31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1892 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1892  hypothetical protein  100 
 
 
364 aa  742    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2432  hypothetical protein  34.22 
 
 
426 aa  216  4e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0530  hypothetical protein  29.77 
 
 
361 aa  127  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.443571 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0342  hypothetical protein  25.07 
 
 
362 aa  119  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2635  hypothetical protein  25.54 
 
 
360 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1873  hypothetical protein  28.06 
 
 
358 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.772578  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0445  hypothetical protein  22.51 
 
 
366 aa  110  5e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.171296  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1560  hypothetical protein  24.37 
 
 
363 aa  108  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0454  hypothetical protein  22.19 
 
 
366 aa  107  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.839309  normal  0.600796 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3045  hypothetical protein  26.4 
 
 
360 aa  105  8e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1920  hypothetical protein  27.39 
 
 
360 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3642  hypothetical protein  24.93 
 
 
367 aa  100  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.448974  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0219  hypothetical protein  24.1 
 
 
383 aa  100  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0334  hypothetical protein  22.46 
 
 
364 aa  99  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2110  hypothetical protein  22.29 
 
 
365 aa  94.4  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.918881  normal  0.143816 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2803  hypothetical protein  23.01 
 
 
362 aa  94  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.267131  normal  0.769228 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5759  hypothetical protein  23.08 
 
 
369 aa  92.8  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4854  hypothetical protein  25.1 
 
 
369 aa  92.4  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.434428  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1584  hypothetical protein  21.74 
 
 
366 aa  89.4  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1414  hypothetical protein  29.14 
 
 
361 aa  87.8  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0519713 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4763  hypothetical protein  25.49 
 
 
368 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0626394 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2975  hypothetical protein  22.04 
 
 
376 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23667  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1092  hypothetical protein  25.28 
 
 
391 aa  75.9  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0223  hypothetical protein  25.76 
 
 
385 aa  73.6  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0771  hypothetical protein  26.26 
 
 
367 aa  67  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.626478  normal  0.832658 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2903  hypothetical protein  21.12 
 
 
337 aa  56.2  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3538  hypothetical protein  21.48 
 
 
355 aa  49.7  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3295  putative carboxypeptidase  22.69 
 
 
365 aa  46.2  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.265399 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1204  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.84 
 
 
262 aa  45.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.670707  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2718  zinc carboxypeptidase-related protein  20.81 
 
 
342 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.792819  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2643  zinc carboxypeptidase-related protein  20.81 
 
 
342 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>