271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1891 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1891  acylphosphatase  100 
 
 
92 aa  177  4.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1316  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0372  acylphosphatase  71.43 
 
 
94 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.404855 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3223  acylphosphatase  55.68 
 
 
94 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.237355  normal  0.7882 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3186  acylphosphatase  51.69 
 
 
93 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.341128  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2998  acylphosphatase  53.41 
 
 
94 aa  94  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.593748  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2230  acylphosphatase  54.44 
 
 
98 aa  90.9  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.595414 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2746  acylphosphatase  52.22 
 
 
94 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.352229  normal  0.313982 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2164  acylphosphatase  60.81 
 
 
99 aa  84.7  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1839  acylphosphatase  49.43 
 
 
90 aa  84.7  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.831487  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4198  acylphosphatase  53.93 
 
 
94 aa  82.8  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0019532  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4900  putative acylphosphatase  55.56 
 
 
100 aa  78.2  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.164236 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2654  acylphosphatase  52.38 
 
 
91 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.156555  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0522  acylphosphatase  45.45 
 
 
89 aa  77  0.00000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.606766 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3795  acylphosphatase  52.56 
 
 
96 aa  77  0.00000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.524231 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1735  acylphosphatase  58.82 
 
 
99 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.100754 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2011  acylphosphatase  50.59 
 
 
94 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4771  acylphosphatase  50.62 
 
 
99 aa  76.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000297446  normal  0.0367606 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2947  acylphosphatase  47.62 
 
 
96 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0085  acylphosphatase  53.33 
 
 
107 aa  75.9  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.49451 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3583  acylphosphatase  56.76 
 
 
99 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3149  acylphosphatase  46.43 
 
 
96 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000748736  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3091  acylphosphatase  50.62 
 
 
99 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.937205  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2680  acylphosphatase  53.57 
 
 
91 aa  73.9  0.0000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.174548  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3350  acylphosphatase  51.35 
 
 
99 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.200593  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4711  acylphosphatase  54.02 
 
 
97 aa  73.2  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1169  acylphosphatase  43.96 
 
 
91 aa  73.2  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0703  acylphosphatase  45.98 
 
 
92 aa  72.8  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2369  acylphosphatase  54.79 
 
 
99 aa  72  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631036  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2243  acylphosphatase  50.62 
 
 
95 aa  72.4  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0405  acylphosphatase  46.05 
 
 
90 aa  70.5  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4481  acylphosphatase  47.67 
 
 
101 aa  70.1  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1812  acylphosphatase  51.47 
 
 
97 aa  69.7  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22230  acylphosphatase  57.97 
 
 
99 aa  68.9  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4329  acylphosphatase  48.78 
 
 
92 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.41249  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1505  acylphosphatase  54.55 
 
 
90 aa  68.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2688  acylphosphatase  50.63 
 
 
92 aa  68.6  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08420  cylphosphatase  48.57 
 
 
95 aa  68.2  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3607  acylphosphatase  42.7 
 
 
110 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0899906 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1322  acylphosphatase  54.55 
 
 
101 aa  68.6  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0315179  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4554  acylphosphatase  51.22 
 
 
86 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.640639  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1865  acylphosphatase  46.74 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2406  acylphosphatase  45.65 
 
 
92 aa  67  0.00000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.31927  normal  0.925907 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1584  acylphosphatase  51.85 
 
 
108 aa  67  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2248  acylphosphatase  48.53 
 
 
89 aa  66.6  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.946619  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1977  acylphosphatase  47.95 
 
 
95 aa  66.2  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.560432  normal  0.812753 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1245  acylphosphatase  41.86 
 
 
95 aa  66.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2214  putative acylphosphatase  47.22 
 
 
92 aa  66.2  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000119886  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1419  acylphosphatase  48.24 
 
 
92 aa  66.2  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1146  acylphosphatase  44.44 
 
 
93 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137289  normal  0.225824 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1427  acylphosphatase  48.68 
 
 
97 aa  66.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223488  normal  0.163349 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1124  acylphosphatase  44.44 
 
 
93 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  1.8259399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1706  acylphosphatase  35.63 
 
 
90 aa  66.6  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.531567  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1158  acylphosphatase  44.44 
 
 
93 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.216126  normal  0.513068 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4069  acylphosphatase  47.56 
 
 
92 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1041  acylphosphatase  44.44 
 
 
93 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.860635  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1192  acylphosphatase  44.44 
 
 
93 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1796  acylphosphatase  50.72 
 
 
92 aa  65.9  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.333863  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0859  putative acylphosphatase  45.24 
 
 
89 aa  65.9  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000124258  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0888  acylphosphatase  50.68 
 
 
89 aa  65.5  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000010114  n/a   
 
 
 
NC_013946  Mrub_1686  acylphosphatase  42.68 
 
 
88 aa  65.5  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.333589  normal  0.382627 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2539  acylphosphatase  45.68 
 
 
92 aa  65.9  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0210008  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1480  acylphosphatase  50.72 
 
 
94 aa  65.5  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0319671  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0311  acylphosphatase  52.86 
 
 
93 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.422172  normal  0.0299279 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2182  acylphosphatase  38.64 
 
 
90 aa  64.3  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.404717  normal  0.46336 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1158  acylphosphatase  47.37 
 
 
94 aa  63.9  0.0000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0933267  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0560  acylphosphatase  47.5 
 
 
96 aa  63.9  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.373142  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3279  acylphosphatase  46.84 
 
 
92 aa  63.5  0.0000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000800863 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1692  acylphosphatase  40 
 
 
91 aa  63.5  0.0000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.205499 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0255  acylphosphatase  51.95 
 
 
95 aa  63.5  0.0000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.714232 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2447  acylphosphatase  43.33 
 
 
92 aa  63.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0770  acylphosphatase  49.3 
 
 
92 aa  63.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0240  acylphosphatase  52.11 
 
 
93 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7993  Acylphosphatase-like protein  50.63 
 
 
91 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888786  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3085  acylphosphatase  48.61 
 
 
112 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.842982 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1288  acylphosphatase  39.19 
 
 
94 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1219  acylphosphatase  44.32 
 
 
92 aa  62.8  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09560  acylphosphatase  51.52 
 
 
98 aa  62.8  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0520  acylphosphatase  47.06 
 
 
95 aa  62.4  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.230918  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0599  acylphosphatase  45.78 
 
 
101 aa  62  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1765  acylphosphatase  42.22 
 
 
92 aa  61.6  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00140715  hitchhiker  0.00160768 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0300  acylphosphatase  54.29 
 
 
95 aa  61.6  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0794  acylphosphatase  50 
 
 
110 aa  62  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.364443  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3245  acylphosphatase  49.41 
 
 
95 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2257  acylphosphatase  37.21 
 
 
88 aa  61.6  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.265908 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0163  acylphosphatase  39.29 
 
 
93 aa  61.6  0.000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7041  acylphosphatase  49.32 
 
 
97 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.925608  hitchhiker  0.000175796 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4125  acylphosphatase  47.95 
 
 
98 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0824  acylphosphatase  43.53 
 
 
108 aa  61.2  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0713  acylphosphatase  42.7 
 
 
92 aa  61.2  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.527846  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1396  acylphosphatase  44.59 
 
 
90 aa  61.2  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0023  acylphosphatase  47.37 
 
 
97 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1449  acylphosphatase  38.89 
 
 
89 aa  61.2  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000172052  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0214  acylphosphatase  45.33 
 
 
95 aa  60.8  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3568  acylphosphatase  48.24 
 
 
95 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4189  acylphosphatase  41.77 
 
 
94 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.702907  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0787  acylphosphatase  49.3 
 
 
110 aa  60.8  0.000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0042  acylphosphatase  41.67 
 
 
90 aa  60.5  0.000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3443  acylphosphatase  40.79 
 
 
92 aa  60.5  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2075  acylphosphatase  47.69 
 
 
107 aa  60.5  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.172008  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02367  acylphosphatase  37.93 
 
 
90 aa  60.5  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>