29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2975 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2975  hypothetical protein  100 
 
 		 376 aa  775    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23667  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1092  hypothetical protein  37.3 
 
 		 391 aa  233  5e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1560  hypothetical protein  36.09 
 
 		 363 aa  214  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0454  hypothetical protein  37.5 
 
 		 366 aa  202  9e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.839309  normal  0.600796 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2110  hypothetical protein  34.51 
 
 		 365 aa  200  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.918881  normal  0.143816 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0219  hypothetical protein  35.38 
 
 		 383 aa  196  6e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2635  hypothetical protein  36.39 
 
 		 360 aa  196  7e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0445  hypothetical protein  37.43 
 
 		 366 aa  195  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.171296  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0334  hypothetical protein  35.14 
 
 		 364 aa  193  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1920  hypothetical protein  34.44 
 
 		 360 aa  187  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1414  hypothetical protein  35.1 
 
 		 361 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0519713 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3642  hypothetical protein  34.54 
 
 		 367 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.448974  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4854  hypothetical protein  32.89 
 
 		 369 aa  180  4e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.434428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1584  hypothetical protein  33.7 
 
 		 366 aa  176  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0223  hypothetical protein  35 
 
 		 385 aa  175  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2803  hypothetical protein  35.98 
 
 		 362 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.267131  normal  0.769228 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4763  hypothetical protein  34.81 
 
 		 368 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0626394 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5759  hypothetical protein  32.88 
 
 		 369 aa  172  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3045  hypothetical protein  35 
 
 		 360 aa  169  9e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0771  hypothetical protein  33.8 
 
 		 367 aa  162  7e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.626478  normal  0.832658 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1873  hypothetical protein  30.11 
 
 		 358 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.772578  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0342  hypothetical protein  32.77 
 
 		 362 aa  137  4e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0530  hypothetical protein  26.74 
 
 		 361 aa  127  5e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.443571 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2432  hypothetical protein  25.5 
 
 		 426 aa  89  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1892  hypothetical protein  22.04 
 
 		 364 aa  81.6  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0774  zinc carboxypeptidase-related protein  32.38 
 
 		 340 aa  44.7  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3295  putative carboxypeptidase  33.33 
 
 		 365 aa  43.9  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.265399 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3979  peptidase M14, carboxypeptidase A  32.26 
 
 		 500 aa  43.5  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.946753 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3329  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.51 
 
 		 453 aa  42.7  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>