25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1092 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1092  hypothetical protein  100 
 
 		 391 aa  808    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2975  hypothetical protein  37.3 
 
 		 376 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23667  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1560  hypothetical protein  40.35 
 
 		 363 aa  221  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5759  hypothetical protein  35.83 
 
 		 369 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2635  hypothetical protein  40.2 
 
 		 360 aa  177  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0334  hypothetical protein  39.14 
 
 		 364 aa  176  7e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3642  hypothetical protein  40.6 
 
 		 367 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.448974  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2110  hypothetical protein  38.08 
 
 		 365 aa  170  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.918881  normal  0.143816 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0454  hypothetical protein  34.05 
 
 		 366 aa  169  5e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.839309  normal  0.600796 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0445  hypothetical protein  34.33 
 
 		 366 aa  169  1e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.171296  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4854  hypothetical protein  34.38 
 
 		 369 aa  168  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.434428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0219  hypothetical protein  33.33 
 
 		 383 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4763  hypothetical protein  38.52 
 
 		 368 aa  164  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0626394 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0223  hypothetical protein  31.08 
 
 		 385 aa  160  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2803  hypothetical protein  33.61 
 
 		 362 aa  155  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.267131  normal  0.769228 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1584  hypothetical protein  32.35 
 
 		 366 aa  152  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1414  hypothetical protein  42.8 
 
 		 361 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0519713 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1920  hypothetical protein  36.6 
 
 		 360 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0771  hypothetical protein  36.06 
 
 		 367 aa  146  8.000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.626478  normal  0.832658 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3045  hypothetical protein  40 
 
 		 360 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0530  hypothetical protein  25.77 
 
 		 361 aa  129  8.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.443571 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1873  hypothetical protein  27.05 
 
 		 358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.772578  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0342  hypothetical protein  28.53 
 
 		 362 aa  107  5e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1892  hypothetical protein  25.28 
 
 		 364 aa  75.9  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2432  hypothetical protein  29.53 
 
 		 426 aa  73.9  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>