30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1873 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1873  hypothetical protein  100 
 
 
358 aa  738    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.772578  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0342  hypothetical protein  48 
 
 
362 aa  332  6e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0530  hypothetical protein  39.22 
 
 
361 aa  242  7.999999999999999e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.443571 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0334  hypothetical protein  33.43 
 
 
364 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2635  hypothetical protein  35.02 
 
 
360 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1920  hypothetical protein  32.88 
 
 
360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1560  hypothetical protein  31.84 
 
 
363 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3642  hypothetical protein  31.73 
 
 
367 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.448974  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4763  hypothetical protein  33.82 
 
 
368 aa  159  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0626394 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2803  hypothetical protein  33.71 
 
 
362 aa  154  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.267131  normal  0.769228 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1414  hypothetical protein  31.46 
 
 
361 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0519713 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4854  hypothetical protein  30.35 
 
 
369 aa  150  4e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.434428  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0219  hypothetical protein  31.58 
 
 
383 aa  150  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2110  hypothetical protein  28.85 
 
 
365 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.918881  normal  0.143816 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0454  hypothetical protein  32.68 
 
 
366 aa  145  8.000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.839309  normal  0.600796 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2975  hypothetical protein  30.11 
 
 
376 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23667  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5759  hypothetical protein  31.25 
 
 
369 aa  144  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0445  hypothetical protein  33.12 
 
 
366 aa  143  5e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.171296  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3045  hypothetical protein  33.44 
 
 
360 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2432  hypothetical protein  27.45 
 
 
426 aa  139  6e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0223  hypothetical protein  31.11 
 
 
385 aa  137  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0771  hypothetical protein  30.43 
 
 
367 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.626478  normal  0.832658 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1584  hypothetical protein  27.22 
 
 
366 aa  120  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1092  hypothetical protein  27.05 
 
 
391 aa  111  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1892  hypothetical protein  28.06 
 
 
364 aa  110  4.0000000000000004e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0774  zinc carboxypeptidase-related protein  31.52 
 
 
340 aa  45.4  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1467  zinc carboxypeptidase-related protein  32.53 
 
 
301 aa  44.3  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3295  putative carboxypeptidase  27.91 
 
 
365 aa  44.3  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.265399 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2307  hypothetical protein  35.06 
 
 
306 aa  43.9  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.112792  normal  0.0871647 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3019  zinc carboxypeptidase-related protein  32.04 
 
 
340 aa  43.1  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.266904  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>