27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2432 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2432  hypothetical protein  100 
 
 
426 aa  877    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1892  hypothetical protein  34.22 
 
 
364 aa  220  3.9999999999999997e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1873  hypothetical protein  27.72 
 
 
358 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.772578  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4854  hypothetical protein  26.77 
 
 
369 aa  124  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.434428  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0342  hypothetical protein  27.32 
 
 
362 aa  123  5e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0334  hypothetical protein  27.94 
 
 
364 aa  114  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2635  hypothetical protein  28.22 
 
 
360 aa  113  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2110  hypothetical protein  27.88 
 
 
365 aa  109  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.918881  normal  0.143816 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5759  hypothetical protein  25.72 
 
 
369 aa  107  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1414  hypothetical protein  25.6 
 
 
361 aa  106  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0519713 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1920  hypothetical protein  25.46 
 
 
360 aa  103  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4763  hypothetical protein  24.51 
 
 
368 aa  103  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0626394 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0219  hypothetical protein  26.24 
 
 
383 aa  101  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0530  hypothetical protein  28.45 
 
 
361 aa  102  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.443571 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2803  hypothetical protein  27.22 
 
 
362 aa  96.3  9e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.267131  normal  0.769228 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3045  hypothetical protein  28.25 
 
 
360 aa  95.1  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2975  hypothetical protein  25.71 
 
 
376 aa  94.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23667  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0771  hypothetical protein  24.42 
 
 
367 aa  94  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.626478  normal  0.832658 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0454  hypothetical protein  24.23 
 
 
366 aa  91.7  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.839309  normal  0.600796 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0445  hypothetical protein  24.23 
 
 
366 aa  91.7  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.171296  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3642  hypothetical protein  25.76 
 
 
367 aa  90.5  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.448974  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1584  hypothetical protein  24.93 
 
 
366 aa  89.4  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0223  hypothetical protein  23.61 
 
 
385 aa  88.2  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1560  hypothetical protein  23.33 
 
 
363 aa  85.9  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1092  hypothetical protein  29.53 
 
 
391 aa  74.3  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0782  hypothetical protein  38.71 
 
 
514 aa  45.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.84486  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1204  peptidase M14, carboxypeptidase A  33.33 
 
 
262 aa  43.9  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.670707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>