25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4854 on replicon NC_008759
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008759  Pnap_4854  hypothetical protein  100 
 
 		 369 aa  755    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.434428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0334  hypothetical protein  54.87 
 
 		 364 aa  394  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2110  hypothetical protein  53.2 
 
 		 365 aa  382  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.918881  normal  0.143816 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0454  hypothetical protein  51.81 
 
 		 366 aa  358  7e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.839309  normal  0.600796 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0771  hypothetical protein  53.74 
 
 		 367 aa  358  7e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.626478  normal  0.832658 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0445  hypothetical protein  53.19 
 
 		 366 aa  353  2e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.171296  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0219  hypothetical protein  48.7 
 
 		 383 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1414  hypothetical protein  45.89 
 
 		 361 aa  317  3e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0519713 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1920  hypothetical protein  45.89 
 
 		 360 aa  312  4.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2635  hypothetical protein  47.04 
 
 		 360 aa  310  2e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5759  hypothetical protein  46.26 
 
 		 369 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3642  hypothetical protein  44.69 
 
 		 367 aa  300  4e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.448974  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2803  hypothetical protein  46.18 
 
 		 362 aa  290  2e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.267131  normal  0.769228 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3045  hypothetical protein  46.76 
 
 		 360 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1560  hypothetical protein  41.3 
 
 		 363 aa  234  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4763  hypothetical protein  35.65 
 
 		 368 aa  195  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0626394 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1584  hypothetical protein  34.44 
 
 		 366 aa  187  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2975  hypothetical protein  32.89 
 
 		 376 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23667  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0223  hypothetical protein  35.47 
 
 		 385 aa  170  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1092  hypothetical protein  34.38 
 
 		 391 aa  162  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0342  hypothetical protein  32.59 
 
 		 362 aa  157  4e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0530  hypothetical protein  29.65 
 
 		 361 aa  153  5.9999999999999996e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.443571 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1873  hypothetical protein  30.35 
 
 		 358 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.772578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2432  hypothetical protein  26.51 
 
 		 426 aa  117  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1892  hypothetical protein  25.1 
 
 		 364 aa  92.4  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>