25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0219 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0219  hypothetical protein  100 
 
 		 383 aa  782    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0454  hypothetical protein  53.09 
 
 		 366 aa  365  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.839309  normal  0.600796 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0445  hypothetical protein  53.75 
 
 		 366 aa  360  2e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.171296  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2110  hypothetical protein  49.72 
 
 		 365 aa  359  5e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.918881  normal  0.143816 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0334  hypothetical protein  49.16 
 
 		 364 aa  353  2.9999999999999997e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0771  hypothetical protein  53.91 
 
 		 367 aa  345  6e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.626478  normal  0.832658 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3642  hypothetical protein  49.01 
 
 		 367 aa  337  1.9999999999999998e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.448974  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5759  hypothetical protein  48.02 
 
 		 369 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4854  hypothetical protein  48.7 
 
 		 369 aa  319  3.9999999999999996e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.434428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1414  hypothetical protein  46.46 
 
 		 361 aa  300  4e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0519713 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1920  hypothetical protein  44.96 
 
 		 360 aa  296  4e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2635  hypothetical protein  45.77 
 
 		 360 aa  288  8e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1560  hypothetical protein  42.2 
 
 		 363 aa  274  1.0000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2803  hypothetical protein  44.93 
 
 		 362 aa  271  2e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.267131  normal  0.769228 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3045  hypothetical protein  44.9 
 
 		 360 aa  263  4e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0223  hypothetical protein  39.67 
 
 		 385 aa  228  1e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1584  hypothetical protein  35.91 
 
 		 366 aa  202  9e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2975  hypothetical protein  35.38 
 
 		 376 aa  196  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23667  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4763  hypothetical protein  34.84 
 
 		 368 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0626394 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1092  hypothetical protein  33.33 
 
 		 391 aa  166  9e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0342  hypothetical protein  31.46 
 
 		 362 aa  164  2.0000000000000002e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0530  hypothetical protein  30.83 
 
 		 361 aa  158  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.443571 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1873  hypothetical protein  31.58 
 
 		 358 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.772578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2432  hypothetical protein  25.69 
 
 		 426 aa  100  6e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1892  hypothetical protein  24.1 
 
 		 364 aa  100  6e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>