25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0454 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0445  hypothetical protein  97.81 
 
 		 366 aa  676    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.171296  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0454  hypothetical protein  100 
 
 		 366 aa  741    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.839309  normal  0.600796 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2110  hypothetical protein  64.74 
 
 		 365 aa  494  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.918881  normal  0.143816 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0334  hypothetical protein  64.56 
 
 		 364 aa  472  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0771  hypothetical protein  64.84 
 
 		 367 aa  432  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.626478  normal  0.832658 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0219  hypothetical protein  53.09 
 
 		 383 aa  376  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4854  hypothetical protein  51.81 
 
 		 369 aa  369  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.434428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3642  hypothetical protein  48.61 
 
 		 367 aa  347  1e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.448974  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5759  hypothetical protein  49.44 
 
 		 369 aa  343  2e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1414  hypothetical protein  49.72 
 
 		 361 aa  330  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0519713 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2635  hypothetical protein  48.87 
 
 		 360 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1920  hypothetical protein  47.49 
 
 		 360 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2803  hypothetical protein  49.58 
 
 		 362 aa  312  4.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.267131  normal  0.769228 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3045  hypothetical protein  48.02 
 
 		 360 aa  302  5.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1560  hypothetical protein  43.02 
 
 		 363 aa  270  4e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1584  hypothetical protein  40.78 
 
 		 366 aa  243  5e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4763  hypothetical protein  38.68 
 
 		 368 aa  219  5e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0626394 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2975  hypothetical protein  37.5 
 
 		 376 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23667  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0223  hypothetical protein  38.29 
 
 		 385 aa  202  5e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1092  hypothetical protein  34.05 
 
 		 391 aa  174  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1873  hypothetical protein  32.68 
 
 		 358 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.772578  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0342  hypothetical protein  33.42 
 
 		 362 aa  150  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0530  hypothetical protein  28.09 
 
 		 361 aa  146  6e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.443571 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1892  hypothetical protein  22.4 
 
 		 364 aa  107  4e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2432  hypothetical protein  23.51 
 
 		 426 aa  92.8  9e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>