More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4125 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4125  acylphosphatase  100 
 
 
98 aa  203  7e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7041  acylphosphatase  89.36 
 
 
97 aa  176  8e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.925608  hitchhiker  0.000175796 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0023  acylphosphatase  88.3 
 
 
97 aa  176  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2240  acylphosphatase  81.63 
 
 
155 aa  148  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0974  acylphosphatase  80.61 
 
 
149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1279  acylphosphatase  80.61 
 
 
149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1261  acylphosphatase  80.61 
 
 
155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2922  acylphosphatase  80.61 
 
 
155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.282914  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2235  acylphosphatase  80.61 
 
 
155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3047  acylphosphatase  80.61 
 
 
152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.813124  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1957  acylphosphatase  80.61 
 
 
98 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.66161  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3258  acylphosphatase  76.53 
 
 
98 aa  140  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.064553 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4724  acylphosphatase  75.51 
 
 
98 aa  139  9e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5312  acylphosphatase  75.51 
 
 
105 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148968  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5419  acylphosphatase  76.53 
 
 
98 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5548  acylphosphatase  75.51 
 
 
105 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.802692  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4872  acylphosphatase  74.49 
 
 
105 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.450612  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0110  acylphosphatase  73.47 
 
 
105 aa  135  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0219  putative acylphosphatase protein  51.55 
 
 
119 aa  84.3  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2214  putative acylphosphatase  46.34 
 
 
92 aa  80.9  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000119886  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1227  acylphosphatase  49.38 
 
 
90 aa  77.4  0.00000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.130113  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1228  acylphosphatase  49.38 
 
 
90 aa  77.4  0.00000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00087614  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1480  acylphosphatase  46.25 
 
 
94 aa  76.3  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0319671  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4329  acylphosphatase  50 
 
 
92 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.41249  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3279  acylphosphatase  47.5 
 
 
92 aa  76.6  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000800863 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6189  acylphosphatase  46.74 
 
 
102 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1453  acylphosphatase  52.11 
 
 
92 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1427  acylphosphatase  46.99 
 
 
97 aa  75.9  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223488  normal  0.163349 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0713  acylphosphatase  44.19 
 
 
92 aa  75.1  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.527846  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0862  acylphosphatase  46.34 
 
 
93 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3384  acylphosphatase  45.12 
 
 
94 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0889  acylphosphatase  41.46 
 
 
91 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3638  DNA ligase D, 3'-phosphoesterase domain protein  50.63 
 
 
252 aa  74.3  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0783731  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4846  acylphosphatase  43.16 
 
 
101 aa  73.9  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4711  acylphosphatase  50 
 
 
97 aa  73.9  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3123  acylphosphatase-like protein  46.05 
 
 
89 aa  72.8  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.555032  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2164  acylphosphatase  46.51 
 
 
99 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4069  acylphosphatase  43.37 
 
 
92 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4771  acylphosphatase  45.88 
 
 
99 aa  72  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000297446  normal  0.0367606 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6574  acylphosphatase  42.5 
 
 
97 aa  72.4  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3149  acylphosphatase  46.67 
 
 
96 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000748736  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2947  acylphosphatase  46.67 
 
 
96 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1245  acylphosphatase  41.46 
 
 
95 aa  72  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3029  acylphosphatase  41.38 
 
 
90 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.14564  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4481  acylphosphatase  44.05 
 
 
101 aa  71.6  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0888  acylphosphatase  51.47 
 
 
89 aa  71.6  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000010114  n/a   
 
 
 
NC_003295  RSc3370  hypothetical protein  53.73 
 
 
95 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1765  acylphosphatase  50.68 
 
 
92 aa  71.6  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00140715  hitchhiker  0.00160768 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1328  acylphosphatase  40.74 
 
 
91 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161573  normal  0.572666 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1869  acylphosphatase  41.18 
 
 
90 aa  71.2  0.000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0372  acylphosphatase  53.42 
 
 
94 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.404855 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2835  acylphosphatase  40.74 
 
 
91 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000760642  hitchhiker  0.000425949 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0859  putative acylphosphatase  40.91 
 
 
89 aa  70.5  0.000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000124258  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1808  acylphosphatase  41.46 
 
 
90 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2406  acylphosphatase  45.12 
 
 
92 aa  70.1  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.31927  normal  0.925907 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2729  acylphosphatase  39.02 
 
 
93 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0335058  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0496  acylphosphatase  45.45 
 
 
104 aa  69.7  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1839  acylphosphatase  48.75 
 
 
90 aa  69.7  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.831487  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1052  acylphosphatase  47.89 
 
 
90 aa  69.7  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.424464  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2397  acylphosphatase  40.24 
 
 
91 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221356  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2248  acylphosphatase  43.24 
 
 
89 aa  69.3  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.946619  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1950  acylphosphatase  40.74 
 
 
97 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000103444  normal  0.209392 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2408  acylphosphatase  40.24 
 
 
91 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000467903  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0509  acylphosphatase  52.31 
 
 
87 aa  68.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1728  acylphosphatase  40.24 
 
 
90 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.352005  normal  0.358001 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2291  acylphosphatase  40.24 
 
 
90 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0355652  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2513  acylphosphatase  40.24 
 
 
91 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000309341  normal  0.999326 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2160  acylphosphatase  40.24 
 
 
91 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290914  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0920  acylphosphatase  44.3 
 
 
91 aa  68.6  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3210  acylphosphatase  50 
 
 
92 aa  68.2  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00151409  hitchhiker  0.00225794 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1735  acylphosphatase  42.05 
 
 
99 aa  68.2  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.100754 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2619  acylphosphatase  50 
 
 
92 aa  68.2  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2530  acylphosphatase  50 
 
 
92 aa  68.2  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.306115  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1812  acylphosphatase  41.67 
 
 
97 aa  67.8  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1692  acylphosphatase  40.24 
 
 
91 aa  67.8  0.00000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.205499 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3184  acylphosphatase  37.36 
 
 
95 aa  67.8  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.678514  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2243  acylphosphatase  42.53 
 
 
95 aa  67  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3568  acylphosphatase  47.22 
 
 
95 aa  67  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2654  acylphosphatase  47.22 
 
 
91 aa  67  0.00000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.156555  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0560  acylphosphatase  54.84 
 
 
96 aa  67  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.373142  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1216  acylphosphatase  49.23 
 
 
93 aa  66.6  0.00000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08420  cylphosphatase  39.76 
 
 
95 aa  66.2  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0824  acylphosphatase  48.65 
 
 
108 aa  66.2  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1796  acylphosphatase  45.59 
 
 
92 aa  66.2  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.333863  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2182  acylphosphatase  44.74 
 
 
90 aa  66.6  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.404717  normal  0.46336 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4900  putative acylphosphatase  45.45 
 
 
100 aa  65.5  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.164236 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0736  acylphosphatase  47.06 
 
 
93 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1158  acylphosphatase  46.38 
 
 
93 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.216126  normal  0.513068 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1124  acylphosphatase  46.38 
 
 
93 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  1.8259399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1158  acylphosphatase  40.24 
 
 
94 aa  65.5  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0933267  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0794  acylphosphatase  47.3 
 
 
110 aa  66.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.364443  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0522  acylphosphatase  49.23 
 
 
89 aa  65.5  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.606766 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2998  acylphosphatase  44.16 
 
 
94 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.593748  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1192  acylphosphatase  46.38 
 
 
93 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4198  acylphosphatase  45.95 
 
 
94 aa  65.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0019532  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1146  acylphosphatase  46.38 
 
 
93 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137289  normal  0.225824 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2848  acylphosphatase  47.83 
 
 
92 aa  65.9  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0241308  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4152  acylphosphatase  41.38 
 
 
97 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1041  acylphosphatase  46.38 
 
 
93 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.860635  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0009  acylphosphatase  42.86 
 
 
97 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>