25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0342 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0342  hypothetical protein  100 
 
 
362 aa  748    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1873  hypothetical protein  48 
 
 
358 aa  332  6e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.772578  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0530  hypothetical protein  35.03 
 
 
361 aa  205  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.443571 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0219  hypothetical protein  31.46 
 
 
383 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1560  hypothetical protein  30.34 
 
 
363 aa  159  7e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0334  hypothetical protein  34.52 
 
 
364 aa  159  8e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4854  hypothetical protein  32.59 
 
 
369 aa  157  4e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.434428  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5759  hypothetical protein  30.83 
 
 
369 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4763  hypothetical protein  31.55 
 
 
368 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0626394 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0454  hypothetical protein  33.42 
 
 
366 aa  145  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.839309  normal  0.600796 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2110  hypothetical protein  30.3 
 
 
365 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.918881  normal  0.143816 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2635  hypothetical protein  30.41 
 
 
360 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0445  hypothetical protein  33.63 
 
 
366 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.171296  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3642  hypothetical protein  29.01 
 
 
367 aa  139  7e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.448974  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2975  hypothetical protein  32.77 
 
 
376 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23667  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0223  hypothetical protein  30.7 
 
 
385 aa  135  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3045  hypothetical protein  31.71 
 
 
360 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0771  hypothetical protein  30.54 
 
 
367 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.626478  normal  0.832658 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1920  hypothetical protein  27.61 
 
 
360 aa  122  9e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1584  hypothetical protein  27.35 
 
 
366 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1892  hypothetical protein  25.07 
 
 
364 aa  119  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2432  hypothetical protein  27.32 
 
 
426 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1414  hypothetical protein  30.06 
 
 
361 aa  117  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0519713 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2803  hypothetical protein  29.92 
 
 
362 aa  116  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.267131  normal  0.769228 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1092  hypothetical protein  28.53 
 
 
391 aa  105  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>