25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1560 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1560  hypothetical protein  100 
 
 		 363 aa  752    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0219  hypothetical protein  42.2 
 
 		 383 aa  279  7e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5759  hypothetical protein  42.09 
 
 		 369 aa  273  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2635  hypothetical protein  44.09 
 
 		 360 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0454  hypothetical protein  43.02 
 
 		 366 aa  268  1e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.839309  normal  0.600796 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3642  hypothetical protein  41.99 
 
 		 367 aa  264  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.448974  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0445  hypothetical protein  43.5 
 
 		 366 aa  262  8.999999999999999e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.171296  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2110  hypothetical protein  40.6 
 
 		 365 aa  259  7e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.918881  normal  0.143816 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1920  hypothetical protein  42.58 
 
 		 360 aa  255  8e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0334  hypothetical protein  39.5 
 
 		 364 aa  253  5.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1414  hypothetical protein  42.62 
 
 		 361 aa  252  6e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0519713 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4854  hypothetical protein  41.03 
 
 		 369 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.434428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3045  hypothetical protein  42.3 
 
 		 360 aa  243  3e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0223  hypothetical protein  40.06 
 
 		 385 aa  243  5e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2803  hypothetical protein  41.79 
 
 		 362 aa  238  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.267131  normal  0.769228 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1584  hypothetical protein  38.06 
 
 		 366 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0771  hypothetical protein  40.27 
 
 		 367 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.626478  normal  0.832658 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4763  hypothetical protein  37.75 
 
 		 368 aa  233  5e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0626394 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1092  hypothetical protein  40.35 
 
 		 391 aa  224  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2975  hypothetical protein  36.09 
 
 		 376 aa  222  8e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23667  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1873  hypothetical protein  31.84 
 
 		 358 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.772578  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0342  hypothetical protein  30.34 
 
 		 362 aa  164  3e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0530  hypothetical protein  31.91 
 
 		 361 aa  156  6e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.443571 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1892  hypothetical protein  24.37 
 
 		 364 aa  108  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2432  hypothetical protein  21.92 
 
 		 426 aa  87.4  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>