25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1920 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1920  hypothetical protein  100 
 
 		 360 aa  737    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1414  hypothetical protein  71.71 
 
 		 361 aa  535  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0519713 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2110  hypothetical protein  49.58 
 
 		 365 aa  345  5e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.918881  normal  0.143816 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0334  hypothetical protein  51.11 
 
 		 364 aa  344  1e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3642  hypothetical protein  48.15 
 
 		 367 aa  335  7e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.448974  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0771  hypothetical protein  52.54 
 
 		 367 aa  330  2e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.626478  normal  0.832658 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2635  hypothetical protein  46.65 
 
 		 360 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4854  hypothetical protein  45.89 
 
 		 369 aa  312  3.9999999999999997e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.434428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0454  hypothetical protein  47.49 
 
 		 366 aa  311  1e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.839309  normal  0.600796 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0445  hypothetical protein  48.14 
 
 		 366 aa  301  2e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.171296  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0219  hypothetical protein  44.96 
 
 		 383 aa  296  4e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3045  hypothetical protein  46.65 
 
 		 360 aa  286  4e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2803  hypothetical protein  43.79 
 
 		 362 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.267131  normal  0.769228 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5759  hypothetical protein  44.83 
 
 		 369 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1560  hypothetical protein  42.58 
 
 		 363 aa  244  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0223  hypothetical protein  39.83 
 
 		 385 aa  223  4.9999999999999996e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1584  hypothetical protein  35.01 
 
 		 366 aa  202  6e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4763  hypothetical protein  35.28 
 
 		 368 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0626394 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2975  hypothetical protein  34.44 
 
 		 376 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23667  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0530  hypothetical protein  32.6 
 
 		 361 aa  166  8e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.443571 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1873  hypothetical protein  32.88 
 
 		 358 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.772578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1092  hypothetical protein  36.36 
 
 		 391 aa  141  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0342  hypothetical protein  27.61 
 
 		 362 aa  122  9e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1892  hypothetical protein  27.39 
 
 		 364 aa  101  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2432  hypothetical protein  25.15 
 
 		 426 aa  99.8  6e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>