246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2248 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_2248  acylphosphatase  100 
 
 
89 aa  186  8e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.946619  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1853  acylphosphatase  47.56 
 
 
91 aa  89.7  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1848  acylphosphatase  47.56 
 
 
91 aa  89.4  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1706  acylphosphatase  45.88 
 
 
90 aa  85.1  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.531567  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1839  acylphosphatase  43.37 
 
 
90 aa  81.6  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.831487  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0703  acylphosphatase  48.15 
 
 
92 aa  82  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0560  acylphosphatase  48 
 
 
96 aa  81.3  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.373142  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1480  acylphosphatase  48.31 
 
 
94 aa  81.3  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0319671  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0888  acylphosphatase  46.25 
 
 
89 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000010114  n/a   
 
 
 
NC_011149  SeAg_B1041  acylphosphatase  47.19 
 
 
93 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.860635  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1124  acylphosphatase  46.07 
 
 
93 aa  76.6  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  1.8259399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1146  acylphosphatase  46.07 
 
 
93 aa  76.6  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137289  normal  0.225824 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1192  acylphosphatase  46.07 
 
 
93 aa  76.6  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1158  acylphosphatase  46.07 
 
 
93 aa  76.6  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.216126  normal  0.513068 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1765  acylphosphatase  44.83 
 
 
92 aa  74.3  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00140715  hitchhiker  0.00160768 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0522  acylphosphatase  43.18 
 
 
89 aa  73.9  0.0000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.606766 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2149  acylphosphatase  46.43 
 
 
92 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.054782  normal  0.385833 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00972  predicted acylphosphatase  46.43 
 
 
92 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0682612  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2675  acylphosphatase  46.43 
 
 
92 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000389922  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2095  acylphosphatase  39.02 
 
 
109 aa  72.8  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.451224  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0091  acylphosphatase  39.02 
 
 
95 aa  72.8  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.104703  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1134  acylphosphatase  46.43 
 
 
92 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.35715 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0372  acylphosphatase  45.12 
 
 
94 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.404855 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00979  hypothetical protein  46.43 
 
 
92 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.114044  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2346  acylphosphatase  46.43 
 
 
92 aa  73.2  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.204273  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2628  acylphosphatase  46.43 
 
 
92 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0934833  hitchhiker  0.0000175619 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02367  acylphosphatase  43.75 
 
 
90 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4554  acylphosphatase  45.33 
 
 
86 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.640639  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6207  acylphosphatase  41.25 
 
 
91 aa  71.2  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0713  acylphosphatase  47.62 
 
 
92 aa  70.5  0.000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.527846  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2539  acylphosphatase  40.91 
 
 
92 aa  70.1  0.000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0210008  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0311  acylphosphatase  46.34 
 
 
93 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.422172  normal  0.0299279 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2619  acylphosphatase  39.29 
 
 
92 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0969  acylphosphatase  45.45 
 
 
94 aa  68.6  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000144451  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2530  acylphosphatase  39.29 
 
 
92 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.306115  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36780  acylphosphatase  40.23 
 
 
91 aa  69.3  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1183  acylphosphatase  43.66 
 
 
92 aa  69.3  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.858645  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4125  acylphosphatase  43.24 
 
 
98 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3210  acylphosphatase  39.29 
 
 
92 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00151409  hitchhiker  0.00225794 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2243  acylphosphatase  41.98 
 
 
95 aa  68.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2182  acylphosphatase  41.18 
 
 
90 aa  68.6  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.404717  normal  0.46336 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0103  acylphosphatase  41.77 
 
 
92 aa  68.2  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00111331 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4329  acylphosphatase  41.25 
 
 
92 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.41249  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0770  acylphosphatase  40.74 
 
 
92 aa  67.4  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0023  acylphosphatase  41.89 
 
 
97 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7041  acylphosphatase  41.89 
 
 
97 aa  67  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.925608  hitchhiker  0.000175796 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0240  acylphosphatase  44.44 
 
 
93 aa  67  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51920  acylphosphatase  40 
 
 
91 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00243945 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1796  acylphosphatase  42.42 
 
 
92 aa  67  0.00000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.333863  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1219  acylphosphatase  40.91 
 
 
92 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1245  acylphosphatase  45.45 
 
 
95 aa  65.5  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3443  acylphosphatase  41.89 
 
 
92 aa  64.7  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1891  acylphosphatase  50.79 
 
 
92 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1316  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0889  acylphosphatase  40.26 
 
 
91 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2688  acylphosphatase  39.77 
 
 
92 aa  64.7  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6574  acylphosphatase  43.84 
 
 
97 aa  64.3  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0509  acylphosphatase  46.38 
 
 
87 aa  64.7  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1052  acylphosphatase  41.56 
 
 
90 aa  64.3  0.0000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.424464  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1716  acylphosphatase  39.19 
 
 
93 aa  63.9  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000101765  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4771  acylphosphatase  40.28 
 
 
99 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000297446  normal  0.0367606 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1427  acylphosphatase  42.42 
 
 
97 aa  63.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223488  normal  0.163349 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1584  acylphosphatase  41.79 
 
 
108 aa  62.8  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3370  hypothetical protein  39.73 
 
 
95 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2654  acylphosphatase  36.9 
 
 
91 aa  62.4  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.156555  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2257  acylphosphatase  41.56 
 
 
88 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.265908 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4069  acylphosphatase  40 
 
 
92 aa  62  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2848  acylphosphatase  38.1 
 
 
92 aa  62.8  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0241308  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08420  cylphosphatase  36.59 
 
 
95 aa  62  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1692  acylphosphatase  47.14 
 
 
91 aa  62.4  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.205499 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1449  acylphosphatase  42.65 
 
 
89 aa  61.6  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000172052  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0520  acylphosphatase  41.03 
 
 
95 aa  62  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.230918  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3568  acylphosphatase  44.12 
 
 
95 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3384  acylphosphatase  36.36 
 
 
94 aa  61.6  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3123  acylphosphatase-like protein  40.28 
 
 
89 aa  61.2  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.555032  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3184  acylphosphatase  42.19 
 
 
95 aa  61.6  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.678514  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1735  acylphosphatase  41.43 
 
 
99 aa  61.2  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.100754 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1686  acylphosphatase  43.24 
 
 
88 aa  61.2  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.333589  normal  0.382627 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_899  acylphosphatase-like protein  43.48 
 
 
91 aa  60.8  0.000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000672405  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1921  acylphosphatase  36.25 
 
 
83 aa  60.1  0.000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0824  acylphosphatase  38.81 
 
 
108 aa  60.1  0.000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1027  acylphosphatase  45.33 
 
 
91 aa  60.1  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0204097  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1323  acylphosphatase  46.27 
 
 
96 aa  59.3  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0794  acylphosphatase  38.89 
 
 
110 aa  60.1  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.364443  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3245  acylphosphatase  42.65 
 
 
95 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0910  acylphosphatase  43.48 
 
 
91 aa  59.7  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000647443  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1304  acylphosphatase  32.47 
 
 
91 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000789837  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1169  acylphosphatase  40.28 
 
 
91 aa  59.7  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0736  acylphosphatase  39.39 
 
 
93 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22230  acylphosphatase  35.96 
 
 
99 aa  59.3  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2011  acylphosphatase  36 
 
 
94 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2729  acylphosphatase  33.77 
 
 
93 aa  59.3  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0335058  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1419  acylphosphatase  38.81 
 
 
92 aa  58.5  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4481  acylphosphatase  41.18 
 
 
101 aa  58.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0745  acylphosphatase  36.25 
 
 
117 aa  58.2  0.00000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.492264  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2680  acylphosphatase  44.62 
 
 
91 aa  58.2  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.174548  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0729  acylphosphatase  40 
 
 
93 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2406  acylphosphatase  36.76 
 
 
92 aa  58.2  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.31927  normal  0.925907 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1869  acylphosphatase  43.48 
 
 
90 aa  57.8  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0085  acylphosphatase  40.3 
 
 
107 aa  57.8  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.49451 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3029  acylphosphatase  42.42 
 
 
90 aa  57  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.14564  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>