31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3019 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3019  zinc carboxypeptidase-related protein  100 
 
 		 340 aa  696    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.266904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0774  zinc carboxypeptidase-related protein  73.75 
 
 		 340 aa  522  1e-147  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2718  zinc carboxypeptidase-related protein  60.54 
 
 		 342 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.792819  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1975  Zinc carboxypeptidase-related protein  60.54 
 
 		 342 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2643  zinc carboxypeptidase-related protein  60.54 
 
 		 342 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1742  zinc carboxypeptidase-related protein  60.54 
 
 		 342 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.212306  hitchhiker  0.00119795 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2604  zinc carboxypeptidase-related protein  60.24 
 
 		 342 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2472  oxoglutarate dehydrogenase (succinyl-transferring)  61.14 
 
 		 341 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.319923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2282  zinc carboxypeptidase-related protein  59.94 
 
 		 346 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.548754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2354  zinc carboxypeptidase-related protein  60.54 
 
 		 341 aa  396  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.07586  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3295  putative carboxypeptidase  45.25 
 
 		 365 aa  287  2e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.265399 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3538  hypothetical protein  49.35 
 
 		 355 aa  286  4e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2903  hypothetical protein  47.37 
 
 		 337 aa  278  1e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0051  putative carboxypeptidase  46.71 
 
 		 365 aa  275  9e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.103758  normal  0.203157 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4624  peptidase M14 carboxypeptidase A  43.28 
 
 		 344 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.144195 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4525  zinc carboxypeptidase-related protein  45.42 
 
 		 344 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.988976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0840  zinc carboxypeptidase-related protein  45.75 
 
 		 344 aa  273  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.387339  normal  0.0855585 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2025  putative carboxypeptidase  49.04 
 
 		 373 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4289  hypothetical protein  43.37 
 
 		 340 aa  266  5.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4190  putative metalloproteinase (zinc carboxypeptidase-related protein)  46.33 
 
 		 343 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1285  hypothetical protein  44.44 
 
 		 356 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3437  hypothetical protein  42.95 
 
 		 365 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0368  zinc-binding domain-containing protein  45 
 
 		 363 aa  237  2e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.499164  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  24.14 
 
 		 821 aa  50.8  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2457  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.59 
 
 		 889 aa  46.6  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0889296  normal  0.334441 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3555  hypothetical protein  38.57 
 
 		 274 aa  45.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2526  hypothetical protein  34.57 
 
 		 274 aa  45.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.294176  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2307  hypothetical protein  25.95 
 
 		 306 aa  43.5  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.112792  normal  0.0871647 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1433  zinc carboxypeptidase-related protein  25 
 
 		 320 aa  43.5  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1751  peptidase M14, carboxypeptidase A  24 
 
 		 304 aa  43.1  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1873  hypothetical protein  32.04 
 
 		 358 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.772578  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>