatase  79.12 
 
 
95 aa  143  7.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09560  acylphosphatase  75.56 
 
 
98 aa  134  5e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5955  acylphosphatase  76.14 
 
 
95 aa  133  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.924836  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3431  acylphosphatase  74.16 
 
 
94 aa  130  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.708113  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7993  Acylphosphatase-like protein  71.43 
 
 
91 aa  127  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888786  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2778  acylphosphatase  70.45 
 
 
89 aa  122  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  0.15284 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1932  acylphosphatase  68.54 
 
 
94 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0487108  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1952  acylphosphatase  68.54 
 
 
94 aa  121  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247986  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1998  acylphosphatase  68.54 
 
 
94 aa  121  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.635569  normal  0.522288 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2174  acylphosphatase  67.05 
 
 
93 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12937  acylphosphatase  65.91 
 
 
93 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00163956  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4189  acylphosphatase  64.77 
 
 
94 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.702907  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1888  acylphosphatase  63.95 
 
 
88 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000874264  normal  0.143874 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2075  acylphosphatase  66.67 
 
 
107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.172008  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1571  acylphosphatase  63.33 
 
 
95 aa  109  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00643387  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1572  acylphosphatase  64.52 
 
 
105 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.100357 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1143  acylphosphatase  55.56 
 
 
103 aa  93.2  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.563511  decreased coverage  0.00936648 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10920  acylphosphatase  57.14 
 
 
393 aa  91.7  3e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.551581  normal  0.319268 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3598  acylphosphatase  54.55 
 
 
89 aa  87.4  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1146  acylphosphatase  47.83 
 
 
93 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137289  normal  0.225824 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1158  acylphosphatase  47.83 
 
 
93 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.216126  normal  0.513068 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1041  acylphosphatase  47.83 
 
 
93 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.860635  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1192  acylphosphatase  47.83 
 
 
93 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1124  acylphosphatase  47.83 
 
 
93 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  1.8259399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0999  acylphosphatase  51.69 
 
 
104 aa  78.6  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00530798 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2346  acylphosphatase  48.91 
 
 
92 aa  78.6  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.204273  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2149  acylphosphatase  49.44 
 
 
92 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.054782  normal  0.385833 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2257  acylphosphatase  49.43 
 
 
88 aa  77.8  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.265908 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00972  predicted acylphosphatase  48.91 
 
 
92 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0682612  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2675  acylphosphatase  48.91 
 
 
92 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000389922  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2628  acylphosphatase  48.91 
 
 
92 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0934833  hitchhiker  0.0000175619 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1134  acylphosphatase  48.91 
 
 
92 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.35715 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00979  hypothetical protein  48.91 
 
 
92 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.114044  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1869  acylphosphatase  44.71 
 
 
90 aa  76.6  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3210  acylphosphatase  54.79 
 
 
92 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00151409  hitchhiker  0.00225794 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2619  acylphosphatase  54.79 
 
 
92 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1686  acylphosphatase  49.41 
 
 
88 aa  75.5  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.333589  normal  0.382627 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2530  acylphosphatase  54.79 
 
 
92 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.306115  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1812  acylphosphatase  49.44 
 
 
97 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1692  acylphosphatase  43.82 
 
 
91 aa  72.8  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.205499 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2539  acylphosphatase  52.63 
 
 
92 aa  72.8  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0210008  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0509  acylphosphatase  51.25 
 
 
87 aa  72.8  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1480  acylphosphatase  58.46 
 
 
94 aa  72  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0319671  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0918  acylphosphatase  46.59 
 
 
109 aa  71.2  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1027  acylphosphatase  45.88 
 
 
91 aa  69.7  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0204097  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1465  acylphosphatase  47.06 
 
 
567 aa  69.3  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1765  acylphosphatase  45.74 
 
 
92 aa  69.3  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00140715  hitchhiker  0.00160768 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1219  acylphosphatase  50 
 
 
92 aa  68.2  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1427  acylphosphatase  43.82 
 
 
97 aa  68.2  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223488  normal  0.163349 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08420  cylphosphatase  35.23 
 
 
95 aa  67  0.00000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0910  acylphosphatase  47.62 
 
 
91 aa  66.2  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000647443  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_899  acylphosphatase-like protein  46.43 
 
 
91 aa  66.6  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000672405  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0311  acylphosphatase  40.91 
 
 
93 aa  66.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.422172  normal  0.0299279 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0770  acylphosphatase  42.05 
 
 
92 aa  65.5  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2688  acylphosphatase  46.07 
 
 
92 aa  66.2  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2848  acylphosphatase  47.37 
 
 
92 aa  65.9  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0241308  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1323  acylphosphatase  43.75 
 
 
96 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1706  acylphosphatase  45.95 
 
 
90 aa  63.5  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.531567  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1283  acylphosphatase  41.86 
 
 
91 aa  63.2  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.380051  normal  0.379678 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1169  acylphosphatase  43.24 
 
 
91 aa  62.4  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2214  putative acylphosphatase  41.76 
 
 
92 aa  61.6  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000119886  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0240  acylphosphatase  40.96 
 
 
93 aa  61.6  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1839  acylphosphatase  50 
 
 
90 aa  62  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.831487  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1303  acylphosphatase  43.04 
 
 
90 aa  61.2  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.427342  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02367  acylphosphatase  42.5 
 
 
90 aa  60.8  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3384  acylphosphatase  40.45 
 
 
94 aa  60.5  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0824  acylphosphatase  42.22 
 
 
108 aa  59.7  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1977  acylphosphatase  44.44 
 
 
95 aa  60.1  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.560432  normal  0.812753 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0969  acylphosphatase  42.7 
 
 
94 aa  60.1  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000144451  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0255  acylphosphatase  41.57 
 
 
95 aa  59.3  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.714232 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0729  acylphosphatase  42.22 
 
 
93 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1396  acylphosphatase  38.2 
 
 
90 aa  58.9  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0560  acylphosphatase  55.38 
 
 
96 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.373142  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0730  acylphosphatase  43.33 
 
 
93 aa  58.9  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1395  acylphosphatase  38.82 
 
 
91 aa  58.5  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928622  hitchhiker  5.83181e-24 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1228  acylphosphatase  42.31 
 
 
90 aa  58.2  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00087614  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4481  acylphosphatase  41.86 
 
 
101 aa  58.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1227  acylphosphatase  42.31 
 
 
90 aa  58.2  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.130113  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3607  acylphosphatase  49.23 
 
 
110 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0899906 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1052  acylphosphatase  41.18 
 
 
90 aa  57.8  0.00000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.424464  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4069  acylphosphatase  40 
 
 
92 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0372  acylphosphatase  47.76 
 
 
94 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.404855 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2228  acylphosphatase  39.19 
 
 
89 aa  57.4  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1940  acylphosphatase  39.19 
 
 
89 aa  57.4  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0099  acylphosphatase  38.89 
 
 
124 aa  57  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.643538  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0797  acylphosphatase  38.55 
 
 
94 aa  56.6  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.159731  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0713  acylphosphatase  45.24 
 
 
92 aa  56.2  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.527846  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1857  acylphosphatase  37.63 
 
 
94 aa  56.2  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.140554 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1505  acylphosphatase  46.05 
 
 
90 aa  56.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3149  acylphosphatase  38.75 
 
 
96 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000748736  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0862  acylphosphatase  40.45 
 
 
93 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0703  acylphosphatase  49.32 
 
 
92 aa  56.6  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1125  acylphosphatase  38.1 
 
 
578 aa  56.6  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.000234918  normal  0.35011 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1628  acylphosphatase  42.67 
 
 
89 aa  56.6  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000020913  normal  0.189828 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0300  acylphosphatase  40.45 
 
 
95 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2947  acylphosphatase  38.75 
 
 
96 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2406  acylphosphatase  41.11 
 
 
92 aa  55.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.31927  normal  0.925907 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4027  acylphosphatase  51.19 
 
 
95 aa  55.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2729  acylphosphatase  38.2 
 
 
93 aa  55.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0335058  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>