253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0862 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0862  acylphosphatase  100 
 
 
93 aa  189  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3384  acylphosphatase  91.49 
 
 
94 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0889  acylphosphatase  48.89 
 
 
91 aa  94  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1304  acylphosphatase  50.56 
 
 
91 aa  92.8  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000789837  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2729  acylphosphatase  46.67 
 
 
93 aa  92  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0335058  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1427  acylphosphatase  48.35 
 
 
97 aa  82.8  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223488  normal  0.163349 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0713  acylphosphatase  48.84 
 
 
92 aa  79.3  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.527846  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2406  acylphosphatase  52.81 
 
 
92 aa  78.6  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.31927  normal  0.925907 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1796  acylphosphatase  46.07 
 
 
92 aa  77  0.00000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.333863  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1716  acylphosphatase  44.32 
 
 
93 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000101765  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4481  acylphosphatase  48.28 
 
 
101 aa  74.7  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4125  acylphosphatase  46.34 
 
 
98 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0729  acylphosphatase  48.31 
 
 
93 aa  73.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0520  acylphosphatase  46.59 
 
 
95 aa  73.6  0.0000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.230918  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4329  acylphosphatase  47.62 
 
 
92 aa  73.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.41249  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1735  acylphosphatase  53.52 
 
 
99 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.100754 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0255  acylphosphatase  46.59 
 
 
95 aa  72  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.714232 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0023  acylphosphatase  47.56 
 
 
97 aa  72  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2164  acylphosphatase  51.95 
 
 
99 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2447  acylphosphatase  49.44 
 
 
92 aa  72  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0694  acylphosphatase  46.07 
 
 
93 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.509759  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2998  acylphosphatase  48.84 
 
 
94 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.593748  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0730  acylphosphatase  48.31 
 
 
93 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0770  acylphosphatase  44.83 
 
 
92 aa  71.6  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0103  acylphosphatase  43.02 
 
 
92 aa  71.6  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00111331 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0300  acylphosphatase  45.98 
 
 
95 aa  71.2  0.000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0824  acylphosphatase  49.44 
 
 
108 aa  71.6  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1052  acylphosphatase  45.45 
 
 
90 aa  71.2  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.424464  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1419  acylphosphatase  48.31 
 
 
92 aa  70.9  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08420  cylphosphatase  39.77 
 
 
95 aa  70.9  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0311  acylphosphatase  47.13 
 
 
93 aa  70.5  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.422172  normal  0.0299279 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7041  acylphosphatase  46.34 
 
 
97 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.925608  hitchhiker  0.000175796 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0794  acylphosphatase  50.57 
 
 
110 aa  70.5  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.364443  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0787  acylphosphatase  45.45 
 
 
110 aa  70.5  0.000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4339  acylphosphatase  47.56 
 
 
99 aa  70.1  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0201054  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0736  acylphosphatase  45.45 
 
 
93 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3223  acylphosphatase  43.53 
 
 
94 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.237355  normal  0.7882 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1245  acylphosphatase  39.08 
 
 
95 aa  68.6  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1183  acylphosphatase  44.05 
 
 
92 aa  68.2  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.858645  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4069  acylphosphatase  41.67 
 
 
92 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0888  acylphosphatase  44.44 
 
 
89 aa  67.4  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000010114  n/a   
 
 
 
NC_009767  Rcas_0240  acylphosphatase  45.98 
 
 
93 aa  66.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4900  putative acylphosphatase  50 
 
 
100 aa  65.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.164236 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3186  acylphosphatase  48.24 
 
 
93 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.341128  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1158  acylphosphatase  40.45 
 
 
94 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0933267  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22230  acylphosphatase  51.22 
 
 
99 aa  64.7  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2947  acylphosphatase  44.05 
 
 
96 aa  65.1  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3149  acylphosphatase  44.05 
 
 
96 aa  65.1  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000748736  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0859  putative acylphosphatase  50 
 
 
89 aa  64.3  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000124258  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2342  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.82 
 
 
766 aa  64.3  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1169  acylphosphatase  43.18 
 
 
91 aa  63.9  0.0000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1480  acylphosphatase  40.23 
 
 
94 aa  63.9  0.0000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0319671  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00972  predicted acylphosphatase  43.37 
 
 
92 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0682612  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2675  acylphosphatase  43.37 
 
 
92 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000389922  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3443  acylphosphatase  42.53 
 
 
92 aa  63.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2214  putative acylphosphatase  41.76 
 
 
92 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000119886  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1216  acylphosphatase  44.32 
 
 
93 aa  63.5  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00979  hypothetical protein  43.37 
 
 
92 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.114044  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2628  acylphosphatase  43.37 
 
 
92 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0934833  hitchhiker  0.0000175619 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1765  acylphosphatase  46.43 
 
 
92 aa  63.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00140715  hitchhiker  0.00160768 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1134  acylphosphatase  43.37 
 
 
92 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.35715 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2539  acylphosphatase  41.76 
 
 
92 aa  62.8  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0210008  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1192  acylphosphatase  40.96 
 
 
93 aa  62  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1158  acylphosphatase  40.96 
 
 
93 aa  62  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.216126  normal  0.513068 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1041  acylphosphatase  40.96 
 
 
93 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.860635  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1124  acylphosphatase  40.96 
 
 
93 aa  62  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  1.8259399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1146  acylphosphatase  40.96 
 
 
93 aa  62  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137289  normal  0.225824 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1185  acylphosphatase  42.7 
 
 
92 aa  61.6  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0496  acylphosphatase  46.25 
 
 
104 aa  61.6  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2149  acylphosphatase  42.17 
 
 
92 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.054782  normal  0.385833 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2848  acylphosphatase  44.05 
 
 
92 aa  61.2  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0241308  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4711  acylphosphatase  45.45 
 
 
97 aa  61.6  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3350  acylphosphatase  47.22 
 
 
99 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.200593  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2654  acylphosphatase  50 
 
 
91 aa  60.8  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.156555  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1125  acylphosphatase  38.82 
 
 
578 aa  60.5  0.000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.000234918  normal  0.35011 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36780  acylphosphatase  44.58 
 
 
91 aa  60.5  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1294  acylphosphatase  43.18 
 
 
95 aa  60.5  0.000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3245  acylphosphatase  41.38 
 
 
95 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2688  acylphosphatase  44.58 
 
 
92 aa  59.7  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1692  acylphosphatase  36.47 
 
 
91 aa  59.7  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.205499 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3370  hypothetical protein  40.23 
 
 
95 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1686  acylphosphatase  42.35 
 
 
88 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.333589  normal  0.382627 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6207  acylphosphatase  40.28 
 
 
91 aa  59.3  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2346  acylphosphatase  40.96 
 
 
92 aa  59.3  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.204273  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3852  acylphosphatase  44.19 
 
 
91 aa  58.9  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.567778 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1977  acylphosphatase  40.45 
 
 
95 aa  59.3  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.560432  normal  0.812753 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6574  acylphosphatase  40.7 
 
 
97 aa  58.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2778  acylphosphatase  40.91 
 
 
89 aa  58.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  0.15284 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3795  acylphosphatase  47.76 
 
 
96 aa  58.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.524231 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2619  acylphosphatase  43.37 
 
 
92 aa  57.8  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3210  acylphosphatase  43.37 
 
 
92 aa  57.8  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00151409  hitchhiker  0.00225794 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2530  acylphosphatase  43.37 
 
 
92 aa  57.8  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.306115  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0405  acylphosphatase  37.21 
 
 
90 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3568  acylphosphatase  37.93 
 
 
95 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3091  acylphosphatase  44.05 
 
 
99 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.937205  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0599  acylphosphatase  47.89 
 
 
101 aa  57  0.00000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1706  acylphosphatase  37.04 
 
 
90 aa  57  0.00000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.531567  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1957  acylphosphatase  39.44 
 
 
98 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.66161  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0986  acylphosphatase  31.76 
 
 
89 aa  56.2  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000580623  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1453  acylphosphatase  41.67 
 
 
92 aa  56.6  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>