More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_3085 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_3085  acylphosphatase  100 
 
 
112 aa  228  1e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.842982 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1865  acylphosphatase  63.89 
 
 
100 aa  88.2  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2214  putative acylphosphatase  52.05 
 
 
92 aa  73.6  0.0000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000119886  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6574  acylphosphatase  52.05 
 
 
97 aa  72  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0713  acylphosphatase  54.79 
 
 
92 aa  70.9  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.527846  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1812  acylphosphatase  57.75 
 
 
97 aa  70.9  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0405  acylphosphatase  45.45 
 
 
90 aa  70.5  0.000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2998  acylphosphatase  52.17 
 
 
94 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.593748  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3223  acylphosphatase  52.17 
 
 
94 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.237355  normal  0.7882 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0888  acylphosphatase  43.37 
 
 
89 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000010114  n/a   
 
 
 
NC_008340  Mlg_0522  acylphosphatase  51.32 
 
 
89 aa  68.6  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.606766 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2230  acylphosphatase  48.61 
 
 
98 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.595414 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3607  acylphosphatase  48.84 
 
 
110 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0899906 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1283  acylphosphatase  48.65 
 
 
91 aa  67.4  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.380051  normal  0.379678 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0085  acylphosphatase  52.17 
 
 
107 aa  66.6  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.49451 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0920  acylphosphatase  45.21 
 
 
91 aa  66.2  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4554  acylphosphatase  57.14 
 
 
86 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.640639  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4329  acylphosphatase  53.03 
 
 
92 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.41249  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0372  acylphosphatase  50.65 
 
 
94 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.404855 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0151  acylphosphatase  50 
 
 
97 aa  65.9  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0560  acylphosphatase  52.05 
 
 
96 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.373142  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1977  acylphosphatase  52.78 
 
 
95 aa  65.5  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.560432  normal  0.812753 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0509  acylphosphatase  51.47 
 
 
87 aa  65.1  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1692  acylphosphatase  45.33 
 
 
91 aa  65.1  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.205499 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36780  acylphosphatase  55.07 
 
 
91 aa  65.5  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1449  acylphosphatase  46.88 
 
 
89 aa  64.7  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000172052  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1735  acylphosphatase  46.75 
 
 
99 aa  64.7  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.100754 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2228  acylphosphatase  38.46 
 
 
89 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1940  acylphosphatase  38.46 
 
 
89 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3149  acylphosphatase  49.23 
 
 
96 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000748736  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2011  acylphosphatase  50 
 
 
94 aa  64.3  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0042  acylphosphatase  47.83 
 
 
90 aa  64.7  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2947  acylphosphatase  47.06 
 
 
96 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2257  acylphosphatase  45.33 
 
 
88 aa  64.3  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.265908 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1245  acylphosphatase  45.57 
 
 
95 aa  64.3  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1183  acylphosphatase  48.05 
 
 
92 aa  63.9  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.858645  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4198  acylphosphatase  48.57 
 
 
94 aa  63.9  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0019532  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0745  acylphosphatase  50.7 
 
 
117 aa  63.9  0.0000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.492264  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3186  acylphosphatase  48.48 
 
 
93 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.341128  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0086  acylphosphatase  44 
 
 
91 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.186616  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2243  acylphosphatase  51.47 
 
 
95 aa  62.8  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2164  acylphosphatase  48.05 
 
 
99 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0730  acylphosphatase  54.93 
 
 
93 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4125  acylphosphatase  52 
 
 
98 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1206  acylphosphatase  42.67 
 
 
89 aa  62.4  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08420  cylphosphatase  41.1 
 
 
95 aa  62.4  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0694  acylphosphatase  52.11 
 
 
93 aa  62  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.509759  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2654  acylphosphatase  50 
 
 
91 aa  62  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.156555  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1211  acylphosphatase  37.18 
 
 
86 aa  62  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0664194  normal  0.0125945 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0729  acylphosphatase  53.52 
 
 
93 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22230  acylphosphatase  48.53 
 
 
99 aa  61.6  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3795  acylphosphatase  46.58 
 
 
96 aa  61.2  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.524231 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0163  acylphosphatase  43.28 
 
 
93 aa  60.8  0.000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51920  acylphosphatase  54.55 
 
 
91 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00243945 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1047  acylphosphatase  39.53 
 
 
89 aa  61.2  0.000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1869  acylphosphatase  45.21 
 
 
90 aa  60.8  0.000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3245  acylphosphatase  47.14 
 
 
95 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3123  acylphosphatase-like protein  49.28 
 
 
89 aa  60.8  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.555032  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3184  acylphosphatase  53.12 
 
 
95 aa  60.8  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.678514  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1288  acylphosphatase  42.03 
 
 
94 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3350  acylphosphatase  44.87 
 
 
99 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.200593  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1304  acylphosphatase  46.48 
 
 
91 aa  60.5  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000789837  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3583  acylphosphatase  41.56 
 
 
99 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1216  acylphosphatase  45.33 
 
 
93 aa  60.5  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2679  acylphosphatase  44.74 
 
 
92 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3568  acylphosphatase  49.23 
 
 
95 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2443  acylphosphatase-like protein  64.58 
 
 
68 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3443  acylphosphatase  43.66 
 
 
92 aa  58.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4900  putative acylphosphatase  48.53 
 
 
100 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.164236 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1853  acylphosphatase  44.62 
 
 
91 aa  58.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1227  acylphosphatase  44.44 
 
 
90 aa  59.3  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.130113  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0703  acylphosphatase  42.35 
 
 
92 aa  58.9  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2369  acylphosphatase  44.74 
 
 
99 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631036  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0023  acylphosphatase  53.03 
 
 
97 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1839  acylphosphatase  51.43 
 
 
90 aa  58.9  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.831487  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1706  acylphosphatase  40.51 
 
 
90 aa  58.9  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.531567  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2778  acylphosphatase  50.67 
 
 
89 aa  59.3  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  0.15284 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1891  acylphosphatase  50.79 
 
 
92 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1316  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1228  acylphosphatase  44.44 
 
 
90 aa  59.3  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00087614  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0824  acylphosphatase  46.48 
 
 
108 aa  58.9  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7041  acylphosphatase  52.78 
 
 
97 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.925608  hitchhiker  0.000175796 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1323  acylphosphatase  41.43 
 
 
96 aa  58.5  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7993  Acylphosphatase-like protein  54.55 
 
 
91 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888786  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1848  acylphosphatase  44.62 
 
 
91 aa  57.8  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0168  acylphosphatase  41.67 
 
 
117 aa  57.8  0.00000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1427  acylphosphatase  45.07 
 
 
97 aa  57.8  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223488  normal  0.163349 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2095  acylphosphatase  43.42 
 
 
109 aa  57.8  0.00000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.451224  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3638  DNA ligase D, 3'-phosphoesterase domain protein  52.17 
 
 
252 aa  57.4  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0783731  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0091  acylphosphatase  47.69 
 
 
95 aa  57.4  0.00000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.104703  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2680  acylphosphatase  47.76 
 
 
91 aa  57.4  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.174548  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0986  acylphosphatase  50 
 
 
89 aa  57  0.00000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000580623  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1921  acylphosphatase  48.57 
 
 
83 aa  57.4  0.00000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6207  acylphosphatase  47.62 
 
 
91 aa  57.4  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1505  acylphosphatase  48.65 
 
 
90 aa  57  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5050  hypothetical protein  39.22 
 
 
1213 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0736  acylphosphatase  45.21 
 
 
93 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1396  acylphosphatase  45.45 
 
 
90 aa  57  0.00000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3029  acylphosphatase  46.88 
 
 
90 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.14564  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4481  acylphosphatase  48.61 
 
 
101 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0080  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.14 
 
 
741 aa  56.6  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.442925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>