25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0445 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0445  hypothetical protein  100 
 
 
366 aa  743    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.171296  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0454  hypothetical protein  97.81 
 
 
366 aa  701    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.839309  normal  0.600796 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2110  hypothetical protein  64.46 
 
 
365 aa  493  9.999999999999999e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.918881  normal  0.143816 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0334  hypothetical protein  65.11 
 
 
364 aa  478  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0771  hypothetical protein  64.56 
 
 
367 aa  429  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.626478  normal  0.832658 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0219  hypothetical protein  53.37 
 
 
383 aa  381  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4854  hypothetical protein  52.65 
 
 
369 aa  374  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.434428  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3642  hypothetical protein  48.89 
 
 
367 aa  351  1e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.448974  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5759  hypothetical protein  49.16 
 
 
369 aa  339  4e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2635  hypothetical protein  48.87 
 
 
360 aa  326  5e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1414  hypothetical protein  48.87 
 
 
361 aa  323  4e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0519713 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1920  hypothetical protein  47.21 
 
 
360 aa  318  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2803  hypothetical protein  49.58 
 
 
362 aa  315  7e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.267131  normal  0.769228 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3045  hypothetical protein  48.02 
 
 
360 aa  301  9e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1560  hypothetical protein  43.02 
 
 
363 aa  271  1e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1584  hypothetical protein  40.78 
 
 
366 aa  247  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4763  hypothetical protein  38.51 
 
 
368 aa  216  5e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0626394 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2975  hypothetical protein  37.23 
 
 
376 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23667  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0223  hypothetical protein  37.78 
 
 
385 aa  201  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1092  hypothetical protein  34.69 
 
 
391 aa  178  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1873  hypothetical protein  32.87 
 
 
358 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.772578  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0342  hypothetical protein  33.42 
 
 
362 aa  152  5.9999999999999996e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0530  hypothetical protein  27.81 
 
 
361 aa  144  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.443571 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1892  hypothetical protein  23.32 
 
 
364 aa  110  4.0000000000000004e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2432  hypothetical protein  23.51 
 
 
426 aa  93.2  7e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>