25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3642 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3642  hypothetical protein  100 
 
 		 367 aa  752    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.448974  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2635  hypothetical protein  53.71 
 
 		 360 aa  364  1e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2110  hypothetical protein  50.28 
 
 		 365 aa  363  2e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.918881  normal  0.143816 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0334  hypothetical protein  50.28 
 
 		 364 aa  353  2e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0771  hypothetical protein  54.06 
 
 		 367 aa  345  6e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.626478  normal  0.832658 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0219  hypothetical protein  49.01 
 
 		 383 aa  341  1e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0454  hypothetical protein  48.61 
 
 		 366 aa  341  1e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.839309  normal  0.600796 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1920  hypothetical protein  48.15 
 
 		 360 aa  338  8e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0445  hypothetical protein  49.39 
 
 		 366 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.171296  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1414  hypothetical protein  49.14 
 
 		 361 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0519713 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3045  hypothetical protein  53.71 
 
 		 360 aa  333  2e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2803  hypothetical protein  51.44 
 
 		 362 aa  330  3e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.267131  normal  0.769228 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5759  hypothetical protein  47.32 
 
 		 369 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4854  hypothetical protein  44.69 
 
 		 369 aa  306  5.0000000000000004e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.434428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1560  hypothetical protein  41.99 
 
 		 363 aa  263  4e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1584  hypothetical protein  38.74 
 
 		 366 aa  218  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4763  hypothetical protein  37.15 
 
 		 368 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0626394 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0223  hypothetical protein  37.29 
 
 		 385 aa  197  3e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2975  hypothetical protein  34.54 
 
 		 376 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23667  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1092  hypothetical protein  41.48 
 
 		 391 aa  174  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1873  hypothetical protein  32.56 
 
 		 358 aa  162  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.772578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0530  hypothetical protein  29.75 
 
 		 361 aa  147  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.443571 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0342  hypothetical protein  29.01 
 
 		 362 aa  140  3.9999999999999997e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1892  hypothetical protein  24.78 
 
 		 364 aa  104  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2432  hypothetical protein  26.09 
 
 		 426 aa  91.7  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>