25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0771 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0771  hypothetical protein  100 
 
 
367 aa  735    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.626478  normal  0.832658 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2110  hypothetical protein  67.03 
 
 
365 aa  518  1e-146  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.918881  normal  0.143816 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0334  hypothetical protein  66.21 
 
 
364 aa  490  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0454  hypothetical protein  64.84 
 
 
366 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.839309  normal  0.600796 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0445  hypothetical protein  65.76 
 
 
366 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.171296  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4854  hypothetical protein  54.02 
 
 
369 aa  388  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.434428  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0219  hypothetical protein  53.91 
 
 
383 aa  372  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3642  hypothetical protein  54.06 
 
 
367 aa  362  6e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.448974  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1920  hypothetical protein  52.54 
 
 
360 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1414  hypothetical protein  51.84 
 
 
361 aa  347  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0519713 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5759  hypothetical protein  49.16 
 
 
369 aa  329  5.0000000000000004e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2635  hypothetical protein  46.8 
 
 
360 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2803  hypothetical protein  47.78 
 
 
362 aa  293  5e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.267131  normal  0.769228 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3045  hypothetical protein  46.24 
 
 
360 aa  280  2e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1560  hypothetical protein  40.55 
 
 
363 aa  244  9.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1584  hypothetical protein  37.91 
 
 
366 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0223  hypothetical protein  37.26 
 
 
385 aa  209  7e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4763  hypothetical protein  36.21 
 
 
368 aa  188  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0626394 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2975  hypothetical protein  33.8 
 
 
376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23667  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1092  hypothetical protein  36.06 
 
 
391 aa  157  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1873  hypothetical protein  30.43 
 
 
358 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.772578  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0342  hypothetical protein  30.81 
 
 
362 aa  131  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0530  hypothetical protein  26.8 
 
 
361 aa  127  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.443571 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2432  hypothetical protein  23.65 
 
 
426 aa  99.8  7e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1892  hypothetical protein  21.73 
 
 
364 aa  76.6  0.0000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>