26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0932 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0932  HNH nuclease  100 
 
 
353 aa  735    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.362218  hitchhiker  0.00171926 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4871  HNH nuclease  37.61 
 
 
353 aa  228  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.98872 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4564  HNH nuclease  35.03 
 
 
354 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2239  HNH nuclease  36.39 
 
 
353 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.576011  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2106  HNH nuclease  35.59 
 
 
353 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.63229  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2120  HNH nuclease  35.59 
 
 
353 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.459779  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2355  HNH nuclease  36.69 
 
 
353 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.105535  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1005  HNH nuclease  36.11 
 
 
351 aa  222  9e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.47905  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1208  HNH nuclease  36.31 
 
 
352 aa  219  7e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2264  HNH nuclease  34.1 
 
 
374 aa  206  4e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.815582  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4415  HNH nuclease  28.17 
 
 
354 aa  129  6e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.882303  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0313  HNH endonuclease  26.99 
 
 
354 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4103  methyltransferase type 12  25.5 
 
 
586 aa  57  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0036  HNH endonuclease  23.13 
 
 
322 aa  55.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000264091 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3257  Methyltransferase type 11  22.79 
 
 
551 aa  50.8  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.708921  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3946  HNH endonuclease  39.62 
 
 
151 aa  47  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0924  hypothetical protein  33.33 
 
 
315 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0839  HNH endonuclease  22.95 
 
 
380 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.126251  hitchhiker  0.00000000857836 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  29.87 
 
 
459 aa  45.1  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2426  HNH endonuclease  35.62 
 
 
443 aa  44.3  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0842  HNH endonuclease  29.87 
 
 
459 aa  44.3  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2304  hypothetical protein  27.88 
 
 
381 aa  44.3  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.841437  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0327  CRISPR-associated Cas5e family protein  39.29 
 
 
1395 aa  44.3  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0915  HNH endonuclease  34.38 
 
 
166 aa  43.1  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1499  HNH endonuclease  34.72 
 
 
427 aa  43.1  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000016403  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0342  CRISPR-associated protein, Csn1 family  34.55 
 
 
1003 aa  42.7  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0739339  normal  0.0465454 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>