25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0223 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0223  hypothetical protein  100 
 
 		 385 aa  793    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1560  hypothetical protein  40.06 
 
 		 363 aa  236  5.0000000000000005e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0219  hypothetical protein  39.67 
 
 		 383 aa  228  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1920  hypothetical protein  39.83 
 
 		 360 aa  223  6e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0334  hypothetical protein  36.03 
 
 		 364 aa  203  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2110  hypothetical protein  36.26 
 
 		 365 aa  202  8e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.918881  normal  0.143816 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0454  hypothetical protein  38.29 
 
 		 366 aa  200  3e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.839309  normal  0.600796 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0771  hypothetical protein  36.99 
 
 		 367 aa  196  7e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.626478  normal  0.832658 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0445  hypothetical protein  38.51 
 
 		 366 aa  194  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.171296  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5759  hypothetical protein  35.81 
 
 		 369 aa  194  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1414  hypothetical protein  37.06 
 
 		 361 aa  193  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0519713 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3642  hypothetical protein  37.29 
 
 		 367 aa  192  9e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.448974  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4763  hypothetical protein  36.54 
 
 		 368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0626394 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1584  hypothetical protein  33.16 
 
 		 366 aa  182  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2635  hypothetical protein  36.64 
 
 		 360 aa  182  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2975  hypothetical protein  35 
 
 		 376 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23667  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2803  hypothetical protein  37.36 
 
 		 362 aa  171  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.267131  normal  0.769228 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4854  hypothetical protein  35.47 
 
 		 369 aa  170  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.434428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3045  hypothetical protein  36.71 
 
 		 360 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1092  hypothetical protein  31.27 
 
 		 391 aa  154  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1873  hypothetical protein  31.11 
 
 		 358 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.772578  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0342  hypothetical protein  30.7 
 
 		 362 aa  135  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0530  hypothetical protein  26.09 
 
 		 361 aa  119  7e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.443571 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2432  hypothetical protein  28.02 
 
 		 426 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1892  hypothetical protein  25.76 
 
 		 364 aa  73.6  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>