20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1208 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1208  HNH nuclease  100 
 
 		 352 aa  724    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4871  HNH nuclease  77.46 
 
 		 353 aa  554  1e-157  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.98872 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4564  HNH nuclease  64.52 
 
 		 354 aa  448  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1005  HNH nuclease  38.95 
 
 		 351 aa  248  1e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.47905  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0932  HNH nuclease  36.31 
 
 		 353 aa  233  3e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.362218  hitchhiker  0.00171926 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2264  HNH nuclease  34.79 
 
 		 374 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.815582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2120  HNH nuclease  36.63 
 
 		 353 aa  212  9e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.459779  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2106  HNH nuclease  36.63 
 
 		 353 aa  212  9e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.63229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2355  HNH nuclease  36.34 
 
 		 353 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.105535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2239  HNH nuclease  36.63 
 
 		 353 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.576011  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0313  HNH endonuclease  32.88 
 
 		 354 aa  129  6e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4415  HNH nuclease  29.9 
 
 		 354 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.882303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3257  Methyltransferase type 11  25.42 
 
 		 551 aa  50.1  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.708921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3946  HNH endonuclease  46.15 
 
 		 151 aa  48.9  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  35.29 
 
 		 459 aa  47  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4103  methyltransferase type 12  25.89 
 
 		 586 aa  47  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0924  hypothetical protein  33.33 
 
 		 315 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0684  HNH endonuclease  47.06 
 
 		 199 aa  46.2  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2925  methyltransferase type 11  21.31 
 
 		 585 aa  43.5  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0842  HNH endonuclease  36.07 
 
 		 459 aa  43.5  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>