17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4871 on replicon NC_008759
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008759  Pnap_4871  HNH nuclease  100 
 
 		 353 aa  730    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.98872 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1208  HNH nuclease  77.46 
 
 		 352 aa  553  1e-156  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4564  HNH nuclease  63.98 
 
 		 354 aa  453  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1005  HNH nuclease  40.35 
 
 		 351 aa  252  8.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.47905  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0932  HNH nuclease  37.61 
 
 		 353 aa  244  9.999999999999999e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.362218  hitchhiker  0.00171926 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2264  HNH nuclease  34.43 
 
 		 374 aa  233  5e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.815582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2355  HNH nuclease  37.13 
 
 		 353 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.105535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2239  HNH nuclease  36.89 
 
 		 353 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.576011  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2106  HNH nuclease  36.6 
 
 		 353 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.63229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2120  HNH nuclease  36.6 
 
 		 353 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.459779  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0313  HNH endonuclease  33.12 
 
 		 354 aa  134  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4415  HNH nuclease  32.18 
 
 		 354 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.882303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3257  Methyltransferase type 11  25.94 
 
 		 551 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.708921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3946  HNH endonuclease  46.15 
 
 		 151 aa  50.4  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  34.07 
 
 		 459 aa  48.5  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0924  hypothetical protein  29.85 
 
 		 315 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0842  HNH endonuclease  33.7 
 
 		 459 aa  44.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>