25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0530 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0530  hypothetical protein  100 
 
 
361 aa  743    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.443571 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1873  hypothetical protein  39.22 
 
 
358 aa  242  7.999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.772578  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0342  hypothetical protein  35.03 
 
 
362 aa  205  1e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1920  hypothetical protein  32.6 
 
 
360 aa  166  8e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5759  hypothetical protein  32.39 
 
 
369 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2803  hypothetical protein  29.92 
 
 
362 aa  158  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.267131  normal  0.769228 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2635  hypothetical protein  29.69 
 
 
360 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0219  hypothetical protein  30.83 
 
 
383 aa  158  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4854  hypothetical protein  29.65 
 
 
369 aa  153  5.9999999999999996e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.434428  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3642  hypothetical protein  29.75 
 
 
367 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.448974  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1414  hypothetical protein  30.03 
 
 
361 aa  147  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0519713 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1560  hypothetical protein  31.91 
 
 
363 aa  145  8.000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3045  hypothetical protein  29.91 
 
 
360 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0454  hypothetical protein  28.09 
 
 
366 aa  138  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.839309  normal  0.600796 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4763  hypothetical protein  30.51 
 
 
368 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0626394 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0445  hypothetical protein  28.04 
 
 
366 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.171296  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0334  hypothetical protein  28.45 
 
 
364 aa  130  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1892  hypothetical protein  29.77 
 
 
364 aa  127  4.0000000000000003e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2975  hypothetical protein  26.74 
 
 
376 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23667  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2110  hypothetical protein  25.62 
 
 
365 aa  126  7e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.918881  normal  0.143816 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1092  hypothetical protein  25.77 
 
 
391 aa  121  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0223  hypothetical protein  26.09 
 
 
385 aa  119  7e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0771  hypothetical protein  26.24 
 
 
367 aa  113  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.626478  normal  0.832658 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1584  hypothetical protein  25.61 
 
 
366 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2432  hypothetical protein  28.7 
 
 
426 aa  99.8  7e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>