25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1584 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1584  hypothetical protein  100 
 
 		 366 aa  751    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4763  hypothetical protein  38.2 
 
 		 368 aa  244  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0626394 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0454  hypothetical protein  40.78 
 
 		 366 aa  242  6e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.839309  normal  0.600796 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0445  hypothetical protein  40.84 
 
 		 366 aa  238  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.171296  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1560  hypothetical protein  38.06 
 
 		 363 aa  229  6e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0334  hypothetical protein  38.55 
 
 		 364 aa  225  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2635  hypothetical protein  38.36 
 
 		 360 aa  220  3e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2110  hypothetical protein  37.5 
 
 		 365 aa  220  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.918881  normal  0.143816 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3642  hypothetical protein  38.74 
 
 		 367 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.448974  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5759  hypothetical protein  37.05 
 
 		 369 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2803  hypothetical protein  39.83 
 
 		 362 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.267131  normal  0.769228 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1414  hypothetical protein  36.03 
 
 		 361 aa  205  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0519713 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0219  hypothetical protein  35.91 
 
 		 383 aa  205  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1920  hypothetical protein  35.01 
 
 		 360 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0771  hypothetical protein  37.98 
 
 		 367 aa  203  4e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.626478  normal  0.832658 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3045  hypothetical protein  37.81 
 
 		 360 aa  196  6e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4854  hypothetical protein  34.24 
 
 		 369 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.434428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0223  hypothetical protein  33.16 
 
 		 385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2975  hypothetical protein  33.89 
 
 		 376 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23667  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1092  hypothetical protein  32.08 
 
 		 391 aa  148  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0342  hypothetical protein  27.62 
 
 		 362 aa  125  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1873  hypothetical protein  27.22 
 
 		 358 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.772578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0530  hypothetical protein  26.42 
 
 		 361 aa  113  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.443571 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1892  hypothetical protein  21.74 
 
 		 364 aa  94  4e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2432  hypothetical protein  25.4 
 
 		 426 aa  91.3  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>