More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4872 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4872  acylphosphatase  100 
 
 		 105 aa  214  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.450612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5312  acylphosphatase  94.29 
 
 		 105 aa  180  7e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148968  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5548  acylphosphatase  94.29 
 
 		 105 aa  180  7e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.802692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0110  acylphosphatase  94.29 
 
 		 105 aa  178  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5419  acylphosphatase  95.92 
 
 		 98 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4724  acylphosphatase  94.9 
 
 		 98 aa  168  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3258  acylphosphatase  91.84 
 
 		 98 aa  164  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.064553 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4125  acylphosphatase  74.49 
 
 		 98 aa  159  8.000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2240  acylphosphatase  80.95 
 
 		 155 aa  155  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0023  acylphosphatase  75.53 
 
 		 97 aa  156  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2235  acylphosphatase  80.95 
 
 		 155 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1279  acylphosphatase  80.95 
 
 		 149 aa  155  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3047  acylphosphatase  80.95 
 
 		 152 aa  155  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.813124  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2922  acylphosphatase  80.95 
 
 		 155 aa  155  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.282914  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1261  acylphosphatase  80.95 
 
 		 155 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7041  acylphosphatase  75.53 
 
 		 97 aa  155  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.925608  hitchhiker  0.000175796 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0974  acylphosphatase  80.95 
 
 		 149 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1957  acylphosphatase  83.67 
 
 		 98 aa  147  4e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.66161  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2214  putative acylphosphatase  51.22 
 
 		 92 aa  88.6  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000119886  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0219  putative acylphosphatase protein  52.87 
 
 		 119 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3279  acylphosphatase  49.37 
 
 		 92 aa  74.7  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000800863 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4329  acylphosphatase  52.94 
 
 		 92 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.41249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1453  acylphosphatase  50 
 
 		 92 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4711  acylphosphatase  49.32 
 
 		 97 aa  73.6  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0889  acylphosphatase  43.21 
 
 		 91 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1480  acylphosphatase  46.91 
 
 		 94 aa  73.2  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0319671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6189  acylphosphatase  45 
 
 		 102 aa  72  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4069  acylphosphatase  46.48 
 
 		 92 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2729  acylphosphatase  40.74 
 
 		 93 aa  72  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0335058  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0713  acylphosphatase  45.12 
 
 		 92 aa  71.2  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.527846  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6574  acylphosphatase  43.59 
 
 		 97 aa  71.2  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4846  acylphosphatase  41.84 
 
 		 101 aa  71.2  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3384  acylphosphatase  50 
 
 		 94 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3123  acylphosphatase-like protein  48.28 
 
 		 89 aa  70.5  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.555032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0372  acylphosphatase  53.42 
 
 		 94 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.404855 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1765  acylphosphatase  50.7 
 
 		 92 aa  69.7  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00140715  hitchhiker  0.00160768 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4481  acylphosphatase  50.7 
 
 		 101 aa  68.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2182  acylphosphatase  45.57 
 
 		 90 aa  69.3  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.404717  normal  0.46336 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2654  acylphosphatase  48.61 
 
 		 91 aa  68.6  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.156555  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2164  acylphosphatase  55.38 
 
 		 99 aa  67.8  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1216  acylphosphatase  50.77 
 
 		 93 aa  67.8  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1228  acylphosphatase  46.67 
 
 		 90 aa  67.8  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00087614  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2243  acylphosphatase  53.62 
 
 		 95 aa  67.8  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1227  acylphosphatase  46.67 
 
 		 90 aa  67.8  0.00000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.130113  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1427  acylphosphatase  43.37 
 
 		 97 aa  67.4  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223488  normal  0.163349 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3149  acylphosphatase  47.22 
 
 		 96 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000748736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1245  acylphosphatase  41.98 
 
 		 95 aa  66.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3370  hypothetical protein  52.24 
 
 		 95 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3029  acylphosphatase  40.7 
 
 		 90 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.14564  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0859  putative acylphosphatase  43.42 
 
 		 89 aa  66.2  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000124258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2947  acylphosphatase  47.22 
 
 		 96 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1808  acylphosphatase  43.66 
 
 		 90 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3638  DNA ligase D, 3'-phosphoesterase domain protein  50.68 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0783731  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0862  acylphosphatase  43.9 
 
 		 93 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4198  acylphosphatase  49.3 
 
 		 94 aa  66.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0019532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2230  acylphosphatase  46.34 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.595414 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4771  acylphosphatase  44.71 
 
 		 99 aa  65.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000297446  normal  0.0367606 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0509  acylphosphatase  50.77 
 
 		 87 aa  65.9  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3568  acylphosphatase  47.22 
 
 		 95 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2835  acylphosphatase  43.66 
 
 		 91 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000760642  hitchhiker  0.000425949 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3443  acylphosphatase  47.3 
 
 		 92 aa  65.5  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2160  acylphosphatase  42.25 
 
 		 91 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290914  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2248  acylphosphatase  41.89 
 
 		 89 aa  65.1  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.946619  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0736  acylphosphatase  50 
 
 		 93 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2408  acylphosphatase  42.25 
 
 		 91 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000467903  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1728  acylphosphatase  42.25 
 
 		 90 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.352005  normal  0.358001 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2513  acylphosphatase  42.25 
 
 		 91 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000309341  normal  0.999326 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2291  acylphosphatase  42.25 
 
 		 90 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0355652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2397  acylphosphatase  42.25 
 
 		 91 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221356  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1041  acylphosphatase  46.38 
 
 		 93 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.860635  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1950  acylphosphatase  42.25 
 
 		 97 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000103444  normal  0.209392 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3184  acylphosphatase  38.89 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.678514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2095  acylphosphatase  39.18 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.451224  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1192  acylphosphatase  46.38 
 
 		 93 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1124  acylphosphatase  46.38 
 
 		 93 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.8259399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1146  acylphosphatase  46.38 
 
 		 93 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137289  normal  0.225824 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0496  acylphosphatase  45.45 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0729  acylphosphatase  50 
 
 		 93 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1158  acylphosphatase  46.38 
 
 		 93 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.216126  normal  0.513068 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1322  acylphosphatase  44.71 
 
 		 101 aa  64.3  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0315179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1839  acylphosphatase  47.83 
 
 		 90 aa  63.9  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.831487  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2848  acylphosphatase  47.83 
 
 		 92 aa  63.9  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0241308  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0999  acylphosphatase  44.44 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00530798 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1869  acylphosphatase  38.55 
 
 		 90 aa  63.2  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4152  acylphosphatase  40.54 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1977  acylphosphatase  47.89 
 
 		 95 aa  63.2  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.560432  normal  0.812753 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0745  acylphosphatase  43.06 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.492264  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0920  acylphosphatase  43.75 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1304  acylphosphatase  39.02 
 
 		 91 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000789837  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3085  acylphosphatase  56.06 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.842982 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3245  acylphosphatase  47.22 
 
 		 95 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0080  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.26 
 
 		 741 aa  62  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.442925  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3795  acylphosphatase  45.83 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.524231 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0681  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.76 
 
 		 766 aa  62.4  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0009  acylphosphatase  41.43 
 
 		 97 aa  62  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3350  acylphosphatase  47.76 
 
 		 99 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.200593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0091  acylphosphatase  38.71 
 
 		 95 aa  62.8  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.104703  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4900  putative acylphosphatase  49.3 
 
 		 100 aa  62.8  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.164236 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2346  acylphosphatase  47.83 
 
 		 92 aa  62  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.204273  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1052  acylphosphatase  43.66 
 
 		 90 aa  62  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.424464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>